Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  208  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62338319--62338447
51
2.5
51
81
2
152
37
12
27
21
1.90
62345804--62345872
20
3.5
20
80
7
77
42
7
14
36
1.73
62345962--62346074
40
2.8
40
84
0
154
40
7
14
37
1.75
62345984--62346054
20
3.5
20
72
0
70
43
7
11
38
1.68
62346047--62346253
20
10.4
20
73
6
123
34
7
16
41
1.76
62346122--62346253
60
2.2
60
83
2
158
34
6
16
43
1.73
62346309--62346356
20
2.4
20
82
0
60
50
0
14
35
1.44
62346102--62346543
187
2.4
187
81
2
494
39
4
17
38
1.71
62346326--62346421
20
4.8
20
71
5
68
42
5
15
36
1.70
62346476--62346529
21
2.6
21
85
2
74
51
1
16
29
1.55
62348594--62348623
2
15.0
2
92
0
51
50
3
0
46
1.18
62348752--62348864
25
5.0
22
71
24
74
56
5
7
30
1.48
62348822--62348866
11
4.1
11
82
0
54
60
4
0
35
1.17
62349499--62349551
13
4.0
12
75
20
52
22
0
3
73
0.99
62349590--62349639
17
3.0
16
83
13
57
74
0
8
18
1.06
62350686--62350743
30
1.9
30
89
6
91
44
25
8
20
1.80
62350814--62350862
24
2.0
24
100
0
98
26
24
16
32
1.96
62350865--62350899
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
62350910--62351445
77
6.6
79
72
16
267
30
19
19
30
1.96
62350570--62351103
276
2.0
271
83
8
694
35
18
16
29
1.93
62351135--62351300
75
2.2
77
85
6
230
30
19
19
30
1.97
62350975--62351452
167
2.9
166
89
3
692
30
19
19
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62351383--62351507
64
2.0
64
93
0
214
22
24
17
35
1.95
62351307--62351584
141
2.0
139
85
4
380
27
23
17
30
1.97
62363894--62363924
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
62363937--62364052
25
4.9
23
69
23
64
56
6
6
31
1.50
62364008--62364052
11
4.1
11
82
0
54
60
4
0
35
1.17
62367508--62367683
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
62367505--62367676
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
62369133--62369223
41
2.2
41
78
0
101
23
32
23
20
1.98
62371450--62371623
46
3.8
45
81
13
212
20
21
29
28
1.98
62371446--62371615
91
1.9
91
94
0
304
20
21
30
27
1.98
62374519--62374598
15
5.4
15
77
7
83
10
18
13
57
1.64
62374510--62374597
30
3.0
30
80
11
92
10
18
15
55
1.68
62376911--62377086
46
3.8
45
81
10
212
21
21
29
28
1.98
62376907--62377078
93
1.8
93
93
0
299
20
21
30
27
1.98
62378392--62378506
20
5.8
20
84
4
124
36
7
16
39
1.78
62378392--62378506
40
2.9
40
84
5
151
36
7
16
39
1.78
62378406--62378518
60
1.9
58
87
3
163
35
7
15
41
1.75
62378625--62378663
20
2.0
20
89
0
60
35
2
17
43
1.63
62379469--62379522
21
2.7
20
82
5
72
44
3
11
40
1.58
62385883--62385908
6
4.3
6
100
0
52
53
0
0
46
1.00
62386471--62386556
44
2.0
44
90
0
136
33
26
18
20
1.96
62386471--62386586
44
2.6
42
84
8
126
35
26
16
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62388749--62388819
29
2.4
28
83
4
79
32
32
14
21
1.93
62390703--62390904
101
2.0
101
100
0
404
30
12
13
42
1.82
62393131--62393202
22
3.1
22
74
18
83
51
11
2
34
1.52
62394601--62394637
15
2.5
15
84
16
51
48
29
0
21
1.50
62394903--62394935
15
2.3
14
94
5
57
51
27
0
21
1.48
62395133--62395197
23
2.8
24
77
15
57
24
0
26
49
1.51
62395239--62395568
41
8.4
41
80
8
303
22
20
20
36
1.96
62395304--62395519
81
2.9
71
78
12
184
22
22
19
35
1.96
62395339--62395399
31
2.0
32
90
6
99
22
21
19
36
1.95
62395371--62395591
40
5.5
40
80
6
241
24
21
18
35
1.95
62395239--62395519
152
1.8
152
87
3
413
22
22
20
35
1.96
62395378--62395599
81
2.7
79
83
5
255
23
20
18
37
1.94
62395846--62395925
42
1.9
42
92
0
133
45
25
18
11
1.83
62399179--62399225
15
3.2
14
78
21
60
53
2
0
44
1.12
62402642--62402675
12
2.8
12
90
0
59
17
0
5
76
0.98
62404384--62404548
3
