Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  202  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60499412--60499659
27
9.2
27
86
3
302
41
10
21
26
1.86
60499402--60499690
54
5.4
54
80
4
280
39
11
22
27
1.88
60501675--60501776
6
16.8
6
72
17
68
51
14
12
20
1.75
60501675--60501776
30
3.4
30
84
1
132
51
14
12
20
1.75
60501894--60501967
27
2.8
26
81
6
85
36
20
24
18
1.95
60502132--60502190
22
2.7
22
81
0
64
32
22
25
20
1.98
60502278--60502360
27
3.1
26
86
5
103
39
21
19
19
1.92
60502559--60502754
27
7.3
27
81
3
225
26
19
18
35
1.95
60502561--60502754
81
2.4
81
85
1
255
26
19
17
36
1.94
60502759--60503033
27
10.2
27
83
3
311
40
10
21
27
1.85
60502759--60503064
54
5.7
54
78
5
251
39
10
22
28
1.86
60502759--60503033
81
3.4
81
84
3
347
40
10
21
27
1.85
60504035--60504158
46
2.7
45
85
9
155
25
29
17
26
1.98
60504043--60504251
46
4.5
46
75
13
130
23
29
18
28
1.98
60508290--60508449
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
60523411--60523445
13
2.7
13
83
16
54
17
5
8
68
1.35
60534278--60534523
126
2.0
125
88
0
366
19
30
19
30
1.97
60546319--60546377
30
2.0
30
100
0
118
44
16
20
18
1.87
60546788--60546812
12
2.1
12
100
0
50
16
8
16
60
1.58
60549134--60549166
3
10.7
3
93
6
57
63
0
0
36
0.95
60550740--60550914
47
3.7
47
77
6
167
30
18
29
20
1.97
60550706--60551060
94
3.8
92
79
9
348
29
19
28
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60550797--60551062
47
5.7
44
75
13
171
29
19
28
22
1.98
60560686--60560855
46
3.7
47
77
15
176
21
21
28
28
1.99
60563772--60563835
15
4.4
15
84
11
89
10
15
12
60
1.58
60566206--60566381
46
3.8
46
75
12
180
21
19
28
30
1.98
60566203--60566372
93
1.8
93
90
0
277
21
20
28
29
1.98
60575135--60575159
12
2.1
12
100
0
50
16
8
16
60
1.58
60581828--60581881
23
2.5
22
84
6
65
27
5
0
66
1.13
60584447--60584615
40
4.2
40
81
6
173
25
26
22
25
2.00
60592441--60592607
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
60596169--60596386
40
5.5
39
84
6
226
22
26
24
26
2.00
60604268--60604486
40
5.5
39
83
4
217
22
25
24
27
2.00
60605194--60605219
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
60608262--60608413
40
3.8
40
96
0
268
25
28
20
25
1.99
60610536--60610757
47
4.7
47
88
5
286
29
30
7
32
1.85
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4.6
29
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0
147
26
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27
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203
28
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23
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48
2.3
47
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7
128
27
17
28
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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368
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
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Score
A
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30
8
18
42
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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