Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  373  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114793082--114793471
73
5.3
73
85
7
513
28
16
20
34
1.95
114793082--114793449
146
2.5
146
95
0
655
29
16
20
32
1.95
114793544--114793576
14
2.4
14
90
10
50
21
12
6
60
1.53
114793396--114793730
180
1.9
180
82
5
426
29
17
19
34
1.94
114793378--114793988
88
6.8
89
76
10
328
28
16
18
36
1.92
114792296--114793838
733
2.1
721
84
7
2063
29
16
19
35
1.93
114794614--114794667
18
3.3
18
66
28
57
22
50
7
20
1.73
114794604--114794672
30
2.3
30
94
0
129
26
52
5
15
1.66
114795203--114795347
25
5.7
25
72
15
82
31
7
4
55
1.49
114795414--114795468
23
2.3
25
75
18
62
38
16
1
43
1.58
114795422--114795467
23
2.0
22
87
4
65
41
15
2
41
1.59
114798939--114799115
47
3.8
47
79
12
211
28
28
20
22
1.99
114798947--114799117
94
1.8
93
91
1
279
28
28
21
22
1.99
114799537--114799594
30
1.9
30
86
6
82
27
27
8
36
1.86
114807251--114807384
46
3.0
45
83
4
162
35
13
23
27
1.93
114812186--114812223
17
2.2
17
86
9
51
31
23
5
39
1.77
114813340--114813405
30
2.2
31
86
2
89
45
4
4
45
1.44
114820245--114820392
40
3.7
39
78
6
154
31
22
20
25
1.98
114820659--114820713
28
1.9
29
82
10
69
34
0
7
58
1.26
114821085--114821173
7
12.3
7
72
7
52
24
1
40
33
1.63
114821070--114821148
29
2.8
28
84
9
97
26
1
36
35
1.65
114821563--114821636
26
2.9
27
88
6
109
43
6
4
45
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114821750--114821784
17
2.0
17
88
5
52
34
0
0
65
0.93
114822218--114822249
13
2.5
13
95
5
57
25
40
0
34
1.56
114825384--114826006
242
2.6
242
98
0
1201
35
17
14
32
1.90
114826031--114826145
9
12.3
9
72
14
90
44
21
0
33
1.59
114835956--114836054
28
3.5
29
93
5
159
27
12
28
32
1.92
114843354--114843452
28
3.5
29
93
5
159
27
12
28
32
1.92
114851781--114851822
21
2.0
21
85
0
57
40
7
19
33
1.78
114852141--114852234
47
2.0
47
100
0
188
44
12
8
34
1.73
114856632--114856795
43
3.8
43
79
12
176
31
24
18
25
1.98
114865906--114865967
28
2.2
28
94
0
106
33
27
8
30
1.86
114866075--114866163
27
3.2
28
80
6
110
19
23
24
32
1.97
114866084--114866174
27
3.2
28
81
4
94
20
26
20
31
1.98
114866075--114866188
55
2.1
55
81
6
133
18
23
22
35
1.96
114867259--114867292
10
3.3
10
84
8
50
29
8
8
52
1.62
114873764--114873828
28
2.3
28
94
0
112
33
27
7
30
1.85
114873934--114874023
27
3.2
28
81
7
112
18
24
24
32
1.97
114873944--114874034
27
3.2
28
81
4
94
20
26
20
31
1.98
114873934--114874048
55
2.1
56
82
8
137
18
24
22
34
1.96
114876496--114876538
21
2.0
21
90
0
68
58
4
4
32
1.39
114877564--114877598
7
5.0
7
85
0
52
82
0
5
11
0.82
114878209--114878304
45
2.2
44
88
1
138
31
21
19
27
1.98
114878355--114879503
44
26.0
44
67
10
364
27
25
17
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114878231--114879591
178
7.7
178
86
2
1630
27
25
17
29
1.97
114878231--114879591
531
2.6
531
84
4
1708
27
25
17
29
1.97
114878668--114879477
89
9.2
88
64
9
234
26
25
17
29
1.97
114880856--114880900
16
2.8
16
79
3
54
4
8
2
84
0.84
114880863--114880900
20
1.9
20
88
0
58
5
5
2
86
0.76
114881429--114881492
33
1.9
33
87
6
94
6
6
4
82
0.93
114881437--114881472
12
3.0
12
87
0
54
5
5
0
88
0.61
114886229--114886378
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
114886253--114886436
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
114887518--114887544
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
114890249--114890289
21
2.0
21
90
0
64
58
4
4
31
1.40
114897613--114897746
48
2.8
48
86
1
180
29
14
23
32
1.95
114897712--114897785
37
2.0
37
86
0
103
27
14
27
31
1.95
114900162--114900383
39
5.6
40
85
5
288
24
23
26
25
2.00
114900166--114900383
82
2.7
79
89
4
305
23
24
26
25
2.00
114905645--114905672
12
2.3
12
100
0
56
17
35
17
28
1.93
114909609--114909775
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
