Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  627  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
196599209--196599380
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
196599202--196599377
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
196602447--196602471
13
1.9
13
100
0
50
40
24
4
32
1.73
196604049--196604098
24
2.1
24
88
0
73
52
2
2
44
1.24
196609866--196609976
27
4.1
27
87
3
145
39
22
23
14
1.91
196617687--196617772
27
3.2
26
83
8
109
40
23
23
12
1.89
196635155--196635213
22
2.7
22
91
0
100
37
15
20
27
1.92
196635155--196635221
22
3.0
22
85
8
91
34
14
20
29
1.93
196637143--196637257
42
2.7
42
74
2
115
32
12
23
32
1.91
196639502--196639773
48
5.6
47
76
7
210
26
19
27
26
1.99
196639487--196639775
96
3.0
97
83
6
338
25
18
28
27
1.98
196646741--196646842
40
2.5
40
79
6
109
27
24
24
23
2.00
196655327--196655395
27
2.6
27
83
4
86
31
26
14
27
1.95
196655403--196655509
42
2.5
42
96
0
196
22
33
14
28
1.94
196659096--196659279
40
4.7
40
84
7
225
26
27
21
24
1.99
196659123--196659279
79
2.0
80
86
6
221
26
28
21
24
1.99
196662414--196662639
50
4.6
49
83
3
274
30
26
17
25
1.97
196662416--196662639
99
2.3
99
85
3
290
29
26
17
25
1.97
196667968--196668096
40
3.2
39
83
6
143
24
22
27
24
2.00
196671222--196671261
20
2.0
21
95
5
73
35
5
0
60
1.19
196674979--196675004
13
2.0
13
100
0
52
46
0
0
53
1.00
196678301--196678510
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
196686437--196686646
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
196692174--196692333
24
6.8
24
94
3
281
35
26
16
20
1.94
196699920--196700034
24
4.8
24
97
0
212
35
26
17
20
1.94
196703248--196703304
28
2.1
27
80
9
62
24
17
14
43
1.86
196705247--196705280
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
196705768--196705803
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
196710498--196710691
48
4.1
48
72
14
150
26
18
26
27
1.98
196710419--196710681
93
2.9
91
81
5
257
28
17
25
28
1.97
196712860--196712990
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
196712860--196712990
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
196720793--196720922
29
4.5
29
84
8
158
32
13
26
27
1.94
196721694--196721726
16
2.1
16
88
11
50
51
0
18
30
1.46
196723983--196724125
39
3.7
39
88
2
225
25
21
30
22
1.99
196723984--196724165
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23
1.99
196725738--196725853
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1
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20
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28
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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2
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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0
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22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
196951475--196951660
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1.99
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5
272
23
19
29
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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