Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  92  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26845245--26845303
30
2.0
30
86
6
84
0
8
6
84
0.77
26845251--26845302
18
2.8
18
85
5
68
0
7
7
84
0.77
26845234--26845303
13
5.6
12
77
5
59
0
11
5
82
0.82
26850714--26850774
3
20.3
3
100
0
122
67
0
0
32
0.91
26850714--26850786
6
11.6
7
97
2
74
67
0
1
31
1.00
26850874--26850916
21
2.1
20
86
4
59
69
0
2
27
1.00
26851242--26851288
4
11.5
4
81
4
58
72
2
2
23
1.06
26855219--26855275
30
1.9
30
100
0
114
40
7
14
38
1.73
26857398--26857437
16
2.4
16
87
4
53
62
0
0
37
0.95
26862641--26862709
14
4.5
15
75
18
61
46
0
0
53
1.00
26862639--26862709
34
2.3
28
86
13
88
47
0
0
52
1.00
26862685--26862730
22
2.1
22
88
4
67
45
0
0
54
0.99
26862744--26862805
20
3.2
19
75
25
58
53
0
0
46
1.00
26862737--26862827
38
2.4
39
78
14
100
54
1
1
42
1.14
26864559--26864602
20
2.2
20
92
4
72
56
2
0
40
1.11
26866618--26866682
32
2.0
32
100
0
130
15
24
21
38
1.92
26871121--26871181
3
20.3
3
100
0
122
67
0
0
32
0.91
26872301--26872350
18
2.6
19
78
9
57
66
0
0
34
0.92
26872089--26872538
206
2.1
209
89
3
681
42
6
11
40
1.65
26875315--26875347
14
2.3
15
89
5
50
0
6
18
75
1.00
26884486--26884522
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
26885532--26885615
41
2.0
41
100
0
168
51
7
21
20
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26892274--26892423
46
3.1
46
75
14
158
30
27
16
26
1.96
26893507--26893590
21
4.0
21
80
6
89
38
26
21
14
1.91
26893505--26893591
44
2.0
41
82
6
102
37
25
20
16
1.93
26893795--26893878
28
3.0
28
87
1
123
47
29
3
19
1.66
26897167--26897217
16
3.0
17
77
8
50
49
0
0
50
1.00
26923026--26923231
53
3.8
53
78
4
198
37
17
23
20
1.94
26926395--26926441
2
23.5
2
91
0
76
48
0
2
48
1.13
26926645--26926742
39
2.5
39
94
0
169
23
28
23
24
2.00
26927100--26927129
2
15.5
2
93
6
53
53
0
0
46
1.00
26930363--26930387
9
2.8
9
100
0
50
52
0
24
24
1.48
26930663--26930797
44
3.1
43
79
6
130
26
17
25
29
1.98
26930663--26930818
43
3.6
43
78
6
138
28
17
24
28
1.98
26933751--26933917
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
26941761--26941927
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
26944315--26944393
26
3.2
26
82
5
92
35
21
26
16
1.94
26944280--26944397
25
4.7
25
77
10
116
33
22
26
17
1.96
26946813--26946891
27
2.9
26
79
7
86
36
22
20
20
1.95
26947050--26947205
27
5.8
27
90
3
242
22
21
21
34
1.97
26947032--26947205
81
2.1
81
87
2
242
22
21
21
34
1.97
26949170--26949246
28
2.8
28
83
0
100
29
29
10
29
1.90
26953516--26953667
43
3.7
42
74
11
127
28
23
16
30
1.96
26958254--26958385
29
4.6
28
85
5
142
31
15
27
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26966460--26966562
29
3.6
28
84
7
127
30
16
26
27
1.97
26977938--26978119
40
4.6
40
92
2
287
24
22
26
26
2.00
26981885--26981965
34
2.4
34
93
2
135
44
16
6
33
1.72
26982897--26983156
43
6.0
43
83
3
326
27
26
18
26
1.98
26991861--26991925
32
2.0
32
100
0
130
36
18
9
35
1.83
26996766--26996943
40
4.4
40
76
9
130
30
25
16
26
1.96
26996766--26996945
81
2.2
83
79
10
203
31
25
16
26
1.96
26999644--27000048
27
15.0
27
86
3
512
28
22
9
40
1.84
27000065--27000252
27
7.0
27
85
0
241
34
19
20
25
1.96
26999644--27000072
161
2.7
160
83
4
418
29
21
9
39
1.84
26999708--27000099
134
2.9
134
82
7
327
29
22
9
38
1.86
27000451--27000533
27
3.1
26
89
5
121
19
22
21
36
1.95
27000844--27000910
27
2.5
27
85
4
82
20
25
17
35
1.95
27001035--27001112
6
12.8
6
77
17
81
20
16
12
50
1.78
27001035--27001112
30
2.5
31
91
6
124
20
16
12
50
1.78
27006527--27006711
40
4.6
