Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  599  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
187485148--187485328
39
4.6
39
88
1
229
23
21
30
23
1.99
187486965--187487029
22
3.0
22
77
8
69
21
23
21
33
1.97
187487188--187487289
27
3.8
27
83
5
107
18
21
21
38
1.94
187487426--187487545
6
19.3
6
68
19
68
20
16
13
50
1.78
187487426--187487561
31
4.4
31
83
3
141
19
16
13
50
1.77
187492843--187492907
27
2.4
27
84
0
94
24
18
10
46
1.81
187492939--187493147
27
7.7
27
75
6
143
40
20
8
31
1.82
187492897--187493038
54
2.7
53
80
5
153
38
22
10
28
1.87
187492939--187493119
54
3.3
54
81
2
173
41
19
7
30
1.80
187493179--187493270
27
3.4
27
80
3
96
34
17
25
22
1.96
187494070--187494270
26
7.8
26
87
0
289
27
23
20
27
1.99
187494070--187494282
52
4.2
52
92
2
344
28
23
21
27
1.99
187494415--187494506
42
2.2
42
90
0
139
29
13
21
35
1.91
187494530--187494610
31
2.6
31
96
0
144
30
17
24
27
1.97
187501894--187502109
47
4.6
47
95
0
369
30
12
31
26
1.92
187502083--187502172
46
2.0
46
88
0
135
34
7
30
27
1.85
187504456--187504975
40
13.1
40
94
0
884
26
21
25
25
1.99
187508445--187508660
47
4.6
47
95
0
369
30
12
31
26
1.92
187508634--187508723
46
2.0
46
88
0
135
34
7
30
27
1.85
187508725--187508751
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
187511683--187511814
59
2.2
59
93
0
219
34
13
25
26
1.93
187511683--187511814
30
4.5
29
91
2
201
34
13
25
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
187519589--187519721
59
2.2
60
91
1
214
35
13
24
26
1.93
187519589--187519721
29
4.5
29
90
3
194
35
13
24
26
1.93
187521803--187521920
41
3.1
41
59
25
96
33
16
28
21
1.95
187521771--187521934
71
2.3
71
97
0
319
35
17
28
18
1.93
187526096--187526123
8
3.5
8
100
0
56
10
21
10
57
1.63
187528230--187528267
20
1.9
20
100
0
76
39
28
5
26
1.78
187528800--187528840
21
2.0
21
95
0
73
51
9
9
29
1.67
187529466--187529497
16
2.0
16
93
0
55
65
9
12
12
1.47
187536705--187536952
40
6.2
40
79
3
268
26
27
21
25
1.99
187536696--187536952
80
3.2
80
87
1
338
26
26
21
25
1.99
187536732--187536956
80
2.8
80
90
0
342
24
26
22
26
2.00
187556155--187556374
110
2.0
110
100
0
440
28
12
24
34
1.92
187556443--187556673
40
5.8
40
77
13
217
25
24
27
22
2.00
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29
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187556442--187556705
40
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22
2.00
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120
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24
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54
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.99
187729475--187729584
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2.1
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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9
144
37
19
15
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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