Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  76  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22329946--22330258
40
7.8
39
85
6
152
24
19
28
27
1.99
22330062--22330286
40
5.6
40
96
0
405
24
20
28
26
1.99
22333133--22333368
96
2.5
96
98
0
454
33
8
28
29
1.87
22333123--22333368
47
5.1
47
92
2
402
34
8
28
28
1.86
22333360--22333559
48
4.2
48
95
0
355
32
6
29
32
1.83
22333599--22333689
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
22335579--22335903
40
8.1
40
86
5
142
25
19
27
27
1.99
22335706--22335930
40
5.6
40
96
0
405
24
20
28
26
1.99
22338821--22339056
96
2.5
96
98
0
454
33
8
28
29
1.87
22338811--22339056
47
5.1
47
92
2
402
34
8
28
28
1.86
22339048--22339247
48
4.2
48
95
0
355
32
6
29
32
1.83
22339287--22339377
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
22344112--22344272
29
5.6
29
81
4
83
25
32
16
26
1.96
22344111--22344272
58
2.8
59
85
3
195
25
32
16
26
1.96
22348719--22348850
48
2.7
51
86
6
166
25
31
16
26
1.96
22350563--22350738
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
22350559--22350730
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
22353686--22353754
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
22353677--22353764
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
22356150--22356322
46
3.8
46
79
14
214
20
21
29
28
1.98
22359216--22359334
43
2.8
42
73
7
114
30
21
13
34
1.92
22376753--22376815
30
2.1
30
93
0
108
57
14
3
25
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22376814--22376872
22
2.7
22
69
10
66
54
5
23
16
1.62
22378130--22378159
12
2.5
12
100
0
60
10
53
0
36
1.35
22379511--22379557
18
2.6
18
100
0
94
31
23
17
27
1.96
22381348--22381387
21
2.0
21
90
5
64
22
30
37
10
1.87
22384503--22384529
13
2.1
13
100
0
54
14
29
33
22
1.94
22387146--22387286
55
2.6
53
73
6
129
14
23
30
31
1.95
22406261--22406340
39
2.1
39
100
0
160
36
7
17
38
1.78
22409970--22410076
42
2.5
42
96
0
196
28
14
33
22
1.94
22410084--22410153
27
2.5
28
86
2
97
27
14
25
32
1.94
22417200--22417306
42
2.5
42
96
0
196
28
14
33
22
1.94
22417314--22417383
27
2.5
28
86
2
97
27
14
25
32
1.94
22427117--22427246
40
3.2
40
84
4
174
23
29
24
22
1.99
22429946--22430112
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
22438430--22438559
40
3.2
40
84
4
174
23
29
24
22
1.99
22441804--22441984
95
1.9
95
88
0
272
34
18
14
32
1.91
22443952--22444076
29
4.2
29
89
8
198
28
15
28
28
1.96
22444177--22444201
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
22452712--22452999
49
6.1
49
89
8
427
28
8
32
29
1.86
22452804--22452883
39
2.1
39
97
0
151
26
10
32
31
1.89
22452712--22453049
137
2.5
133
88
4
484
28
8
32
29
1.87
22452712--22452999
88
3.1
95
86
11
396
28
8
32
29
1.86
22452976--22453035
18
3.3
18
69
17
61
30
3
31
35
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22452965--22453035
36
2.0
36
100
0
142
28
4
33
33
1.77
22453148--22453232
37
2.3
37
95
0
152
24
20
34
21
1.97
22455822--22455947
29
4.2
29
89
9
200
28
15
27
27
1.96
22456048--22456084
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
22460438--22460503
30
2.2
30
94
0
123
21
28
27
22
1.99
22461418--22461553
54
2.5
54
89
0
209
30
26
19
23
1.98
22469274--22469403
54
2.4
54
88
3
190
33
23
18
24
1.97
22479725--22479822
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
22487407--22487504
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
22489934--22489974
19
2.1
20
86
4
57
34
7
7
51
1.58
22494371--22494434
15
4.4
15
84
11
89
10
15
12
60
1.58
22501450--22501819
43
8.6
43
91
0
605
31
31
25
11
1.92
22501812--22501936
38
3.2
38
82
3
133
28
25
22
24
2.00
22513497--22513621
33
3.8
33
89
0
178
28
25
24
21
1.99
22517549--22517596
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
22517642--22517698
20
2.8
20
97
0
105
36
10
21
31
1.87
22517644--22517698
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
