Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  358  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109919913--109920052
54
2.6
54
85
4
192
38
22
8
30
1.84
109919913--109920165
81
3.1
80
71
13
201
38
20
9
32
1.84
109919913--109920080
54
3.1
52
80
8
151
38
22
8
29
1.85
109920204--109920286
27
3.1
26
86
5
112
31
19
26
22
1.98
109922978--109923128
40
3.8
40
77
13
141
25
24
27
22
2.00
109923015--109923144
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
109930788--109931006
123
1.8
120
82
6
280
31
11
23
33
1.90
109930965--109931115
40
3.8
40
77
11
141
26
24
27
21
2.00
109931002--109931131
40
3.2
40
79
2
154
23
23
28
23
2.00
109930964--109931131
80
2.1
80
82
6
207
26
23
27
22
2.00
109933459--109933573
55
2.1
55
80
3
124
23
25
31
20
1.98
109938018--109938462
48
9.3
48
96
0
773
35
6
27
31
1.82
109938603--109938702
37
2.7
37
96
0
182
24
21
31
24
1.98
109953405--109953580
46
3.8
46
77
10
187
21
19
30
28
1.98
109953402--109953572
93
1.8
93
91
0
279
21
20
30
27
1.98
109958883--109959058
46
3.8
45
78
10
185
22
19
27
29
1.98
109958880--109959050
93
1.8
93
88
2
263
22
20
28
28
1.99
109972222--109972282
30
2.0
30
100
0
122
40
13
16
29
1.86
109973130--109973280
27
5.6
27
87
0
194
39
22
8
29
1.84
109973130--109973337
27
7.7
27
80
4
159
37
22
8
30
1.84
109973327--109973594
27
9.9
27
83
0
302
36
16
20
26
1.94
109973983--109974047
22
3.0
22
77
8
69
23
26
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109974389--109974437
25
2.0
25
83
0
62
24
22
8
44
1.79
109974399--109974477
37
2.1
37
85
0
104
22
18
12
45
1.84
109974405--109974475
19
3.8
19
72
10
65
21
19
12
46
1.83
109974414--109974492
37
2.1
37
88
0
113
20
17
12
49
1.79
109976509--109976621
48
2.3
49
93
3
194
23
17
28
30
1.97
109978192--109978339
74
2.0
74
92
2
244
35
20
21
22
1.96
109981334--109981464
29
4.5
29
91
1
192
28
15
31
25
1.95
109981390--109981524
29
4.7
29
84
1
146
24
17
34
24
1.96
109981334--109981524
58
3.3
59
82
4
167
26
16
32
24
1.96
109989339--109989440
29
3.5
29
95
0
186
29
14
29
26
1.95
109989339--109989500
29
5.6
29
84
2
107
26
16
32
25
1.96
109989335--109989461
58
2.2
59
85
4
179
29
14
30
25
1.95
109990937--109991014
29
2.7
30
80
9
90
25
14
32
28
1.94
109998300--109998471
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
109998292--109998467
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
110000848--110000936
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
110000848--110000927
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
110000859--110000936
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
110003442--110003613
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
110003434--110003609
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
110008979--110009039
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
110014756--110014815
30
2.1
28
90
6
93
10
13
20
56
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110014756--110014800
15
3.0
15
78
12
56
11
13
20
55
1.68
110016923--110017106
48
3.8
48
96
1
323
32
6
26
34
1.82
110016926--110017263
47
7.1
47
87
3
241
31
7
29
31
1.86
110016926--110017216
96
3.1
96
82
10
298
31
7
28
31
1.86
110017080--110017284
47
4.4
46
88
2
275
32
8
30
28
1.87
110017080--110017284
94
2.2
94
91
1
322
32
8
30
28
1.87
110019629--110019829
40
5.1
40
89
0
278
24
21
27
25
1.99
110022972--110023107
48
2.8
48
89
2
200
30
8
27
33
1.86
110023081--110023285
47
4.4
47
89
0
302
32
9
30
27
1.88
110027285--110027457
46
3.8
45
77
11
172
21
18
29
30
1.97
110027278--110027449
93
1.8
93
88
2
265
21
19
29
29
1.97
110031963--110032107
40
3.6
40
91
1
202
24
22
28
24
1.99
110031966--110032123
80
2.0
80
83
2
201
23
20
28
27
1.99
110040024--110040147
40
3.1
39
78
5
124
25
22
26
25
2.00
110042515--110042556
22
1.9
22
90
0
66
21
7
23
47
1.75
110042961--110043082
43
2.8
43
83
4
149
23
18
