Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  273  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82434712--82434959
40
6.2
40
87
0
298
25
26
22
25
2.00
82434712--82434959
120
2.1
120
84
4
331
25
26
22
25
2.00
82444825--82444875
20
2.5
20
90
0
75
35
19
7
37
1.81
82445075--82445168
40
2.4
39
83
7
109
40
13
8
37
1.76
82445071--82445135
20
3.2
20
73
0
67
40
15
7
36
1.76
82445230--82445289
22
2.8
21
68
20
52
36
11
5
46
1.62
82445481--82445521
20
2.0
20
90
0
64
31
12
7
48
1.68
82447034--82447105
20
3.6
20
75
0
63
37
13
4
44
1.64
82447291--82447383
20
4.7
20
72
5
71
36
12
7
43
1.72
82447487--82447570
20
4.2
19
69
13
62
35
13
5
45
1.67
82447750--82447783
10
3.3
10
87
4
50
50
5
0
44
1.26
82448289--82448313
13
1.9
13
100
0
50
12
0
0
88
0.53
82448606--82448633
13
2.2
13
100
0
56
14
14
28
42
1.84
82449057--82449090
17
2.1
16
88
5
50
79
0
0
20
0.73
82449060--82449088
15
1.9
15
100
0
58
82
0
0
17
0.66
82451104--82451171
11
6.3
11
76
10
77
35
19
1
44
1.60
82451304--82451438
48
2.8
46
81
10
155
33
8
5
51
1.57
82453026--82453068
18
2.4
18
92
0
68
20
27
9
41
1.83
82453464--82453502
21
1.9
20
84
5
51
46
5
5
43
1.48
82456558--82456937
125
3.0
126
88
1
548
28
18
16
36
1.92
82457483--82457571
19
4.8
19
85
10
121
43
21
0
34
1.53
82457483--82457572
39
2.4
38
89
7
132
43
21
0
35
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82457483--82457592
35
3.1
34
82
11
114
42
20
0
36
1.53
82458231--82458298
31
2.2
31
82
15
79
42
11
7
38
1.69
82459086--82459136
25
2.0
26
96
3
95
58
0
3
37
1.16
82460542--82460585
19
2.3
19
80
7
54
43
6
0
50
1.29
82460959--82461047
44
2.0
44
91
0
142
39
11
3
46
1.56
82461745--82461784
19
2.0
21
85
9
57
42
10
10
37
1.72
82468397--82468423
14
1.9
14
100
0
54
25
7
7
59
1.51
82471186--82471369
93
2.0
93
81
7
221
22
16
17
42
1.89
82473957--82474017
2
31.0
2
81
3
70
50
0
6
42
1.28
82484161--82484187
12
2.2
12
100
0
54
48
0
7
44
1.31
82487584--82487686
23
4.4
24
92
4
158
28
21
21
29
1.98
82487743--82487799
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
82487739--82487801
20
3.2
20
95
0
117
31
19
12
36
1.89
82487838--82487885
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
82495656--82495752
47
2.1
47
92
0
158
28
19
20
30
1.97
82495649--82495753
24
4.4
24
90
3
158
27
20
20
31
1.97
82495810--82495866
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
82495806--82495868
20
3.2
20
95
0
117
31
19
12
36
1.89
82495905--82495952
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
82503682--82503840
27
5.9
27
81
7
173
20
23
21
35
1.96
82503679--82503840
54
3.0
53
86
4
218
19
23
21
35
1.96
82503682--82503835
81
1.9
81
85
5
213
20
23
21
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82506785--82506947
39
4.2
39
90
0
254
23
33
20
22
1.98
82513765--82513811
22
2.0
22
84
8
58
21
17
12
48
1.79
82514697--82514859
39
4.2
39
88
0
245
23
33
20
23
1.97
82516593--82516664
29
2.5
29
91
6
112
29
26
13
30
1.94
82516592--82516693
28
3.5
28
84
6
89
29
28
13
28
1.94
82524586--82524657
29
2.5
29
91
6
112
29
26
13
30
1.94
82524585--82524686
28
3.5
28
84
6
89
29
28
13
28
1.94
82525975--82526022
25
2.0
23
84
8
60
8
16
0
75
1.04
82539338--82539463
46
2.7
48
79
14
147
21
19
29
29
1.98
82542458--82542525
15
4.6
15
83
3
84
13
17
11
57
1.65
82542449--82542527
29
2.7
30
80
11
99
12
17
13
55
1.69
82544907--82545033
46
2.7
48
77
15
140
22
17
29
30
1.96
82548618--82548720
52
2.0
52
100
0
206
19
11
25
43
1.84
82549645--82549688
11
4.0
11
81
0
52
31
59
2
6
1.36
82549645--82549687
22
2.0
22
85
0
59
30
60
2
6
1.35
82551569--82551712
39
3.7
39
88
0
225
