Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  505  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156230535--156230597
29
2.1
30
82
5
74
26
7
6
58
1.50
156230828--156230857
11
2.7
11
89
0
51
40
0
0
60
0.97
156256736--156256786
11
4.7
11
85
4
59
74
7
5
11
1.21
156256736--156256786
22
2.4
21
83
3
66
74
7
5
11
1.21
156257697--156257738
11
4.0
10
77
22
50
78
0
16
4
0.91
156257697--156257738
5
8.0
5
80
19
50
78
0
16
4
0.91
156257697--156257738
16
2.6
16
82
14
59
78
0
16
4
0.91
156257786--156257816
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
156262619--156262647
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
156272449--156272538
40
2.2
40
88
0
135
25
21
11
42
1.85
156272884--156272957
26
2.8
26
87
0
103
29
24
13
32
1.93
156277440--156277540
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
156277528--156277658
29
4.5
29
87
1
174
25
31
16
27
1.96
156286272--156286300
15
1.9
15
100
0
58
44
13
13
27
1.82
156286744--156286846
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
156292999--156293130
29
4.6
29
84
1
140
25
17
32
25
1.97
156300862--156300993
29
4.6
29
84
1
140
25
17
32
25
1.97
156316135--156316199
32
2.0
32
100
0
130
36
21
6
35
1.79
156317265--156317417
43
3.6
43
77
8
143
28
28
18
24
1.98
156320330--156320363
16
2.1
16
100
0
68
55
0
14
29
1.40
156322504--156322606
37
2.8
37
95
0
179
24
32
21
22
1.98
156322747--156322973
48
4.7
48
96
0
409
29
28
7
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156322951--156322994
21
2.1
21
95
0
79
20
29
13
36
1.91
156322903--156323042
69
2.0
69
97
0
262
27
29
8
35
1.86
156322859--156323090
117
2.0
117
97
0
437
29
28
7
34
1.85
156322972--156323358
48
8.1
48
93
4
649
30
28
5
35
1.81
156322807--156323138
165
2.0
165
97
0
619
28
28
7
35
1.84
156325811--156325937
40
3.2
39
76
8
130
22
28
24
24
2.00
156325827--156325977
40
3.8
40
77
6
137
23
26
23
26
2.00
156325827--156325976
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
26
2.00
156328484--156328650
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
156336505--156336633
40
3.2
40
81
6
145
23
22
28
25
1.99
156344700--156344747
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
156344791--156344849
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
156344900--156345018
23
5.0
23
88
9
161
29
21
23
26
1.99
156345209--156345371
38
4.4
38
81
11
214
38
16
22
22
1.93
156345233--156345348
31
3.5
31
76
15
124
42
13
19
24
1.88
156345209--156345348
69
2.0
69
95
0
253
40
15
20
24
1.91
156353956--156354141
40
4.7
40
86
5
218
25
20
26
26
1.99
156361984--156362169
40
4.7
40
86
5
209
26
21
25
26
2.00
156366402--156366448
18
2.6
18
73
10
51
17
19
2
61
1.44
156371693--156371822
27
4.9
27
87
2
174
29
21
7
41
1.81
156371693--156371822
53
2.4
54
87
5
176
29
21
7
41
1.81
156371719--156372073
27
13.1
27
78
7
132
38
19
7
33
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156371648--156371876
80
2.8
80
72
3
190
34
21
7
35
1.83
156371799--156372104
54
5.6
54
74
4
224
40
19
8
31
1.82
156371813--156372019
80
2.6
80
77
6
220
42
19
7
29
1.79
156371840--156371989
27
5.6
27
85
3
162
44
20
8
28
1.79
156372135--156372220
27
3.1
29
85
9
94
31
17
27
23
1.97
156373029--156373199
26
6.7
26
90
2
258
25
22
22
29
1.99
156373347--156373438
42
2.2
42
92
0
148
29
14
21
34
1.93
156373462--156373532
31
2.3
31
97
0
133
33
16
21
28
1.95
156383830--156384039
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
156387574--156387633
27
2.3
26
82
2
66
35
20
21
23
1.96
156387674--156387725
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
156395006--156395064
27
2.3
26
82
5
66
35
20
22
22
1.96
156395033--156395173
67
2.1
67
87
4
201
30
22
28
18
1.97
156395103--156395154
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
156405137--156405166
9
3.3
9
100
0
60
36
10
10
43
1.72
156406900--156407070
