Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  363  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111387353--111387464
54
2.1
54
86
3
154
16
23
22
37
1.94
111389683--111389785
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
111390246--111390371
40
3.2
40
88
0
189
23
23
27
24
2.00
111392079--111392246
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
111397422--111397581
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
111402264--111402423
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
111409752--111409959
40
5.2
40
83
0
209
25
23
25
25
2.00
111409753--111409959
80
2.6
80
83
4
247
25
23
26
25
2.00
111413897--111413942
14
3.3
14
100
0
92
36
26
6
30
1.82
111414123--111414170
20
2.4
20
83
16
64
41
20
25
12
1.87
111417148--111417217
28
2.5
28
86
4
97
28
15
27
28
1.96
111421087--111421120
12
2.8
12
100
0
68
5
44
26
23
1.76
111422403--111422485
43
1.9
43
92
0
139
30
28
16
24
1.97
111424964--111425131
80
2.1
80
83
5
207
25
22
26
25
2.00
111424964--111425131
40
4.2
40
77
6
171
25
22
26
25
2.00
111433053--111433220
80
2.1
80
83
5
207
25
22
26
25
2.00
111433053--111433220
40
4.2
40
77
6
171
25
22
26
25
2.00
111435377--111435452
29
2.6
28
85
6
98
40
22
15
21
1.90
111437935--111438025
25
3.6
25
75
0
92
26
23
21
28
1.99
111440224--111440341
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
111440192--111440355
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
111442357--111442522
40
4.2
40
77
8
162
25
21
27
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111447594--111447801
40
5.2
40
82
2
229
25
23
26
24
2.00
111451129--111451336
40
5.2
40
82
2
229
25
23
26
24
2.00
111453044--111453137
27
3.5
25
83
13
116
40
20
22
17
1.91
111453044--111453155
28
4.1
28
79
6
106
37
21
23
17
1.94
111453044--111453155
55
2.1
54
84
5
145
37
21
23
17
1.94
111460846--111460951
27
3.9
27
85
10
135
35
21
24
17
1.95
111460841--111460951
55
2.0
54
86
5
152
36
20
24
18
1.94
111467058--111467253
50
3.9
49
82
4
214
25
18
28
27
1.98
111470229--111470282
15
3.7
15
75
20
51
7
12
18
61
1.54
111474646--111474753
54
2.0
54
98
0
207
29
3
28
37
1.74
111474855--111474896
16
2.6
16
88
7
59
50
14
23
11
1.76
111479331--111479455
6
20.3
6
70
16
87
46
15
20
18
1.84
111479357--111479427
19
3.8
19
87
10
110
45
16
21
16
1.86
111479340--111479446
37
2.9
37
90
4
153
45
14
21
17
1.85
111479392--111479455
25
2.6
25
89
0
101
46
15
18
18
1.84
111479573--111479658
27
3.2
26
86
4
109
36
22
22
19
1.96
111479862--111480111
27
9.3
27
88
0
329
26
20
18
36
1.95
111481980--111482153
33
5.3
33
81
3
145
29
23
12
34
1.91
111487387--111487605
46
4.7
46
75
10
171
27
19
27
25
1.98
111490494--111490627
69
1.9
69
82
5
164
28
26
18
26
1.98
111491139--111491198
28
2.2
27
82
8
68
26
18
5
50
1.67
111496372--111496398
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111503070--111503199
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
111508645--111508769
46
2.7
46
93
2
207
21
20
28
30
1.98
111514064--111514112
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
111514929--111515095
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
111522061--111522109
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
111522931--111523097
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
111527112--111527291
40
4.5
39
77
10
161
27
22
26
23
1.99
111535126--111535296
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
111537887--111537995
37
2.9
37
95
0
191
26
31
19
22
1.98
111538140--111538324
48
3.8
48
89
4
282
32
26
5
35
1.79
111538140--111538323
98
1.9
97
89
4
291
32
26
5
35
1.79
111538294--111538487
47
4.1
47
89
0
280
27
29
10
32
1.90
111538387--111538458
22
3.1
22
64
24
58
23
29
13
33
1.93
111542517--111542828
40
7.8
40
92
0
489
25
28
21
24
1.99
111543824--111543932
37
2.9
37
95
0
191
26
31
19
22
1.98
111544078--111544310
48
4.8
48
94
3
405
30
26
6
35
1.83
111544324--111544397
23
3.2
23
63
30
57
22
33
13
29
1.93
111544280--111544471
47
4.1
