Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  435  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134221597--134221644
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
134221687--134221747
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
134221797--134221939
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
134221797--134221939
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
134221797--134221940
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
134222131--134222193
31
2.1
31
90
3
101
36
15
23
23
1.94
134225934--134226098
35
4.6
35
82
10
181
31
10
24
33
1.90
134225938--134226103
74
2.3
75
83
9
204
32
11
22
33
1.90
134231607--134231890
134
2.1
137
96
2
520
31
25
18
24
1.97
134233661--134233796
26
5.2
25
90
7
209
36
24
5
33
1.78
134233661--134233796
52
2.6
52
96
2
247
36
24
5
33
1.78
134236893--134236930
20
1.9
19
85
15
51
34
5
0
60
1.19
134236987--134237021
12
3.0
12
91
4
54
25
5
0
68
1.11
134238488--134238550
16
4.1
15
71
25
51
61
0
6
31
1.21
134238589--134238661
31
2.5
28
75
16
67
65
4
8
21
1.36
134239132--134239169
20
1.9
19
85
15
51
60
0
5
34
1.19
134246621--134246665
20
2.2
20
80
7
56
80
0
15
4
0.87
134247789--134247859
35
2.0
35
94
0
124
16
25
30
26
1.97
134250773--134250882
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
134254053--134254082
12
2.5
12
100
0
60
10
26
50
13
1.73
134257612--134257721
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
134265064--134265160
12
8.7
11
73
19
60
79
3
14
3
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134265077--134265160
9
9.9
8
71
16
62
79
2
14
3
0.96
134265063--134265143
10
7.6
10
72
16
65
80
3
12
3
0.98
134265063--134265178
34
3.5
33
76
12
94
79
2
12
5
1.00
134265078--134265148
25
2.8
24
68
21
54
80
2
12
4
0.97
134265076--134265178
9
11.6
9
68
13
61
79
1
12
5
0.99
134267136--134267379
127
1.9
127
90
3
393
31
20
23
24
1.98
134267189--134267551
172
2.1
172
93
1
620
29
20
24
25
1.99
134267136--134268077
299
3.2
298
82
8
1210
30
20
24
24
1.98
134267611--134268085
172
2.8
172
88
0
700
30
19
23
25
1.98
134267348--134267805
127
3.6
127
94
0
754
30
19
24
25
1.98
134267901--134268040
45
3.1
45
88
0
208
27
19
25
27
1.99
134269555--134269592
20
1.9
19
85
15
51
34
5
0
60
1.19
134269668--134269693
12
2.2
12
100
0
52
23
7
0
69
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134272034--134272078
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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279
2.2
279
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1166
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20
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134285970--134286463
270
1.8
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
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23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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20
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34
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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