Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  140  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
41228204--41228355
79
1.9
79
81
7
184
25
20
27
26
1.99
41236222--41236324
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
41238345--41238528
40
4.6
39
80
9
185
25
21
27
25
1.99
41238378--41238562
79
2.3
78
78
9
187
27
21
25
25
1.99
41245343--41245373
2
15.5
2
93
0
53
48
0
0
51
1.00
41247770--41247822
28
1.9
28
84
3
72
30
18
26
24
1.98
41250433--41250845
209
2.0
209
92
0
691
25
14
33
26
1.94
41252525--41252577
28
1.9
28
84
3
72
30
18
26
24
1.98
41254935--41254979
18
2.4
18
85
3
54
46
4
2
46
1.35
41254949--41254988
18
2.2
18
95
0
71
40
7
0
52
1.30
41256492--41256519
6
4.7
6
100
0
56
0
28
35
35
1.58
41257555--41257582
6
4.7
6
100
0
56
17
50
0
32
1.47
41257823--41257894
16
4.5
15
81
6
63
43
8
20
27
1.81
41258042--41258091
26
2.0
26
88
4
75
42
0
4
54
1.19
41258067--41258192
57
2.1
58
81
10
139
50
3
0
44
1.26
41258155--41258217
12
5.4
12
73
21
55
49
3
0
47
1.17
41269564--41269725
29
5.5
29
92
2
243
25
24
13
36
1.92
41269564--41269725
59
2.7
58
90
2
243
25
24
13
36
1.92
41272646--41272840
49
3.9
49
85
2
264
26
18
26
28
1.98
41272648--41272840
100
1.9
100
93
0
332
26
18
25
28
1.98
41279678--41279863
67
2.9
64
76
11
200
29
17
30
23
1.97
41288672--41288860
41
5.1
41
58
29
102
33
17
28
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
41288642--41288874
71
3.3
71
98
1
443
35
17
28
18
1.94
41291496--41291545
19
2.8
18
77
19
59
40
48
2
10
1.48
41293908--41293979
37
1.9
37
94
0
126
27
30
19
22
1.98
41294125--41294261
50
2.8
49
90
6
224
31
26
6
35
1.82
41294231--41294424
47
4.1
47
87
0
262
26
29
11
32
1.91
41297334--41297363
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
41297875--41297939
24
2.7
25
73
20
66
33
7
4
53
1.50
41307573--41307786
107
2.0
107
95
0
383
33
21
18
26
1.96
41309952--41310431
73
6.3
73
75
13
349
30
16
19
33
1.94
41310197--41310386
72
2.5
77
85
9
239
33
16
19
30
1.94
41309947--41310599
238
2.7
232
78
13
624
28
16
19
34
1.94
41310269--41310688
86
4.9
87
79
10
445
28
18
18
34
1.95
41310580--41310609
13
2.3
13
94
0
51
16
10
6
66
1.41
41310269--41310686
172
2.4
171
87
3
592
28
18
18
34
1.95
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Period
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23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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