Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  80  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23634337--23634375
17
2.3
17
95
0
69
61
0
0
38
0.96
23638576--23638605
6
5.0
6
100
0
60
66
0
0
33
0.92
23638563--23638605
12
3.7
11
90
3
50
65
0
2
32
1.06
23641986--23642025
20
2.0
20
90
0
62
35
0
7
57
1.27
23642414--23642443
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
23646483--23646522
21
1.9
20
85
10
53
47
12
22
17
1.81
23653542--23653697
54
3.0
53
89
5
237
46
17
21
13
1.83
23654817--23655514
176
4.0
175
86
3
875
31
16
23
28
1.96
23655085--23655180
43
2.2
45
85
7
135
29
13
26
31
1.94
23662222--23662348
36
3.6
36
74
6
114
29
17
18
34
1.94
23662213--23662346
71
1.9
71
81
3
162
29
17
18
34
1.94
23664949--23665055
26
4.2
26
91
2
180
36
24
6
32
1.81
23664949--23665055
51
2.1
52
94
1
189
36
24
6
32
1.81
23667137--23667338
40
5.1
40
91
2
302
26
27
22
23
2.00
23670592--23670627
17
2.1
17
100
0
72
19
19
0
61
1.35
23671356--23671400
20
2.2
20
88
0
63
48
2
13
35
1.54
23672840--23672925
43
2.0
43
90
0
136
23
18
29
29
1.98
23673837--23674281
239
1.9
238
95
1
811
31
13
19
36
1.90
23688782--23689107
164
2.0
163
90
3
512
48
11
12
26
1.75
23690937--23690965
10
2.7
11
89
10
51
48
17
0
34
1.47
23693078--23693136
26
2.2
27
79
8
68
30
27
20
22
1.98
23700886--23700955
29
2.4
29
88
2
97
34
22
24
18
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23702689--23702733
21
2.0
22
83
8
56
71
0
15
13
1.15
23702973--23702997
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
23703869--23703938
27
2.5
28
88
2
106
27
12
27
32
1.93
23705448--23705518
24
3.0
24
91
0
115
26
36
1
35
1.66
23711812--23711872
29
2.1
29
81
6
70
40
18
21
19
1.91
23711821--23711892
29
2.5
29
86
2
92
34
20
25
19
1.96
23711937--23712007
24
3.0
24
87
8
108
25
36
1
36
1.65
23724213--23724315
29
3.6
29
80
2
100
24
33
18
23
1.96
23733579--23733670
27
3.4
27
81
11
116
26
19
10
43
1.84
23733755--23733863
45
2.4
45
79
0
119
22
19
11
45
1.83
23739581--23739648
15
4.6
15
77
3
75
11
16
13
58
1.62
23739572--23739648
29
2.6
30
85
4
102
11
15
15
57
1.66
23742041--23742216
46
3.8
45
81
10
212
21
21
29
28
1.98
23742037--23742208
93
1.8
93
94
0
308
20
21
30
27
1.98
23745005--23745129
27
4.7
27
79
4
101
35
20
20
24
1.96
23745136--23745226
27
3.4
27
84
0
110
30
15
17
36
1.91
23749932--23750115
40
4.6
40
84
6
239
25
23
26
24
2.00
23749932--23750115
80
2.3
80
88
3
264
25
23
26
24
2.00
23757945--23758158
40
5.4
40
86
6
246
24
22
26
25
2.00
23757947--23758158
78
2.7
78
83
9
247
25
22
26
25
2.00
23760237--23760349
27
4.2
27
77
6
113
37
23
21
18
1.94
23760367--23760460
27
3.5
27
85
2
127
30
14
19
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23760423--23760480
27
2.1
27
83
0
71
36
15
15
32
1.89
23771717--23771769
26
2.0
26
100
0
106
45
3
7
43
1.50
23775638--23775667
14
2.1
14
93
0
51
33
33
23
10
1.88
23777240--23777284
21
2.1
21
100
0
90
31
13
13
42
1.82
23777440--23777497
30
2.0
30
86
3
82
31
13
25
29
1.94
23777897--23778067
46
3.7
44
77
12
148
29
19
28
22
1.98
23777897--23778066
47
3.6
48
81
8
158
29
19
28
22
1.98
23778859--23778951
42
2.2
42
100
0
186
17
25
36
20
1.94
23779191--23779231
22
1.9
21
85
5
55
14
41
24
19
1.89
23781060--23781235
46
3.8
46
78
10
187
21
18
29
31
1.96
23781056--23781227
93
1.8
93
91
0
281
20
18
30
30
1.97
23784619--23784646
7
4.0
7
100
0
56
28
14
0
57
1.38
23784633--23784727
31
3.1
31
95
0
172
24
22
14
38
1.91
23784919--23785038
24
5.0
24
92
3
188
25
21
23
29
1.99
23785089--23785148
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
23785191--23785238
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
