Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  63  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18260256--18260320
28
2.3
28
91
0
103
30
9
27
32
1.88
18273167--18273334
40
4.2
40
85
5
198
26
27
22
23
1.99
18273167--18273334
80
2.1
80
86
4
232
26
27
22
23
1.99
18279319--18279403
43
2.0
43
81
9
102
29
28
17
24
1.97
18294234--18294412
40
4.5
40
91
0
286
17
18
30
32
1.95
18295650--18295703
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
18307896--18307948
26
2.0
26
100
0
106
37
18
11
32
1.87
18311875--18311951
27
2.9
27
80
3
93
35
23
10
31
1.88
18311940--18312041
27
3.8
27
86
2
125
29
23
6
40
1.80
18311929--18312052
54
2.3
54
76
5
135
33
25
6
35
1.81
18312037--18312160
27
4.6
27
85
2
169
41
20
7
30
1.79
18312021--18312160
54
2.6
53
85
6
138
40
21
7
30
1.80
18312143--18312204
27
2.3
27
91
0
97
40
16
16
27
1.89
18312037--18312187
54
2.8
54
85
4
162
41
19
9
29
1.83
18312037--18312189
81
1.9
81
86
5
220
40
19
9
30
1.83
18315529--18315623
29
3.3
29
91
1
147
29
31
14
24
1.95
18323972--18324023
26
2.0
27
92
3
88
25
36
23
15
1.93
18329523--18329690
46
3.6
46
76
4
185
29
28
20
21
1.98
18329522--18329693
93
1.8
93
92
0
290
29
29
20
21
1.98
18329515--18329701
46
4.1
45
72
15
141
29
29
19
21
1.97
18333024--18333124
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
18339685--18339732
24
2.0
24
83
0
60
45
4
33
16
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18340567--18340626
30
2.0
30
90
0
93
21
3
38
36
1.70
18341373--18341473
26
3.9
26
85
0
121
18
20
21
38
1.93
18347526--18347582
25
2.3
24
76
5
69
40
5
36
17
1.72
18349035--18349088
27
2.0
27
85
7
74
31
18
18
31
1.95
18349251--18349300
26
1.9
26
87
0
73
20
18
24
38
1.93
18351551--18351671
37
3.3
37
95
2
217
21
33
19
25
1.96
18351773--18352035
49
5.4
49
96
0
456
29
32
9
28
1.88
18351773--18352035
97
2.7
98
93
0
456
29
32
9
28
1.88
18354756--18354854
41
2.4
41
80
11
114
25
24
24
26
2.00
18355338--18355586
29
8.7
29
95
1
448
25
32
16
26
1.96
18355338--18355589
57
4.4
58
94
3
438
25
31
16
26
1.96
18355338--18355586
86
2.9
86
95
1
446
25
32
16
26
1.96
18357682--18357803
37
3.3
37
97
0
226
21
33
19
25
1.97
18357918--18357991
37
2.0
37
100
0
148
35
32
5
27
1.79
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18357955--18358202
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.86
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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A
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28
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5
40
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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