Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  209  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62573921--62574090
92
1.8
93
88
1
261
28
28
20
22
1.99
62573964--62574106
46
3.1
46
66
23
104
29
27
19
23
1.98
62576020--62576099
30
2.6
31
81
11
94
55
15
18
11
1.69
62576022--62576099
15
5.2
15
75
9
70
55
15
17
11
1.69
62579014--62579185
93
1.8
93
92
0
290
27
28
20
22
1.99
62579007--62579182
46
3.8
46
82
12
216
28
28
20
22
1.98
62583159--62583244
42
2.0
42
82
4
102
23
15
15
46
1.83
62583366--62583390
7
3.6
7
100
0
50
60
0
0
40
0.97
62583385--62583447
22
2.8
22
82
2
81
23
0
3
73
0.98
62583389--62583424
15
2.4
15
100
0
72
19
0
5
75
1.00
62583414--62583469
20
2.6
22
78
16
64
23
0
3
73
0.99
62583385--62583474
7
11.9
8
68
17
50
26
0
4
68
1.08
62584213--62584245
14
2.3
15
89
5
50
36
45
3
15
1.61
62584234--62584281
15
3.3
15
76
5
53
45
33
0
20
1.52
62584237--62584336
22
4.7
21
68
9
58
45
29
3
23
1.68
62584436--62584556
7
17.0
7
68
12
50
42
35
1
20
1.62
62584562--62584594
15
2.3
14
94
5
57
51
21
0
27
1.48
62585004--62585265
116
2.3
115
84
5
325
35
18
17
27
1.94
62585205--62585292
40
2.2
39
82
4
104
36
11
19
32
1.87
62585218--62585304
40
2.2
40
85
2
113
33
13
22
29
1.93
62585075--62585402
155
2.1
154
80
8
378
34
17
17
30
1.93
62585345--62585482
40
3.5
39
80
6
154
23
19
17
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62585085--62585372
155
1.9
156
86
4
379
36
17
17
28
1.93
62588634--62588794
29
5.6
29
86
7
186
26
26
15
31
1.96
62590716--62590810
30
3.2
30
89
0
136
15
35
28
20
1.93
62592363--62592716
47
7.7
45
78
12
232
30
26
14
27
1.96
62592416--62592720
47
6.2
48
80
7
305
30
27
14
27
1.95
62592431--62592699
93
2.8
95
79
8
276
28
27
16
27
1.97
62592619--62592720
53
1.9
53
88
4
152
31
29
14
24
1.95
62595927--62595971
20
2.4
18
85
7
54
37
15
0
46
1.46
62595944--62595989
19
2.5
18
85
3
56
34
17
0
47
1.48
62598157--62598241
31
2.8
32
83
7
122
24
23
16
35
1.95
62600264--62600486
79
2.8
80
84
9
276
25
22
26
25
2.00
62600264--62600488
119
1.9
120
82
8
289
24
22
27
25
2.00
62600264--62600488
40
5.7
40
86
5
280
24
22
27
25
2.00
62600317--62600521
79
2.6
78
83
7
218
26
21
27
24
2.00
62604434--62604487
26
2.1
26
100
0
108
24
7
29
38
1.82
62607280--62607373
42
2.2
43
83
12
115
27
21
24
26
1.99
62610441--62610495
24
2.3
23
82
14
67
29
36
16
18
1.92
62617157--62617275
24
5.0
24
87
9
163
26
23
21
28
1.99
62617157--62617275
47
2.5
48
87
8
163
26
23
21
28
1.99
62617326--62617385
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
62617428--62617475
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
62619418--62619457
20
1.9
22
85
10
57
42
10
0
47
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62621549--62621612
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
62621804--62621943
24
6.0
24
86
9
182
26
22
22
27
1.99
62621818--62621943
45
2.7
47
86
9
177
26
23
22
28
1.99
62621805--62621943
69
2.0
69
87
5
201
25
23
23
28
1.99
62621994--62622053
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
62622096--62622143
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
62624084--62624123
20
1.9
22
85
10
57
42
10
0
47
1.37
62626216--62626279
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
62626471--62626610
24
6.0
24
86
9
182
26
22
22
27
1.99
62626485--62626610
45
2.7
47
86
9
177
26
23
22
28
1.99
62626472--62626610
69
2.0
69
87
5
201
25
23
23
28
1.99
62626661--62626720
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
62626763--62626810
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
62628752--62628791
20
1.9
22
85
10
57
42
10
0
47
1.37
62630884--62630947
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
62631139--62631279
24
6.0
24
85
10
175
26
23
22
27
2.00
62631153--62631278