23786381--23786445
27
2.4
27
84
5
87
20
24
20
35
1.96
23786499--23786701
27
7.4
27
72
9
110
33
8
19
37
1.82
23786504--23786701
54
3.6
55
73
8
140
33
8
20
38
1.82
23786652--23786964
27
11.6
27
85
4
344
42
8
21
27
1.81
23786976--23787065
27
3.3
26
78
6
99
32
10
18
38
1.84
23786960--23787065
54
2.0
53
83
9
135
32
10
19
37
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23789446--23789473
7
4.0
7
100
0
56
28
14
0
57
1.38
23789460--23789553
31
3.1
31
95
3
172
23
22
14
39
1.91
23789745--23789864
24
5.0
24
90
3
170
26
22
22
28
1.99
23789915--23789974
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
23790017--23790064
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
23791210--23791274
27
2.4
27
84
5
87
20
24
20
35
1.96
23791328--23791493
27
6.1
27
72
6
102
32
9
18
40
1.81
23791333--23791583
27
9.3
27
77
10
100
36
9
18
35
1.83
23791490--23791799
81
3.8
81
86
3
383
42
8
21
26
1.81
23791480--23791792
27
11.6
27
84
3
317
43
8
20
27
1.81
23791796--23791894
27
3.7
27
79
5
103
31
10
19
39
1.85
23791788--23791894
54
2.0
54
83
7
137
31
10
20
37
1.86
23791804--23791909
27
3.9
27
74
9
74
34
9
17
37
1.83
23792978--23793033
15
3.7
15
83
7
78
14
16
8
60
1.57
23795428--23795600
46
3.8
45
77
10
179
21
17
30
30
1.96
23795421--23795592
93
1.8
93
92
0
290
20
19
30
29
1.97
23798218--23798307
30
3.1
29
75
10
87
25
31
14
28
1.95
23798259--23798351
29
3.2
28
79
7
87
27
27
12
31
1.93
23798561--23798614
24
2.3
23
81
6
63
11
16
18
53
1.72
23801938--23802145
40
5.2
40
88
2
276
25
20
26
27
1.99
23809281--23809306
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
23810138--23810398
40
6.5
40
84
2
301
26
21
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23816501--23816582
30
2.7
30
94
0
146
26
9
29
34
1.88
23819251--23819423
43
4.0
43
76
12
176
24
17
26
31
1.97
23819264--23819423
86
1.9
86
84
5
216
25
18
26
30
1.98
23821920--23822176
40
6.5
40
88
2
324
25
29
23
21
1.99
23826139--23826226
29
3.0
29
83
0
113
28
30
14
26
1.95
23827391--23827422
16
2.0
16
93
0
55
9
0
34
56
1.32
23827685--23827940
55
4.8
54
77
9
242
35
16
25
22
1.95
23827692--23827892
108
1.8
110
87
4
300
33
17
25
23
1.96
23837188--23837286
28
3.5
29
82
6
114
28
15
26
30
1.96
23839548--23839594
22
2.1
22
96
0
85
31
21
25
21
1.98
23845055--23845114
28
2.2
28
96
3
113
36
16
11
35
1.85
23847807--23848063
55
4.8
53
78
11
251
35
17
25
21
1.95
23848252--23848282
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
23849619--23849788
46
3.6
46
78
12
159
28
17
30
23
1.97
23849619--23849836
47
4.6
48
79
8
200
29
17
29
23
1.97
23849614--23849836
93
2.4
93
77
9
222
29
17
29
23
1.97
23861930--23862269
48
7.0
48
94
1
545
34
6
28
30
1.82
23861930--23862269
146
2.3
146
92
1
549
34
6
28
30
1.82
23862413--23862518
37
2.9
37
91
0
167
23
17
32
26
1.97
23863795--23863928
40
3.3
40
88
0
196
20
25
30
23
1.98
23865315--23865467
40
3.8
39
86
1
171
24
26
23
26
2.00
23869283--23869447
40
4.2
40
79
2
145
25
20
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23876845--23876957
40
2.8
40
81
6
131
23
27
23
24
2.00
23878786--23878896
57
1.9
57
87
0
159
22
18
27
30
1.98
23878790--23878889
28
3.5
28
75
2
92
21
20
28
31
1.98
23878818--23878907
28
3.2
27
73
7
81
23
18
28
28
1.98
23881011--23881175
40
4.2
40
81
2
190
26
27
21
25
1.99
23882949--23882974
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
23885927--23886091
48
3.4
48
96
0
303
32
6
28
32
1.83
23886065--23886119
28
2.0
28
96
0
101
29
7
27
36
1.84
23886019--23886167
76
2.0
76
98
0
289
32
6
28
32
1.83
23886095--23886390
48
6.1
48
94
1
493
34
6
28
30
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770