114913668--114913955
40
7.2
40
87
1
362
25
23
26
25
2.00
114916316--114916509
47
4.1
47
89
0
280
32
10
29
26
1.90
114916389--114916465
25
3.2
25
62
23
65
28
12
35
23
1.92
114916480--114916663
98
1.9
96
91
4
298
35
5
26
31
1.81
114916479--114916663
48
3.8
48
89
5
291
35
5
26
31
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114916474--114916684
48
4.3
50
82
12
265
33
6
27
32
1.82
114918146--114918238
29
3.2
29
90
3
143
25
26
17
30
1.97
114926065--114926158
29
3.2
29
90
0
134
25
27
15
30
1.96
114927325--114927387
33
2.0
31
84
6
81
4
19
1
74
1.08
114927857--114927967
37
3.0
37
93
0
177
21
17
31
29
1.96
114933468--114933583
47
2.5
47
92
1
198
32
18
25
23
1.97
114933607--114933753
46
3.2
44
80
11
136
30
19
26
23
1.98
114933649--114933776
47
2.8
45
80
10
136
28
20
28
23
1.99
114936170--114936216
23
2.0
23
95
0
85
40
6
17
36
1.75
114939838--114940020
40
4.6
40
76
5
138
22
24
30
23
1.99
114947935--114948117
40
4.6
39
77
7
145
22
24
29
23
1.99
114947940--114948122
79
2.3
80
80
5
185
20
24
30
24
1.99
114954038--114954082
20
2.2
20
88
0
63
48
2
11
37
1.51
114960640--114960671
16
2.1
16
94
5
57
34
37
18
9
1.83
114963937--114964033
4
24.2
4
97
0
185
49
24
1
24
1.57
114973509--114973659
40
3.8
40
80
7
173
24
27
23
24
2.00
114973513--114973697
80
2.3
80
82
11
229
24
25
22
26
2.00
114989402--114989531
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
114991242--114991495
127
2.0
127
100
0
508
28
13
25
32
1.94
114993332--114993507
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
114993328--114993499
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
114996456--114996524
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114996447--114996534
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
114998917--114999092
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
114998913--114999084
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
115006420--115006518
28
3.5
29
94
5
168
28
12
27
32
1.92
115008325--115008349
9
2.8
9
100
0
50
60
32
0
8
1.26
115015063--115015118
28
2.0
28
100
0
112
28
10
25
35
1.89
115018158--115018354
99
2.0
99
94
0
349
25
12
18
42
1.86
115026232--115026257
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
115027623--115027647
12
2.1
12
100
0
50
32
24
0
44
1.54
115033229--115033257
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
115037976--115038043
30
2.3
30
82
5
75
45
5
20
27
1.74
115038434--115038478
20
2.2
21
84
4
56
40
17
2
40
1.62
115039846--115040102
40
6.5
40
86
3
324
24
27
24
23
2.00
115041345--115041454
57
1.9
57
92
0
184
17
20
12
49
1.79
115047562--115047769
40
5.2
40
83
2
213
25
26
22
26
2.00
115053263--115053361
28
3.5
29
80
12
107
29
15
26
29
1.96
115059388--115059477
40
2.2
40
82
7
121
24
28
23
23
1.99
115069023--115069060
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
115070685--115070753
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
115093849--115093915
21
3.4
21
69
26
74
29
2
20
46
1.66
115093856--115093930
37
2.0
37
94
0
132
30
5
18
45
1.72
115093918--115094046
68
1.9
68
85
3
179
37
6
18
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115102151--115102181
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
115102647--115102731
39
2.2
39
89
0
125
22
22
29
25
1.99
115102647--115102741
39
2.5
39
85
1
111
23
23
28
25
1.99
115106500--115106887
48
8.1
48
97
0
722
34
5
29
31
1.80
115107028--115107166
73
1.9
74
92
1
235
24
18
31
25
1.98
115107028--115107166
37
3.8
37
92
1
235
24
18
31
25
1.98
115113231--115113344
39
2.9
39
89
0
165
24
22
27
25
2.00
115118108--115118284
40
4.5
40
83
2
207
25
28
22
23
1.99
115121163--115121225
33
1.9
33
83
0
81
31
26
15
25
1.96
115121690--115121784
27
3.5
27
79
2
84
26
17
16
38
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770