22
29
20
26
1.99
82559290--82559432
39
3.7
39
88
2
225
23
30
20
26
1.98
82561424--82561520
28
3.5
28
84
6
101
26
15
27
29
1.96
82561449--82561520
29
2.5
28
86
6
92
30
15
26
27
1.96
82561424--82561524
29
3.6
28
75
13
75
26
14
27
30
1.95
82564937--82565035
28
3.5
29
91
8
161
32
27
12
28
1.92
82570675--82570711
17
2.2
17
100
0
74
21
29
10
37
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82572333--82572433
28
3.6
27
81
10
107
28
29
14
26
1.95
82573947--82574027
29
2.8
29
88
1
119
27
16
25
30
1.96
82578186--82578286
37
2.7
37
90
0
157
26
31
17
23
1.97
82578429--82578708
48
5.8
48
97
0
524
30
28
6
34
1.82
82582145--82582383
40
6.0
40
90
1
372
26
30
22
21
1.99
82583950--82584134
40
4.6
39
76
9
169
24
25
23
27
2.00
82591973--82592155
40
4.6
39
80
11
176
23
27
23
25
2.00
82591971--82592156
80
2.3
81
84
8
238
24
27
23
25
2.00
82594689--82594862
46
3.8
46
78
13
196
28
30
21
19
1.98
82594696--82594867
93
1.9
92
93
1
299
27
30
22
19
1.98
82597725--82597830
37
2.9
37
94
0
185
24
32
18
24
1.97
82597971--82598248
48
5.8
48
95
1
506
30
29
6
34
1.83
82597971--82598248
94
2.9
95
95
2
495
30
29
6
34
1.83
82597965--82598256
142
2.1
142
94
0
521
30
29
6
33
1.83
82600693--82600772
27
3.0
27
83
7
99
37
25
11
26
1.89
82600693--82600825
54
2.5
54
81
0
140
36
25
9
28
1.88
82600703--82600825
27
4.6
27
77
8
106
36
26
8
27
1.86
82600999--82601029
10
3.1
10
100
0
62
32
29
9
29
1.89
82601501--82601552
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
82601567--82601603
18
2.1
18
89
0
56
16
32
27
24
1.96
82603076--82603389
27
11.6
27
85
2
380
40
19
8
32
1.81
82603076--82603461
54
7.1
54
83
1
423
39
19
8
31
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82603076--82603461
81
4.8
81
85
1
434
39
19
8
31
1.82
82603076--82603443
27
13.6
27
82
5
343
39
20
8
31
1.82
82603179--82603498
81
4.0
81
80
4
198
38
20
8
32
1.83
82603482--82603812
27
12.3
27
86
2
432
34
19
21
24
1.97
82605497--82605626
40
3.2
40
83
4
165
22
25
29
23
1.99
82608377--82608441
22
3.0
22
80
8
78
20
23
21
35
1.96
82608600--82608701
27
3.8
27
84
5
125
18
22
21
37
1.94
82608846--82608933
31
2.8
31
91
0
140
20
17
13
48
1.80
82609935--82609965
13
2.4
13
100
0
62
38
38
22
0
1.54
82610982--82611094
24
4.9
24
71
12
85
32
18
20
28
1.96
82615074--82615201
37
3.4
37
94
1
211
24
32
19
23
1.97
82615241--82615440
48
4.2
48
90
0
310
31
26
6
36
1.82
82617600--82617633
17
2.0
17
88
11
52
58
0
2
38
1.13
82623688--82623756
33
2.1
33
97
0
129
20
17
24
37
1.93
82625462--82625627
51
3.3
50
78
12
178
30
28
12
28
1.92
82625462--82625626
52
3.2
52
82
9
200
30
28
12
28
1.92
82633062--82633239
51
3.5
51
87
4
236
26
29
15
28
1.96
82636262--82636374
43
2.7
42
83
2
154
29
15
25
29
1.96
82636427--82636451
12
2.1
12
100
0
50
44
16
24
16
1.86
82639457--82639613
43
3.7
43
77
9
160
24
15
26
33
1.96
82639511--82639592
42
1.9
43
82
7
105
21
12
28
37
1.90
82650210--82650340
40
3.3
40
78
2
147
25
23
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82667283--82667414
29
4.6
29
86
0
165
25
15
34
25
1.95
82669205--82669374
27
6.3
27
83
1
180
43
17
13
25
1.86
82669205--82669374
54
3.1
54
84
1
207
43
17
13
25
1.86
82671687--82671857
93
1.8
93
94
0
306
28
28
21
22
1.99
82671682--82671854
46
3.7
46
79
13
210
28
27
21
22
1.99
82672277--82672336
30
2.0
30
86
0
84
30
25
6
38
1.81
82673330--82673481
37
4.1
37
93
0
241
26
31
19
22
1.98
82673645--82674065
47
9.0
47
89
0
617
26
29
11
31
1.92
82673645--82674044
94
4.3
94
92
0
683
26
29
12
31
1.93
82678014--82678565
40
13.8
40
92
0
852
25
26
22
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770