Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  623  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
195348300--195348407
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
195354729--195354823
40
2.4
40
90
0
163
29
29
18
22
1.98
195368805--195368877
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
195373664--195373764
40
2.5
40
83
3
123
24
22
28
23
1.99
195373706--195373811
40
2.7
40
86
2
133
28
22
28
20
1.99
195375497--195375566
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
195375497--195375578
27
3.0
27
84
8
69
28
15
25
30
1.96
195383435--195383504
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
195383435--195383516
27
3.0
27
84
8
69
28
15
25
30
1.96
195387605--195387677
29
2.5
29
84
0
92
28
17
26
27
1.98
195402007--195402124
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
195401975--195402138
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
195404621--195404796
46
3.8
46
78
12
207
20
21
28
29
1.98
195404618--195404789
93
1.8
93
94
0
308
20
21
29
28
1.98
195409839--195409936
29
3.5
28
83
5
117
30
16
24
28
1.96
195415952--195416127
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
195415949--195416120
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
195422564--195422623
30
2.0
29
87
9
86
36
8
26
28
1.85
195423275--195423459
49
3.8
49
85
7
268
26
19
25
28
1.99
195423276--195423465
97
1.9
98
96
1
355
25
20
25
28
1.99
195425493--195425543
26
2.0
26
85
11
70
56
0
1
41
1.10
195425499--195425550
25
2.1
25
82
7
61
61
0
1
36
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
195430912--195430954
20
2.2
20
100
0
86
37
11
18
32
1.87
195430919--195430962
20
2.2
20
91
0
70
34
11
22
31
1.90
195431009--195431198
24
8.0
24
90
3
278
29
22
21
26
1.99
195431008--195431198
71
2.7
71
88
5
278
29
22
20
26
1.99
195431008--195431199
47
4.0
47
90
4
287
30
22
20
26
1.98
195431392--195431452
31
2.0
31
93
0
104
36
16
21
26
1.94
195438311--195438425
25
4.6
25
69
21
80
25
20
21
32
1.98
195438311--195438422
50
2.2
50
84
6
138
25
21
20
33
1.97
195444711--195444829
43
2.8
42
83
7
150
30
26
16
26
1.97
195445708--195445743
17
2.1
18
89
5
56
41
0
0
58
0.98
195447286--195447333
25
1.9
25
91
0
78
14
8
25
52
1.69
195447620--195447706
29
3.0
29
93
1
140
29
29
13
26
1.94
195458612--195458713
29
3.5
28
81
5
114
21
16
32
29
1.95
195465486--195465559
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22
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0
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8
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2.6
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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23
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1.96
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2.4
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4
186
23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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29
21
20
1.98
195621509--195621694
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4.0
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1.98
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19
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4.0
26
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0
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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13
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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25
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24
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22
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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