45
3.7
45
78
12
161
25
18
32
23
1.97
156411863--156412038
46
3.8
45
78
10
194
21
20
28
28
1.98
156411860--156412031
93
1.8
93
93
0
299
22
20
29
27
1.99
156418559--156418601
18
2.4
18
81
11
54
62
0
6
30
1.21
156423075--156423234
43
3.8
41
76
12
135
29
26
18
26
1.98
156432297--156432423
39
3.3
38
80
6
148
23
22
29
24
1.99
156436565--156436704
40
3.5
40
83
1
165
25
27
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156436565--156436741
39
4.5
39
81
6
160
23
25
22
28
1.99
156436592--156436741
40
3.8
40
82
6
155
23
25
22
29
1.99
156438461--156438492
14
2.4
14
90
10
50
21
9
28
40
1.84
156438504--156438641
51
2.7
51
88
0
195
24
18
26
29
1.98
156440418--156440465
20
2.4
20
92
0
78
27
37
25
10
1.88
156441119--156441219
42
2.4
44
80
8
111
28
17
22
30
1.97
156443221--156443395
31
5.7
31
87
5
234
29
25
16
28
1.96
156443601--156443707
25
4.4
24
92
3
144
24
23
24
28
2.00
156443614--156443707
25
3.8
25
95
1
163
24
23
26
25
2.00
156444515--156444598
27
3.1
27
86
3
98
21
25
22
30
1.98
156444660--156444740
29
2.9
28
83
7
94
34
9
14
40
1.80
156444637--156444955
27
11.8
27
78
4
259
31
9
19
40
1.83
156444947--156445077
27
4.9
27
89
0
172
41
7
22
29
1.81
156444921--156445077
54
2.9
54
84
0
161
39
7
21
31
1.82
156444750--156444996
134
1.8
134
80
3
300
31
8
20
38
1.83
156444948--156445104
81
1.9
81
81
0
188
38
8
22
30
1.83
156448567--156448667
40
2.5
40
90
3
159
27
29
18
23
1.98
156456679--156456779
40
2.5
40
95
3
177
27
30
19
21
1.98
156460948--156461153
55
3.8
54
79
2
218
20
22
17
38
1.93
156468462--156468591
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
156468478--156468629
40
3.8
40
78
6
148
22
26
23
27
1.99
156468478--156468627
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156476481--156476610
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
156476497--156476648
40
3.8
40
78
6
148
22
26
23
27
1.99
156476497--156476646
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
156486836--156487001
40
4.2
40
81
3
176
24
27
21
26
1.99
156487821--156487866
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
156494784--156494950
40
4.2
40
84
2
194
25
26
21
26
1.99
156495773--156495818
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
156499412--156499663
40
6.2
40
77
6
182
30
26
15
27
1.96
156499412--156499648
42
5.8
42
80
3
214
29
26
16
27
1.96
156499412--156499603
82
2.3
82
89
0
285
29
27
16
27
1.97
156500935--156501097
39
4.2
39
95
0
272
20
21
30
26
1.98
156500935--156501135
39
5.2
39
90
1
244
20
22
30
26
1.98
156500935--156501162
78
2.9
78
85
4
230
20
21
30
27
1.98
156509355--156509381
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
156517381--156517438
28
2.1
28
90
0
89
50
0
20
29
1.49
156519528--156519565
20
2.1
19
85
14
53
76
0
15
7
1.01
156520871--156520971
28
3.5
28
84
4
103
29
13
27
28
1.95
156520900--156520971
29
2.5
29
91
6
112
29
13
27
29
1.95
156523594--156523762
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
156531776--156531944
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
156539782--156539949
40
4.2
40
80
4
171
23
25
22
28
1.99
156585941--156586150
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156588823--156588893
24
3.0
24
85
0
97
26
35
4
33
1.76
156595194--156595311
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
156595162--156595325
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
156597453--156597512
30
2.0
30
86
0
84
38
6
25
30
1.81
156605124--156605207
29
2.9
29
89
0
123
21
25
15
38
1.92
156605163--156605218
29
1.9
29
88
0
85
23
28
14
33
1.94
156611533--156611602
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
156611557--156611614
27
2.1
27
84
6
73
31
15
22
31
1.95
156614033--156614065
12
2.6
13
85
9
50
9
45
0
45
1.35
156617228--156617292
28
2.3
28
91
0
103
32
27
9
30
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770