Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  493  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
152633451--152633519
28
2.3
30
87
7
97
14
4
36
44
1.65
152633744--152633797
29
1.9
27
92
7
90
20
3
25
50
1.65
152633745--152633824
28
2.9
28
83
9
83
22
6
26
45
1.76
152633831--152633876
24
2.0
24
86
4
67
8
6
34
50
1.59
152635953--152636011
32
1.9
29
83
10
73
47
3
20
28
1.66
152639473--152639541
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
152645798--152645835
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
152647464--152647532
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
152653882--152653979
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
152656808--152656838
15
2.1
15
100
0
62
32
0
12
54
1.38
152658462--152658491
14
2.1
14
93
0
51
40
0
16
43
1.48
152661266--152661395
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
152677038--152677203
40
4.2
40
92
2
255
27
27
21
22
1.99
152679323--152679456
29
4.7
29
85
7
157
24
31
15
28
1.96
152679347--152679454
28
3.8
28
89
4
146
25
29
14
30
1.95
152679327--152679455
57
2.3
57
84
2
170
24
31
15
28
1.95
152686243--152686276
17
2.1
17
88
5
52
29
17
0
52
1.45
152689682--152689948
24
11.1
24
97
0
471
36
25
17
20
1.95
152696607--152696736
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
152696607--152696770
40
4.1
40
78
4
145
21
28
25
25
1.99
152699413--152699472
30
2.0
30
100
0
120
36
6
30
26
1.82
152710423--152710470
25
1.9
25
83
8
62
52
0
2
45
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
152710374--152710521
74
2.0
74
85
2
199
50
2
2
43
1.30
152710376--152710525
68
2.1
72
81
9
175
51
2
2
43
1.30
152710543--152710581
20
2.0
20
94
0
69
46
15
5
33
1.68
152710865--152710904
13
3.1
13
96
0
71
30
20
7
42
1.79
152715872--152715932
27
2.1
27
82
8
68
45
1
21
31
1.61
152716491--152716578
22
3.9
22
78
15
83
23
23
18
34
1.96
152716443--152716584
45
3.0
44
79
16
137
26
21
17
34
1.96
152719506--152719677
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
152719498--152719673
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
152722057--152722145
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
152722057--152722136
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
152722068--152722145
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
152725096--152725267
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
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46
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Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
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Score
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Period
Size
Copy
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Copy
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Period
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Copy
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6
47
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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