Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  591  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
184844831--184845139
49
6.4
49
93
2
480
30
29
8
31
1.87
184844831--184845139
144
2.1
147
89
3
480
30
29
8
31
1.87
184848977--184849200
40
5.6
40
95
0
378
25
29
21
23
1.99
184848977--184849317
40
8.6
40
87
5
361
26
29
21
23
1.99
184851178--184851263
37
2.3
36
94
4
145
26
33
18
20
1.96
184851332--184851642
49
6.4
49
94
0
489
30
29
8
32
1.87
184851312--184851629
146
2.2
148
90
1
487
29
29
9
31
1.88
184859382--184859590
46
4.5
44
77
17
151
29
18
28
23
1.98
184861989--184862199
40
5.3
40
81
3
239
27
26
22
24
2.00
184868167--184868351
40
4.6
39
85
4
217
28
22
25
23
2.00
184868166--184868372
80
2.6
80
83
4
247
26
22
26
25
2.00
184868165--184868372
40
5.2
39
83
5
211
26
22
25
25
2.00
184876171--184876377
40
5.2
39
83
4
218
26
22
26
25
2.00
184881378--184881440
31
2.0
31
87
0
90
23
20
15
39
1.91
184881634--184881779
25
6.0
24
89
5
197
28
21
19
29
1.98
184881829--184881894
20
3.3
20
89
0
105
30
21
13
34
1.92
184881829--184881883
11
5.4
11
75
16
64
29
20
14
36
1.92
184888839--184888901
31
2.0
31
93
0
108
23
23
15
36
1.94
184889231--184889259
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
184889923--184890054
39
3.4
39
91
2
194
30
18
25
25
1.98
184889959--184890252
39
7.5
39
89
1
299
23
22
27
26
2.00
184889930--184890260
78
4.2
78
81
8
293
23
22
26
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
184893771--184893810
20
2.0
20
100
0
80
25
15
30
30
1.95
184894274--184894414
40
3.5
40
85
0
174
24
26
21
26
2.00
184894301--184894452
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
184902289--184902434
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
184902321--184902471
40
3.8
40
84
6
164
23
25
21
29
1.99
184904776--184904814
4
9.5
4
84
15
53
20
0
2
76
0.90
184904766--184904815
21
2.4
21
90
6
75
18
0
6
76
0.99
184904783--184904816
10
3.3
10
84
8
50
17
0
2
79
0.86
184905955--184906010
17
3.5
15
77
18
51
30
0
3
66
1.09
184906203--184906234
15
2.1
15
94
0
55
31
9
3
56
1.47
184907582--184907632
22
2.3
22
86
6
68
37
15
19
27
1.92
184909334--184909508
42
4.2
41
76
4
145
33
26
10
29
1.90
184917076--184917176
44
2.2
45
84
3
123
31
20
12
34
1.91
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
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T
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
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26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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4
126
42
12
22
22
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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