Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  173  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51633176--51633312
46
3.1
44
82
10
154
25
29
17
27
1.97
51639179--51639362
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
51647280--51647463
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
51649652--51649701
20
2.5
20
93
0
82
42
32
4
22
1.72
51650121--51650226
40
2.6
41
85
2
126
26
17
26
29
1.98
51650150--51650515
153
2.4
154
81
3
398
30
22
21
26
1.99
51651237--51651288
25
2.1
24
82
3
59
38
3
3
53
1.37
51651304--51651362
28
2.1
28
87
6
84
25
0
22
52
1.47
51651501--51651530
14
2.1
14
93
0
51
16
0
23
60
1.36
51652006--51652052
7
6.7
7
92
0
76
4
0
51
44
1.21
51651994--51652052
14
4.2
14
85
8
75
5
0
45
49
1.24
51651965--51652060
7
13.6
7
79
9
61
10
0
41
47
1.37
51651994--51652052
21
2.8
21
84
0
82
5
0
45
49
1.24
51653574--51653643
24
2.9
24
72
18
72
40
4
10
45
1.57
51655513--51655645
69
1.9
70
89
1
205
37
12
12
37
1.81
51656805--51656921
9
12.3
9
77
10
108
45
21
0
32
1.58
51656811--51656888
39
2.0
39
94
0
138
46
20
0
33
1.51
51656807--51656919
57
2.0
57
87
0
163
46
22
0
30
1.58
51662457--51662504
21
2.3
21
85
0
60
22
16
56
4
1.58
51664765--51664811
16
2.8
16
75
18
51
40
4
0
55
1.19
51669018--51669067
19
2.5
20
90
6
75
56
8
0
36
1.29
51669243--51669276
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51670659--51670700
22
1.9
22
85
9
59
21
21
11
45
1.84
51676373--51676733
49
7.6
49
76
9
225
24
27
18
28
1.98
51676513--51676735
48
4.7
49
80
11
232
23
26
19
30
1.98
51676516--51676735
94
2.3
94
86
3
300
23
26
19
30
1.98
51676374--51676735
142
2.6
140
81
8
380
24
27
19
28
1.98
51676477--51676735
94
2.8
93
83
5
292
24
27
18
28
1.98
51679772--51679821
26
1.9
26
87
0
73
28
12
14
46
1.79
51683151--51683179
14
2.1
14
100
0
58
51
6
0
41
1.28
51683470--51683559
33
2.7
33
70
10
85
28
11
37
22
1.88
51685699--51685740
3
14.0
3
100
0
84
66
0
0
33
0.92
51686372--51686410
19
2.1
18
85
4
51
2
35
2
58
1.25
51695205--51695248
23
1.9
23
85
0
61
36
6
11
45
1.67
51698591--51698726
26
5.2
26
90
0
218
33
2
23
41
1.67
51698591--51698726
52
2.6
52
96
0
245
33
2
23
41
1.67
51703741--51703858
58
2.0
58
95
0
209
50
10
16
22
1.74
51704073--51704117
22
2.0
23
86
4
65
64
0
2
33
1.06
51705121--51705168
15
3.2
15
71
11
53
33
14
12
39
1.84
51706609--51706635
2
13.5
2
100
0
54
0
48
0
51
1.00
51709632--51709672
22
1.9
21
85
5
55
48
4
31
14
1.65
51716230--51716254
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
51716254--51716291
2
19.0
2
100
0
76
0
0
50
50
1.00
51716710--51716774
26
2.5
26
82
0
76
24
20
13
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51728483--51728519
13
2.8
13
95
0
65
35
16
8
40
1.78
51732656--51732849
50
3.9
48
82
6
210
27
28
18
24
1.98
51732668--51732853
101
1.9
98
85
5
257
27
29
17
24
1.97
51734976--51735040
15
4.4
15
78
16
73
63
13
13
9
1.53
51734976--51735044
30
2.3
31
83
14
92
60
17
13
8
1.56
51738050--51738244
50
3.9
48
82
5
210
28
28
18
24
1.98
51738062--51738248
101
1.9
99
85
4
259
28
29
17
24
1.97
51741370--51741410
20
2.0
20
85
0
55
63
2
2
31
1.20
51748533--51748592
21
2.8
22
87
10
88
35
28
23
13
1.92
51748518--51748604
21
4.0
23
79
10
83
39
25
20
14
1.91
51756787--51756875
35
2.6
32
78
16
90
69
0
1
29
0.95
51756803--51756873
19
3.9
20
75
22
75
70
0
0
29
0.88
51756797--51756859
23
2.7
22
78
16
65
68
0
0
31
0.90
51756802--51756872
33
2.2
33
89
5
108
70
0
0
29
0.88
51756799--51756874
13
6.7
12
73
21
74
71
0
0
28
0.87
51761990--51762035
3
15.7
3
95
4
85
65
0
0
34
0.93
51761990--51762035
23
2.0
23
95
4
83
65
0
0
34
0.93
