Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  221  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65978746--65978837
28
3.3
27
87
6
130
28
25
10
35
1.89
65987226--65987281
24
2.3
24
90
0
85
19
16
46
17
1.84
65994470--65994496
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
65995363--65995445
43
1.9
43
83
9
107
26
18
24
31
1.97
65996273--65996310
19
2.0
19
100
0
76
31
0
31
36
1.58
66001231--66001285
27
2.0
27
96
0
101
38
5
25
30
1.79
66001278--66001401
55
2.3
55
88
0
185
29
15
23
32
1.95
66028211--66028264
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
66028510--66028604
49
1.9
49
91
0
154
26
18
27
27
1.98
66040443--66040605
40
4.1
40
78
7
170
25
21
27
25
1.99
66050359--66050492
40
3.3
40
97
0
250
23
22
27
26
1.99
66050359--66050512
80
1.9
79
90
3
247
23
22
27
26
2.00
66050520--66050674
55
2.8
56
89
2
213
22
18
27
31
1.97
66050524--66050676
28
5.5
28
72
6
121
22
18
27
31
1.97
66056340--66056401
24
2.6
24
100
0
124
33
37
12
16
1.87
66068620--66068858
74
3.1
78
86
8
314
23
20
29
26
1.99
66068620--66068858
40
6.2
40
85
8
311
23
20
29
26
1.99
66076709--66076955
40
6.2
40
85
4
313
23
21
28
26
1.99
66076705--66076935
79
2.9
80
89
2
349
24
22
28
25
1.99
66076709--66076955
119
2.1
120
92
3
410
23
21
28
26
1.99
66085736--66085785
15
3.4
15
76
13
50
62
14
16
8
1.54
66085737--66085793
30
1.9
30
89
3
89
59
15
14
10
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66088754--66088924
92
1.8
93
93
1
299
28
29
21
21
1.98
66088747--66088921
46
3.8
46
78
11
205
29
29
20
21
1.98
66092168--66092257
44
2.0
44
95
0
162
25
15
11
47
1.78
66097913--66097965
20
2.7
20
96
0
97
26
37
15
20
1.92
66100331--66100390
30
2.0
30
100
0
120
36
16
23
23
1.94
66100362--66100523
43
3.8
43
78
8
136
27
16
27
29
1.97
66108362--66108654
49
5.9
49
73
9
227
28
26
19
25
1.98
66108471--66108649
51
3.5
51
81
3
236
27
25
19
26
1.99
66108465--66108654
100
1.9
100
94
0
335
27
26
19
26
1.99
66110197--66110342
72
2.0
72
94
0
256
39
6
21
33
1.78
66114223--66114410
40
4.7
40
89
1
261
22
20
29
26
1.99
66114219--66114430
80
2.7
80
88
2
302
23
20
28
27
1.99
66117444--66117481
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
66120107--66120158
27
2.0
27
84
3
70
34
21
26
17
1.95
66120407--66120537
27
4.9
27
82
2
149
24
22
17
35
1.95
66120407--66120545
54
2.6
55
81
5
169
25
20
16
37
1.93
66120593--66120657
27
2.4
27
84
0
85
33
10
16
38
1.84
66120636--66120813
27
6.6
27
86
0
232
30
9
19
40
1.84
66120579--66120778
81
2.5
81
81
3
215
31
11
19
38
1.87
66121745--66121783
19
2.1
19
95
0
69
43
12
15
28
1.83
66123710--66123782
6
12.2
6
77
9
60
75
0
8
16
1.03
66123721--66123773
26
2.1
26
86
10
74
75
0
9
15
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66123721--66123773
25
2.1
25
86
10
72
75
0
9
15
1.04
66127996--66128024
10
2.9
10
100
0
58
31
10
27
31
1.90
66135040--66135260
40
5.6
40
90
2
322
26
23
27
22
2.00
66143765--66144008
40
6.1
40
85
2
285
28
26
20
24
1.99
66143977--66144438
123
3.8
123
97
0
852
33
25
11
29
1.90
66144218--66144410
64
3.1
64
59
18
143
33
26
11
28
1.91
66146413--66146543
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
66146413--66146543
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
66156832--66157078
40
6.2
40
90
2
365
26
29
21
22
1.99
66165067--66165309
39
6.2
40
86
6
329
27
28
20
23
1.99
66165067--66165308
77
3.1
78
86
6
321
27
28
20
23
1.99
66175939--66175964
11
2.4
11
100
0
52
61
0
0
38
0.96
66189488--66189824
168
2.0
168
92
1
568
32
10
18
38
1.86
66195945--66196029
29
3.0
28
86
5
109
21
24
21
32
1.97
66199213--66199261
24
2.0
24
100
0
98
38
20
4
36
1.72
66199937--66200075
40
3.6
39
78
11
144
34
23
17
24
1.96
66199933--66200074
74