40
82
8
223
23
22
28
25
2.00
27006541--27006711
83
2.1
82
88
4
231
22
22
28
25
1.99
27011653--27011828
46
3.8
46
76
14
191
22
21
27
28
1.99
27011650--27011821
93
1.8
93
93
2
301
22
21
27
27
1.99
27015960--27016103
39
3.7
40
89
0
175
23
31
21
22
1.98
27015990--27016103
39
2.9
39
94
1
192
24
32
20
22
1.98
27024005--27024148
39
3.7
40
89
0
175
23
31
21
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27024035--27024148
39
2.9
39
94
1
192
24
32
20
22
1.98
27027066--27027186
39
3.1
37
81
8
134
35
19
23
20
1.96
27027100--27027209
38
2.8
40
78
9
120
32
23
23
20
1.98
27027293--27027462
81
2.1
80
87
3
243
38
16
20
25
1.92
27031675--27031705
14
2.2
14
94
0
53
54
0
3
41
1.16
27031806--27032140
183
1.8
183
98
0
643
27
17
14
41
1.87
27032547--27032604
9
6.1
9
75
11
53
48
24
0
27
1.51
27038146--27038195
21
2.5
21
74
6
59
32
18
48
2
1.59
27038492--27038813
43
7.3
43
84
6
335
24
19
21
35
1.96
27038577--27038813
92
2.7
86
84
7
321
20
18
22
38
1.94
27048961--27049091
47
2.8
48
85
3
185
23
16
28
31
1.96
27048964--27049110
47
3.1
47
76
8
140
23
15
27
32
1.95
27056103--27056256
42
3.7
42
81
3
184
28
16
27
27
1.97
27056103--27056264
84
1.9
83
84
1
216
28
15
27
28
1.96
27057139--27057177
19
2.0
19
85
5
51
33
10
17
38
1.84
27058927--27058983
28
2.0
28
100
0
114
26
7
17
49
1.72
27059670--27059722
19
2.8
19
94
0
88
15
24
37
22
1.92
27069895--27070039
40
3.6
40
83
4
184
26
24
26
22
2.00
27073868--27074043
50
3.5
49
84
3
181
29
27
17
25
1.97
27080026--27080141
27
4.3
27
74
4
99
24
18
18
38
1.93
27080025--27080144
54
2.2
54
83
5
163
24
19
17
39
1.92
27080136--27080371
27
8.7
27
88
0
337
37
15
13
33
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27080109--27080372
81
3.3
80
84
3
314
36
16
13
33
1.88
27082406--27082513
20
5.8
18
70
18
71
50
3
2
42
1.34
27082418--27082478
25
2.4
26
81
10
72
50
4
3
40
1.40
27082439--27082496
17
3.6
16
75
15
57
53
1
3
41
1.28
27084585--27084668
25
3.4
25
79
0
78
35
19
27
17
1.94
27091349--27091469
47
2.6
47
85
5
147
24
12
29
33
1.92
27096568--27096599
15
2.1
15
94
0
55
68
9
6
15
1.36
27104314--27104349
9
3.9
9
92
3
54
66
0
5
27
1.13
27106394--27106437
20
2.1
21
87
4
63
40
0
0
59
0.98
27108227--27108255
15
2.0
15
93
6
51
48
6
0
44
1.29
27113681--27113716
18
2.0
18
100
0
72
33
5
11
50
1.61
27113943--27114077
65
2.1
65
90
2
209
34
15
4
45
1.67
27124797--27124947
40
3.8
40
77
11
141
26
24
27
21
2.00
27124834--27124963
40
3.2
40
79
2
154
23
23
28
23
2.00
27124796--27124963
80
2.1
80
82
6
207
26
23
27
22
2.00
27132616--27132837
124
1.8
122
83
3
293
31
11
23
32
1.90
27132796--27132946
40
3.8
40
77
11
141
26
24
27
21
2.00
27132833--27132962
40
3.2
40
79
2
154
23
23
28
23
2.00
27132795--27132962
80
2.1
80
82
6
207
26
23
27
22
2.00
27136238--27136408
93
1.8
93
93
0
297
27
29
21
21
1.99
27136230--27136405
46
3.8
46
79
12
207
28
28
21
21
1.98
27137908--27137999
45
2.0
45
100
0
184
42
10
13
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27140118--27140149
16
2.0
16
93
0
55
21
0
6
71
1.07
27140350--27140412
28
2.2
28
85
0
90
33
6
28
31
1.82
27145751--27145813
28
2.2
28
91
0
99
31
6
30
31
1.83
27145971--27146016
15
3.0
15
80
3
56
26
0
2
71
0.97
27146720--27146774
20
2.7
21
80
2
67
43
34
0
21
1.53
27146818--27146855
15
2.6
14
88
8
58
42
36
0
21
1.53
27146881--27146923
14
3.2
13
87
9
59
46
32
0
20
1.51
27147017--27147065
22
2.2
22
81
0
53
42
26
0
30
1.55
27147071--27147115
14
3.1
14
87
6
63
35
48
0
15
1.45
27147070--27147123
21
2.5
21
77
11
56
37
46
0
16
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770