54.7
3
75
9
122
29
6
1
61
1.31
62404599--62404641
22
1.9
23
85
4
61
27
6
9
55
1.57
62404659--62404711
27
2.0
26
88
3
79
32
9
1
56
1.42
62415761--62415905
40
3.6
40
85
5
159
22
27
22
26
1.99
62425529--62425624
26
3.5
28
78
9
90
30
16
23
29
1.96
62433170--62433267
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
62434833--62434910
27
2.9
26
74
14
77
23
19
19
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62434936--62435115
53
3.3
54
78
6
177
33
8
16
41
1.78
62434931--62435168
27
8.8
27
76
5
151
31
9
18
40
1.82
62435014--62435168
53
2.9
54
82
2
161
29
9
19
41
1.83
62435167--62435310
27
5.3
27
85
3
182
39
9
24
26
1.86
62435155--62435310
54
2.9
54
87
2
208
39
10
23
27
1.87
62435151--62435324
81
2.2
80
80
6
226
37
10
21
30
1.87
62436395--62436445
24
2.1
24
96
0
93
13
23
13
49
1.78
62443506--62443627
49
2.5
49
84
5
149
29
22
27
21
1.99
62458986--62459047
30
2.1
29
96
3
115
35
22
17
24
1.95
62470032--62470152
40
3.0
40
80
7
147
30
23
24
21
1.99
62474668--62474811
39
3.7
39
92
0
243
26
20
29
22
1.99
62474669--62474851
78
2.3
79
90
1
278
24
22
29
23
1.99
62482655--62482798
39
3.7
39
92
0
243
26
20
29
22
1.99
62482656--62482838
78
2.3
79
90
1
278
24
22
29
23
1.99
62489253--62489372
40
3.0
40
83
2
152
29
23
25
21
1.99
62489218--62489405
80
2.3
80
78
12
197
26
23
27
22
2.00
62490057--62490236
90
2.0
90
97
2
344
38
12
21
27
1.89
62491406--62491825
27
15.7
27
76
6
192
38
20
8
32
1.83
62491445--62491601
53
2.9
53
78
11
167
33
21
7
37
1.82
62491452--62491599
80
1.9
80
79
2
172
33
19
8
38
1.81
62491551--62491881
54
6.1
54
74
8
206
40
19
9
30
1.83
62491565--62491799
81
2.9
80
84
4
267
41
20
8
29
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62491551--62491887
27
12.4
27
75
6
162
40
19
9
31
1.83
62491941--62491998
27
2.3
25
79
8
64
34
20
24
20
1.97
62492797--62492918
25
4.8
26
91
3
196
26
22
23
27
1.99
62492797--62492918
51
2.4
51
94
4
212
26
22
23
27
1.99
62493063--62493154
42
2.2
42
92
0
148
29
14
21
34
1.93
62493178--62493252
31
2.4
31
97
0
141
29
18
25
26
1.98
62499162--62499500
123
2.8
123
95
0
597
30
10
25
33
1.90
62499469--62499672
40
5.1
40
87
0
237
24
21
26
26
1.99
62506541--62506879
123
2.8
123
95
0
597
30
10
25
33
1.90
62506848--62507088
40
6.1
40
84
5
276
24
21
26
27
1.99
62506848--62507088
79
3.1
79
85
3
281
24
21
26
27
1.99
62513864--62513942
39
2.0
39
92
0
131
31
16
13
37
1.88
62514829--62514886
23
2.5
24
82
2
73
31
22
22
24
1.99
62518481--62518513
17
1.9
17
93
0
57
24
39
24
12
1.89
62525675--62525759
42
2.0
42
100
0
170
45
18
9
25
1.79
62526859--62526964
42
2.5
43
80
7
126
31
28
17
22
1.97
62533765--62533825
31
2.0
31
96
0
113
18
19
9
52
1.72
62533803--62533839
18
2.1
18
100
0
74
21
10
5
62
1.48
62546826--62546863
19
2.0
20
84
5
51
44
21
2
31
1.66
62554149--62554225
18
4.2
17
78
18
75
27
2
2
67
1.17
62554150--62554223
16
4.8
16
74
19
59
28
2
2
66
1.19
62565443--62565633
90
2.1
90
96
0
346
30
18
22
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62565443--62565748
90
3.4
89
80
9
320
31
17
22
28
1.97
62565872--62566015
44
3.3
44
87
0
225
29
14
29
27
1.95
62567840--62567961
39
3.1
39
85
1
145
25
27
20
26
1.99
62570095--62570148
23
2.3
23
93
0
90
18
27
35
18
1.94
62570753--62570848
21
5.1
18
71
20
63
30
4
1
64
1.19
62570754--62570860
21
5.7
19
70
26
61
30
4
0
63
1.21
62570800--62570860
21
2.8
22
79
13
65
31
3
1
63
1.20
62570874--62570939
33
2.0
33
84
0
87
30
4
3
62
1.30
62570904--62570949
21
2.2
21
84
7
58
28
4
6
60
1.40
62573913--62574086
46
3.8
45
77
8
172
29
28
20
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770