45
2.7
47
85
10
168
26
23
22
27
1.99
62631140--62631279
69
2.0
70
86
6
196
25
23
22
27
2.00
62631330--62631389
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
62631432--62631479
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
62633421--62633460
20
1.9
22
85
10
57
42
10
0
47
1.37
62635554--62635617
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62635809--62635949
24
6.0
24
85
10
175
26
23
22
27
2.00
62635823--62635948
45
2.7
47
85
10
168
26
23
22
27
1.99
62635810--62635949
69
2.0
70
86
6
196
25
23
22
27
2.00
62636000--62636059
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
62636102--62636149
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
62640220--62640283
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
62640474--62640591
24
5.0
24
85
11
154
26
22
22
28
1.99
62640474--62640591
46
2.5
48
85
10
154
26
22
22
28
1.99
62640642--62640701
20
3.0
20
87
0
93
33
18
11
36
1.87
62641065--62641096
11
2.9
11
95
0
55
12
50
18
18
1.78
62642730--62642769
20
1.9
22
85
10
57
42
10
0
47
1.37
62643055--62643189
56
2.4
56
88
2
191
34
24
11
28
1.91
62643166--62643246
42
1.9
42
94
0
144
25
24
14
34
1.94
62648085--62648304
40
5.6
41
81
7
251
25
24
25
24
2.00
62654929--62655114
40
4.7
40
88
5
218
25
21
26
26
1.99
62654982--62655137
80
2.0
79
82
8
192
26
20
26
26
1.99
62664504--62664687
40
4.6
40
81
2
217
25
23
26
25
2.00
62673480--62673689
40
5.2
40
95
1
348
30
22
21
24
1.99
62673480--62673693
42
5.2
42
94
2
364
31
22
21
25
1.98
62673480--62673693
82
2.6
83
92
4
362
31
22
21
25
1.98
62677725--62677759
14
2.5
14
90
0
52
34
17
20
28
1.95
62681244--62681268
12
2.1
12
100
0
50
36
0
16
48
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62682682--62682854
46
3.7
46
79
10
208
21
20
27
29
1.98
62682679--62682849
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
62683077--62683114
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
62690266--62690391
46
2.7
46
92
0
207
21
21
26
30
1.98
62690616--62690653
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
62693477--62693545
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
62695174--62695211
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
62701488--62701556
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
62703185--62703222
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
62709282--62709318
12
3.1
12
84
0
56
29
8
13
48
1.71
62725753--62725883
56
2.3
56
86
2
174
34
20
13
31
1.92
62728320--62728847
27
19.7
27
80
3
494
39
19
9
31
1.83
62728320--62728756
134
3.3
135
79
4
427
40
18
8
32
1.81
62731420--62731596
46
3.9
44
77
11
176
22
20
28
28
1.99
62731417--62731588
93
1.8
93
89
0
272
21
21
29
27
1.99
62736923--62737096
46
3.8
44
79
4
168
22
19
29
28
1.98
62739950--62740013
28
2.3
28
88
0
92
20
14
35
29
1.92
62740330--62740825
27
18.6
27
79
4
443
39
18
9
32
1.82
62740355--62740787
80
5.4
80
80
7
443
39
18
8
33
1.81
62740355--62740825
53
8.8
54
81
6
449
40
18
8
32
1.81
62740726--62740853
54
2.4
54
79
7
127
39
17
12
30
1.86
62744706--62744829
27
4.6
27
82
8
128
39
23
8
28
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62744727--62744860
27
5.0
26
78
12
128
38
22
9
29
1.86
62744706--62744860
81
1.9
80
79
8
172
39
23
9
27
1.86
62744698--62744874
54
3.3
54
81
5
207
39
22
9
28
1.84
62744852--62745046
27
7.2
27
88
0
246
31
22
6
40
1.79
62744852--62745049
81
2.4
81
86
0
279
31
22
6
39
1.78
62745282--62745333
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
62745585--62745653
25
2.8
25
86
0
102
18
20
13
47
1.81
62745551--62745653
6
16.7
6
69
16
50
20
19
13
46
1.83
62746338--62746790
27
16.9
27
81
4
477
38
19
9
32
1.83
62746744--62746805
27
2.3
27
91
5
99
40
9
12
37
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770