1.9
75
86
1
205
34
23
16
25
1.95
66205406--66205730
49
6.8
49
89
4
466
32
8
31
28
1.86
66207282--66207306
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
66208184--66208253
27
2.5
28
90
2
115
25
12
28
32
1.93
66208991--66210486
743
2.0
742
88
2
2202
33
14
21
29
1.93
66212242--66212328
29
3.0
29
86
1
122
34
22
14
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66216298--66216406
57
1.9
57
83
7
141
31
29
11
27
1.92
66216320--66216406
29
3.0
29
79
1
104
34
26
12
26
1.92
66221251--66221397
79
1.9
80
79
4
172
24
31
22
21
1.98
66221291--66221404
40
2.8
40
83
0
129
23
28
22
24
1.99
66238020--66238119
43
2.3
43
87
3
139
28
22
28
22
1.99
66241542--66241741
53
3.9
50
81
7
197
22
25
16
36
1.94
66248797--66248827
16
1.9
16
93
0
53
35
19
3
41
1.67
66248794--66248833
20
2.0
20
85
0
53
37
20
2
40
1.66
66249018--66249218
53
3.8
55
80
8
215
22
24
15
36
1.94
66249021--66249217
102
1.9
102
82
6
241
22
24
16
36
1.94
66258748--66258854
42
2.5
42
93
0
187
28
14
33
23
1.93
66258862--66258931
27
2.5
28
83
2
88
25
14
27
32
1.94
66263281--66263463
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99
66270715--66270897
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99
66274132--66274312
40
4.6
40
88
2
240
25
25
23
25
2.00
66285561--66285746
40
4.7
40
86
5
227
25
22
26
25
2.00
66285561--66285779
80
2.8
80
79
12
238
26
22
26
24
2.00
66292080--66292180
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
66292109--66292184
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
66299929--66300029
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
66299958--66300033
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
66304484--66304669
40
4.7
40
86
5
227
25
22
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66304484--66304702
80
2.8
80
79
12
238
26
22
26
24
2.00
66308199--66308229
10
3.1
10
95
0
53
51
16
22
9
1.73
66308630--66308830
80
2.5
78
84
6
249
25
28
21
24
1.99
66308630--66308830
40
5.0
39
82
6
206
25
28
21
24
1.99
66316359--66316389
10
3.1
10
100
0
62
51
19
19
9
1.74
66318432--66318641
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
66326569--66326778
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
66329941--66330123
40
4.6
40
83
3
181
23
26
22
27
1.99
66338004--66338172
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
66348751--66349050
47
6.4
47
92
0
483
28
31
8
32
1.87
66352929--66353200
40
6.8
40
94
0
447
24
30
23
22
1.99
66355050--66355348
47
6.4
47
92
0
483
28
30
8
32
1.86
66355050--66355348
140
2.1
141
91
0
483
28
30
8
32
1.86
66359224--66359494
119
2.3
120
94
1
474
24
30
23
21
1.99
66359224--66359494
40
6.8
40
95
1
474
24
30
23
21
1.99
66361348--66361647
47
6.4
47
92
0
483
28
31
8
32
1.86
66365523--66365794
40
6.8
40
93
0
447
24
29
23
22
1.99
66367643--66367942
47
6.4
47
92
0
483
28
31
8
32
1.86
66374373--66374534
82
2.0
82
90
0
252
38
11
11
38
1.78
66375807--66375968
82
2.0
82
90
0
252
38
11
11
38
1.78
66377241--66377402
82
2.0
82
88
0
243
39
11
10
38
1.76
66378673--66378834
82
2.0
82
90
0
252
39
12
10
37
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66385139--66385323
71
2.6
68
87
10
241
35
16
28
20
1.94
66385188--66385331
71
2.0
71
95
0
261
33
15
29
22
1.94
66387939--66388089
40
3.8
39
81
2
151
25
28
23
23
1.99
66395952--66396103
40
3.8
39
82
1
160
25
28
23
23
2.00
66399607--66399760
84
1.8
84
88
0
236
27
25
16
29
1.97
66399605--66399757
42
3.6
42
76
3
155
28
25
16
29
1.97
66403301--66403333
12
2.8
12
100
0
66
81
6
0
12
0.85
66404394--66404508
51
2.3
50
94
4
198
64
3
20
11
1.41
66404435--66404506
18
4.2
18
66
16
62
66
2
18
12
1.35
66419923--66419996
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770