Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  549  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
170693100--170693288
24
8.0
24
89
4
269
29
22
21
26
1.99
170693100--170693267
47
3.6
47
91
3
284
29
22
20
26
1.99
170693100--170693288
94
2.0
96
90
4
303
29
22
21
26
1.99
170693482--170693545
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
170695846--170695914
6
11.3
6
73
14
61
47
14
18
18
1.82
170695848--170695948
37
2.7
36
86
6
121
44
13
20
20
1.86
170695891--170695970
31
2.6
31
79
0
88
45
12
20
22
1.84
170696089--170696148
27
2.3
26
82
2
66
36
20
21
21
1.95
170696116--170696255
67
2.0
67
83
5
172
30
22
27
20
1.98
170696187--170696238
27
2.0
26
84
3
68
32
21
26
19
1.97
170696499--170696729
27
8.7
26
84
6
266
25
20
18
36
1.95
170696500--170696722
53
4.2
54
88
3
290
24
21
18
36
1.95
170696496--170696722
80
2.8
80
91
2
348
25
21
18
35
1.95
170696774--170697058
134
2.1
135
79
3
299
30
9
21
39
1.85
170696846--170697079
27
8.7
27
86
0
317
29
8
21
40
1.83
170696820--170697095
107
2.6
105
82
3
327
30
8
21
39
1.83
170698398--170698450
26
2.0
26
100
0
106
43
7
7
41
1.61
170700333--170700377
20
2.2
20
88
0
63
48
2
13
35
1.54
170702062--170702086
13
1.9
13
100
0
50
20
24
40
16
1.91
170703464--170703585
37
3.3
37
97
0
226
21
33
19
25
1.97
170703687--170703901
49
4.4
49
95
0
358
28
32
9
28
1.89
170708241--170708348
43
2.5
42
78
8
103
29
18
22
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
170708272--170708354
43
1.9
43
85
4
114
26
16
24
32
1.96
170714327--170714392
33
2.0
33
100
0
132
27
21
27
24
1.99
170720779--170720957
40
4.4
40
84
2
207
22
26
23
26
2.00
170731080--170731106
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
170731223--170731278
29
1.9
29
88
0
85
50
1
0
48
1.11
170731790--170731840
20
2.8
17
78
16
57
45
0
0
54
0.99
170731790--170731829
17
2.4
17
87
4
55
42
0
0
57
0.98
170742656--170742758
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
170748067--170748238
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
170748060--170748235
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
170764423--170764572
40
3.8
40
78
8
139
26
22
28
23
1.99
170765948--170766019
29
2.5
29
86
0
90
31
33
13
20
1.92
170769258--170769416
43
3.7
43
74
12
139
31
25
15
27
1.95
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20
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Copy
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Score
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29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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1.95
Indices
Period
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Copy
Number
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16
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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