Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  681  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214523238--214523315
37
2.1
37
100
0
156
28
19
32
20
1.97
214525328--214525744
29
14.7
29
92
5
656
24
17
33
24
1.96
214525645--214525686
22
2.0
22
90
4
68
21
19
38
21
1.94
214525616--214525719
50
2.1
51
90
1
165
25
17
33
24
1.96
214525587--214525744
79
2.0
79
90
2
246
25
16
33
24
1.96
214526227--214526325
41
2.4
41
80
11
114
26
25
24
24
2.00
214529425--214529547
49
2.5
49
95
0
219
26
10
33
29
1.90
214529650--214529727
37
2.1
37
100
0
156
28
19
32
20
1.97
214532438--214532539
42
2.4
42
96
1
186
34
12
14
38
1.85
214532522--214532566
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
214533721--214533775
12
5.0
12
84
13
66
72
7
1
18
1.16
214533726--214533761
10
3.7
10
92
7
65
75
8
0
16
1.04
214533748--214533791
19
2.3
21
74
22
51
70
6
4
18
1.27
214533727--214533760
9
3.7
9
96
4
59
73
8
0
17
1.08
214535909--214535982
21
3.6
21
67
22
50
70
2
20
6
1.23
214539234--214539281
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
214539324--214539382
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
214539328--214539382
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
214539432--214539550
47
2.5
48
89
8
172
27
21
24
26
1.99
214539432--214539550
24
5.0
24
84
9
154
27
21
24
26
1.99
214539742--214539843
31
3.1
31
78
17
123
39
15
21
23
1.92
214539759--214539866
38
2.8
38
94
1
189
39
14
22
23
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214547563--214547610
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
214547654--214547712
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
214547658--214547712
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
214547764--214547855
46
2.0
46
93
4
159
25
22
25
27
2.00
214547764--214547880
24
4.9
24
85
11
152
26
22
24
26
2.00
214548070--214548133
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
214549506--214549672
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
214557503--214557669
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
214568183--214568283
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
214568212--214568287
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
214578138--214578238
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
214578167--214578242
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
214585989--214586089
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
214586018--214586093
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
214589386--214589568
40
4.6
39
75
7
138
26
23
27
22
1.99
214589425--214589613
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
214596679--214596862
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
214596719--214596907
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
214598794--214598863
27
2.6
27
93
2
113
28
30
14
27
1.95
214600478--214600693
55
4.0
54
80
6
249
20
25
18
34
1.96
214601030--214601088
30
2.0
30
83
6
75
33
22
3
40
1.70
214607109--214607280
93
1.8
93
93
0
299
28
29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214607102--214607277
46
3.8
46
77
12
198
29
28
20
21
1.98
214607151--214607289
47
3.0
46
74
16
135
30
28
18
22
1.97
214614517--214614645
46
2.8
46
95
0
222
29
29
21
19
1.98
214614525--214614664
46
3.0
45
88
4
140
28
29
21
20
1.98
214620838--214620986
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
214620879--214620986
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
214622706--214622936
40
5.7
40
94
1
390
27
29
19
22
1.98
214632273--214632417
40
3.6
40
84
4
184
23
24
24
26
2.00
214633429--214633659
43
5.3
43
90
3
347
24
18
33
24
1.97
214639628--214639739
57
2.0
57
89
0
170
29
0
23
46
1.58
214639640--214639752
9
12.2
9
79
5
118
30
0
21
46
1.57
214639628--214639752
57
2.2
57
86
0
169
30
0
21
47
1.57
214639796--214640706
240
3.8
241
98
0
1720
32
13
18
35
1.90
214640749--214640799
10
5.4
10
75
13
54
35
17
0
47
1.48
214640742--214640795
27
2.0
27
100
0
108
40
14
0
44
1.46
214640843--214640891
23
2.1
23
92
7
82
36
16
14
32
1.89
214646332--214646401
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
214654353--214654422
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
214657451--214657622
43
4.0
44
74
13
178
24
16
26
31
1.96
214665879--214666062
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
214665919--214666107
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
214676630--214676813
40
4.7
40
84
9
218
25
28
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214676632--214676813
79
2.3
80
83
10
223
25
28
23
23
2.00
214683161--214683212
23
2.3
23
89
0
77
44
17
17
21
1.87
214695092--214695149
25
2.3
25
85
11
75
37
3
0
58
1.15
214698732--214698765
17
1.9
18
94
5
61
58
8
5
26
1.51
214699484--214699543
10
6.0
10
86
11
79
70
3
8
18
1.27
214705570--214705631
26
2.3
26
86
2
79
38
27
6
27
1.81
214705736--214705819
27
3.1
27
87
1
123
19
23
19
38
1.93
214708430--214708482
17
3.2
17
77
17
58
43
0
0
56
0.99
214718113--214718420
40
7.7
40
92
2
512
26
27
21
24
1.99
214720920--214721012
29
3.2
29
87
0
123
33
16
27
22
1.95
214720920--214721025
29
3.7
29
82
5
115
30
16
31
22
1.95
214735250--214735457
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
214735250--214735455
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
214743322--214743529
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
214743322--214743527
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
214746989--214747195
40
5.2
40
85
2
258
25
28
21
24
1.99
214751155--214751321
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
214751155--214751321
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
214752147--214752192
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
214758343--214758509
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
214766295--214766462
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
214774281--214774447
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214777911--214778160
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
214786943--214787106
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
214786943--214787140
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
214793472--214793620
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
214793513--214793620
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
214801584--214801732
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
214801625--214801732
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
214808334--214808379
22
2.1
23
88
8
69
67
4
0
28
1.10
214808334--214808435
22
4.5
22
71
23
68
65
1
1
30
1.14
214808315--214808413
16
6.2
16
66
22
57
68
2
2
27
1.11
214808326--214808445
22
5.1
22
72
16
64
64
2
1
31
1.17
214808419--214808452
13
2.6
13
90
0
50
58
2
0
38
1.13
214820094--214820317
118
1.9
120
82
7
287
26
27
21
24
1.99
214820075--214820317
40
6.1
40
84
6
275
26
27
21
24
1.99
214821979--214822195
40
5.6
39
83
8
239
27
28
20
23
1.99
214821979--214822195
115
1.9
116
82
8
273
27
28
20
23
1.99
214827144--214827176
15
2.1
16
94
5
59
6
15
0
78
0.93
214829941--214830159
40
5.5
39
83
5
217
24
25
23
26
2.00
214829941--214830161
80
2.7
79
82
2
262
24
25
23
27
2.00
214833241--214833335
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
214833242--214833335
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
214833527--214833620
38
2.4
38
92
1
152
38
17
23
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214843189--214843355
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
214851140--214851306
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
214853206--214853335
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
214853206--214853369
40
4.1
40
78
4
145
21
28
25
25
1.99
214856958--214857034
24
3.2
24
96
0
136
32
2
42
22
1.67
214857998--214858029
8
4.0
8
91
0
55
46
25
25
3
1.67
214858433--214858516
27
3.1
27
81
1
80
15
20
23
40
1.90
214862318--214862502
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
214862319--214862510
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
214862318--214862535
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770