51766802--51766854
15
3.4
15
80
15
63
52
1
0
45
1.11
51767237--51767296
30
2.0
30
90
0
93
26
1
13
58
1.45
51767419--51767451
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
51768865--51768914
24
2.1
24
88
0
73
38
8
20
34
1.82
51769520--51769591
28
2.5
29
90
2
110
41
22
23
12
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51769502--51769683
79
2.3
79
82
0
213
39
20
25
14
1.91
51777322--51777348
14
1.9
14
100
0
54
11
22
7
59
1.56
51796107--51796148
17
2.3
19
76
20
52
26
16
16
40
1.90
51796114--51796151
17
2.2
17
95
0
67
21
13
18
47
1.82
51796862--51797234
187
2.0
187
94
0
647
35
22
12
29
1.91
51807005--51807048
23
2.0
22
86
4
61
40
15
6
36
1.74
51808372--51808525
43
3.6
43
74
6
170
27
18
25
28
1.98
51809730--51809763
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
51809815--51809839
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
51817580--51817629
26
1.9
26
95
0
91
40
12
20
28
1.87
51826353--51826503
71
2.1
71
100
0
302
31
17
24
26
1.97
51827053--51827084
3
10.7
3
100
0
64
31
0
0
68
0.90
51827958--51827999
10
4.2
10
85
11
59
38
0
23
38
1.55
51832468--51832508
21
1.9
22
90
5
66
14
4
0
80
0.87
51835376--51835425
26
1.9
26
83
0
64
40
22
2
36
1.65
51836782--51837003
40
5.6
41
88
2
294
26
27
22
23
2.00
51840759--51840909
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
22
2.00
51840796--51840925
40
3.2
40
80
2
154
23
23
27
24
2.00
51854995--51855060
29
2.2
29
86
5
87
33
15
27
24
1.95
51858173--51858516
169
2.0
170
94
2
602
33
10
13
42
1.78
51860949--51861211
115
2.3
115
93
0
445
37
13
19
29
1.90
51861272--51861317
24
1.9
24
90
0
74
30
13
23
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51865881--51865996
50
2.4
47
81
11
137
28
22
13
35
1.92
51873617--51873738
46
2.6
47
84
5
147
26
22
14
36
1.93
51885504--51885663
29
5.5
30
88
8
213
33
14
25
26
1.94
51885504--51885663
59
2.8
57
88
4
214
33
14
25
26
1.94
51893558--51893717
29
5.5
30
88
8
213
33
14
25
26
1.94
51893558--51893717
59
2.8
57
88
4
214
33
14
25
26
1.94
51895288--51895493
80
2.6
80
82
5
238
25
22
26
25
2.00
51895287--51895493
40
5.2
40
82
5
213
26
22
26
25
2.00
51903246--51903427
40
4.6
40
81
7
167
28
23
25
23
2.00
51903285--51903450
80
2.1
80
85
4
219
25
23
27
24
2.00
51903284--51903450
40
4.2
39
80
7
176
25
23
26
24
2.00
51916090--51916232
40
3.6
40
85
7
193
25
27
20
25
1.99
51921205--51921445
71
3.4
72
94
1
414
20
18
25
36
1.95
51921205--51921439
95
2.5
95
93
2
409
20
18
25
35
1.95
51921205--51921445
24
10.1
24
94
1
396
20
18
25
36
1.95
51929204--51929439
119
2.0
120
93
0
402
20
18
25
35
1.95
51929204--51929445
24
10.1
24
94
0
396
20
18
25
35
1.95
51939283--51939404
46
2.6
46
81
5
136
26
22
14
36
1.93
51942378--51942447
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
51948167--51948333
40
4.2
40
80
2
176
24
26
22
26
2.00
51955375--51955542
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
51959203--51959272
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51971840--51972006
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
51974134--51974248
47
2.4
48
92
2
196
34
21
20
23
1.96
51979246--51979405
38
4.2
38
86
4
198
22
21
25
30
1.99
51983822--51984029
40
5.2
40
79
4
186
25
25
23
25
2.00
51983822--51983991
80
2.1
80
82
4
209
24
27
24
24
2.00
51990638--51990727
38
2.4
38
90
0
135
22
20
23
34
1.97
51994759--51995164
49
8.3
49
95
2
719
30
29
7
32
1.86
51994759--51995164
197
2.1
194
95
1
731
30
29
7
32
1.86
51999165--51999251
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
51999165--51999273
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770