22517749--22517867
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
22517749--22517867
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
22518058--22518150
30
3.1
31
93
4
163
39
15
21
23
1.91
22524130--22524177
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
22524221--22524279
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22524225--22524279
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
22524330--22524448
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
22524330--22524448
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
22524640--22524732
30
3.1
31
93
4
163
39
15
21
23
1.91
22530803--22530861
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
22530807--22530861
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
22530912--22531030
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
22530912--22531030
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
22531221--22531284
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
22537477--22537515
6
6.5
6
81
0
51
15
7
0
76
0.99
22544810--22544930
49
2.5
49
98
0
233
31
9
28
30
1.88
22544906--22545083
48
3.7
48
89
1
266
34
6
26
32
1.83
22545138--22545247
37
3.0
37
87
0
175
24
19
30
25
1.98
22551010--22551139
33
3.9
33
81
3
136
29
27
21
21
1.99
22562231--22562268
2
19.0
2
94
0
67
50
2
0
47
1.15
22562907--22562980
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
22571029--22571102
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
22583578--22583761
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
22583618--22583806
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
22591698--22591881
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
22591738--22591926
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
22593565--22593740
50
3.5
49
82
7
185
26
18
26
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22596964--22597001
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
22603360--22603397
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
22607724--22607797
34
2.2
34
85
0
94
21
25
22
29
1.99
22609269--22609476
40
5.2
40
76
5
197
27
25
21
25
1.99
22609292--22609476
80
2.3
81
83
4
232
26
24
22
27
2.00
22617355--22617539
40
4.6
40
80
4
212
25
25
22
26
2.00
22617355--22617539
80
2.3
81
85
4
250
25
25
22
26
2.00
22624835--22624976
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
22624874--22625002
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
22644445--22644619
46
3.8
48
80
12
179
26
20
29
24
1.99
22654827--22654979
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
22662842--22662993
40
3.8
40
79
6
157
25
28
23
23
1.99
22667494--22667712
40
5.5
39
82
8
217
24
26
23
26
2.00
22667494--22667714
80
2.7
79
82
4
264
24
26
23
26
2.00
22675111--22675357
40
6.2
40
83
5
151
23
26
23
26
2.00
22675137--22675356
80
2.7
79
82
3
262
24
26
23
26
2.00
22679228--22679550
47
6.8
46
70
19
166
27
20
29
22
1.98
22679231--22679550
94
3.4
94
79
9
281
27
20
29
23
1.99
22679377--22679559
97
1.9
98
83
7
239
27
20
27
24
1.99
22683935--22683983
22
2.2
21
79
10
53
26
10
2
61
1.39
22687500--22687561
28
2.2
28
85
0
88
32
25
8
33
1.85
22687670--22687759
28
3.2
27
84
7
110
21
23
23
32
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22687680--22687760
27
2.9
28
83
5
92
23
23
20
32
1.98
22687670--22687784
55
2.1
56
80
8
128
20
22
21
35
1.96
22699993--22700171
46
3.9
44
79
10
171
24
18
31
25
1.98
22699992--22700216
92
2.4
94
81
10
273
24
19
31
24
1.98
22704367--22704405
19
2.1
19
90
9
62
30
2
20
46
1.64
22704935--22705058
44
2.9
41
76
9
115
24
18
25
31
1.98
22706772--22706842
35
2.0
35
97
0
133
38
9
2
49
1.51
22709625--22709668
14
3.3
13
81
12
54
47
0
0
52
1.00
22717927--22717953
14
1.9
14
100
0
54
37
11
14
37
1.82
22718985--22719124
26
5.2
26
86
10
201
32
5
25
36
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770