25
32
1.97
110048279--110048307
14
2.0
15
93
6
51
13
10
13
62
1.55
110051938--110052081
55
2.6
55
77
0
135
26
27
28
17
1.98
110052122--110052146
13
1.9
13
100
0
50
16
28
40
16
1.89
110065221--110065444
40
5.6
40
80
10
246
25
27
21
25
1.99
110065221--110065445
79
2.8
79
82
7
285
26
27
21
25
1.99
110068483--110068517
17
1.9
18
88
11
54
45
28
0
25
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110068956--110069083
43
3.0
43
85
3
152
34
27
13
25
1.93
110068982--110069090
41
2.6
42
89
2
157
35
30
12
21
1.91
110069617--110069675
29
2.2
26
82
14
66
30
25
3
40
1.72
110075963--110076134
46
3.7
46
75
13
190
29
27
20
22
1.98
110076556--110076615
30
2.0
30
86
0
84
28
25
10
36
1.88
110081728--110081803
37
2.1
37
94
0
134
27
11
27
32
1.92
110082698--110082735
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
110088721--110088779
29
2.2
26
82
14
66
30
25
3
40
1.72
110099425--110099555
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
110099425--110099555
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
110108585--110108704
63
1.9
62
93
1
204
27
17
23
31
1.97
110110838--110110862
13
1.9
13
100
0
50
32
16
16
36
1.90
110112371--110112818
48
9.6
48
84
6
586
33
8
27
30
1.86
110112592--110112662
34
2.1
34
100
0
142
33
8
25
32
1.86
110112544--110112806
82
3.0
82
82
14
355
34
7
26
31
1.84
110112496--110112758
130
2.0
130
98
0
508
33
7
26
31
1.85
110112448--110112806
178
2.0
178
96
0
664
34
7
26
31
1.85
110112400--110112818
226
1.9
226
96
0
775
34
7
26
31
1.85
110112865--110112948
37
2.3
37
97
0
159
26
19
32
22
1.97
110120588--110120688
28
3.6
27
79
10
98
28
28
14
27
1.96
110131471--110131569
28
3.5
29
83
6
114
30
27
15
27
1.96
110134213--110134253
21
2.0
21
86
9
59
21
41
12
24
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110145098--110145146
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
110145969--110146135
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
110161044--110161104
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
110163761--110163872
27
4.1
27
75
7
102
39
21
22
16
1.92
110165113--110165155
22
2.0
22
85
0
59
67
2
23
6
1.27
110167991--110168173
40
4.6
40
82
4
181
27
22
26
23
1.99
110168033--110168142
39
2.8
38
87
6
148
26
22
28
22
1.99
110175990--110176091
40
2.5
41
83
1
125
30
23
24
21
1.99
110183918--110184084
40
4.2
39
80
4
174
24
26
22
25
2.00
110189907--110190068
40
4.1
40
82
3
200
22
21
27
28
1.99
110190311--110190352
22
1.9
22
85
9
59
33
9
14
42
1.78
110195349--110195561
47
4.6
44
77
13
162
23
29
19
28
1.98
110195297--110195612
94
3.4
94
79
9
344
22
29
19
28
1.98
110198362--110198431
23
2.9
24
78
6
79
21
24
20
34
1.97
110200469--110200693
40
5.7
40
87
2
276
23
21
27
27
1.99
110200469--110200719
40
6.3
40
85
1
260
23
21
27
27
1.99
110202084--110202131
20
2.4
20
86
6
71
25
6
22
45
1.75
110204092--110204191
24
4.0
24
81
10
119
40
18
21
21
1.92
110204090--110204190
52
1.9
52
89
0
157
39
17
21
20
1.92
110204092--110204203
52
2.2
52
86
0
152
40
16
21
21
1.92
110209263--110209441
48
3.7
48
87
0
250
28
31
15
24
1.96
110210297--110210339
21
2.0
21
100
0
86
23
27
0
48
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110212293--110212583
24
12.1
24
97
0
501
35
25
18
20
1.95
110220349--110220639
24
12.1
24
97
0
501
35
25
18
20
1.95
110223704--110223744
2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
110231212--110231236
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
110237805--110237928
48
2.6
47
87
5
176
29
30
16
23
1.97
110238425--110238453
13
2.2
13
100
0
58
27
24
34
13
1.93
110239053--110239229
40
4.4
40
80
6
200
24
23
26
25
2.00
110239053--110239229
80
2.2
80
85
5
225
24
23
26
25
2.00
110241863--110241991
51
2.5
51
90
6
199
31
14
26
27
1.95
110242996--110243020
13
1.9
13
100
0
50
16
28
24
32
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770