47
89
2
280
26
29
10
33
1.90
111544371--111544442
22
3.1
22
64
24
58
23
29
13
33
1.93
111544184--111544471
94
3.1
94
82
8
295
28
28
9
34
1.88
111564533--111564592
30
2.0
31
83
3
77
11
28
20
40
1.87
111567046--111567095
15
3.3
15
83
5
57
78
2
18
2
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111569052--111569085
10
3.4
10
91
0
50
11
20
20
47
1.81
111577226--111577435
103
2.0
103
100
0
420
20
20
13
44
1.85
111577530--111577682
75
2.0
75
98
0
297
28
16
12
41
1.85
111590005--111590043
18
2.2
18
86
9
53
61
0
7
30
1.24
111596843--111596912
33
2.2
33
84
2
97
30
12
31
25
1.93
111600078--111600226
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
111600119--111600226
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
111615469--111615537
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
111615460--111615546
30
3.0
30
81
9
99
10
17
16
56
1.67
111618965--111619106
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
111619004--111619132
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
111621065--111621191
47
2.7
47
100
0
254
22
20
29
27
1.98
111625314--111625498
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
111625315--111625506
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
111631421--111631605
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
111631422--111631613
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
111631421--111631638
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
111641957--111641988
16
2.0
16
93
0
55
34
18
0
46
1.49
111642188--111642683
50
9.9
50
73
8
414
29
25
17
27
1.97
111642199--111642531
101
3.3
101
79
6
277
29
24
18
27
1.98
111642191--111642581
151
2.6
151
88
0
550
29
24
18
27
1.98
111642400--111642682
101
2.8
101
91
1
433
31
25
15
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111649078--111649208
40
3.3
40
86
4
140
27
25
19
26
1.99
111649106--111649250
40
3.6
40
87
3
195
26
25
20
27
1.99
111653920--111653955
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
111660389--111660413
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
111661414--111661464
17
3.1
17
66
11
52
21
7
9
60
1.53
111661414--111661475
32
2.0
31
93
6
108
22
6
8
62
1.45
111664449--111664482
15
2.3
15
100
0
68
41
0
26
32
1.56
111666452--111666521
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
111666452--111666533
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
111669115--111669142
14
2.0
14
100
0
56
64
14
7
14
1.48
111672014--111672052
21
1.9
21
85
15
55
35
33
7
23
1.83
111682066--111682273
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
111682067--111682273
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
111690079--111690286
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
111690080--111690286
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
111695612--111695792
40
4.6
40
86
2
242
22
27
23
27
1.99
111696384--111696409
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
111701643--111701818
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
111701639--111701810
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
111706050--111706312
46
5.7
46
75
12
195
29
20
27
22
1.98
111706047--111706312
93
2.9
94
80
9
287
29
20
27
22
1.99
111709316--111709511
65
3.0
65
96
0
356
23
14
18
43
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111709398--111709498
30
3.2
30
67
22
89
22
16
16
43
1.87
111709363--111709468
35
3.2
35
65
22
91
25
13
17
43
1.86
111719799--111719868
3
23.3
3
100
0
140
32
0
0
67
0.91
111724135--111724227
46
2.0
46
95
0
168
50
19
9
20
1.75
111725681--111725872
40
4.8
40
78
9
203
26
29
20
23
1.99
111725669--111725873
79
2.6
81
81
6
231
26
28
20
23
1.99
111735058--111735265
40
5.2
39
84
1
209
25
25
22
26
2.00
111735058--111735263
80
2.6
81
84
3
247
24
26
22
26
2.00
111737961--111738144
40
4.6
40
79
6
203
24
22
26
26
2.00
111737961--111738180
80
2.8
79
82
4
230
24
21
27
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770