Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  552  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
171768434--171768593
59
2.8
57
88
4
214
33
14
25
26
1.94
171775504--171775674
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
171780403--171780736
163
2.0
169
85
10
465
30
18
24
26
1.98
171783687--171783870
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
171783727--171783915
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
171790457--171790673
40
5.5
40
88
3
298
22
23
28
25
2.00
171790457--171790673
79
2.7
80
87
4
298
22
23
28
25
2.00
171790457--171790673
119
1.8
119
88
2
337
22
23
28
25
2.00
171798503--171798645
40
3.6
39
91
3
214
20
25
28
25
1.99
171801630--171801654
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32
171816901--171817073
45
3.8
46
78
17
198
21
21
28
27
1.99
171816901--171817070
93
1.8
92
94
1
304
21
21
29
27
1.99
171824467--171824636
46
3.7
45
79
13
204
21
21
28
28
1.99
171827006--171827165
48
3.2
48
88
3
221
8
23
6
62
1.46
171828058--171828082
12
2.1
12
100
0
50
68
8
0
24
1.16
171830176--171830228
2
27.0
2
96
3
99
50
0
49
0
1.00
171839854--171840016
24
6.8
24
92
0
272
20
17
26
36
1.94
171841723--171841771
23
2.2
22
82
10
55
28
16
16
38
1.90
171847481--171847633
40
3.8
40
82
1
155
24
28
21
26
1.99
171855462--171855612
40
3.8
40
83
6
164
23
27
22
26
1.99
171859144--171859244
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
171859173--171859248
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
171874717--171875075
47
7.6
48
70
12
183
23
30
20
25
1.98
171874717--171875067
94
3.7
94
77
7
331
24
31
19
24
1.98
171880431--171880593
39
4.2
39
93
0
263
23
20
31
24
1.98
171880431--171880623
39
4.9
39
90
0
251
23
21
31
23
1.98
171883798--171883847
24
2.1
24
100
0
100
28
12
40
20
1.87
171884853--171884982
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
171890805--171890986
39
4.6
40
82
4
181
27
22
26
23
2.00
171895124--171895297
45
3.8
45
80
13
212
28
29
21
20
1.98
171895131--171895300
92
1.8
93
94
1
306
27
30
21
20
1.98
171897671--171897749
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
171897671--171897758
29
3.0
30
77
11
92
56
15
17
10
1.66
171897682--171897758
15
5.2
15
75
12
70
55
15
16
11
1.68
171902376--171902528
39
3.9
39
92
0
252
23
32
20
23
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21
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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