Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  622  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
195030722--195030852
66
1.9
69
81
9
160
33
15
30
20
1.93
195032718--195032931
45
4.6
46
76
12
181
24
30
18
27
1.98
195034641--195034787
7
20.6
7
74
12
111
20
0
29
50
1.49
195034635--195034786
29
5.6
27
76
19
122
19
0
29
50
1.48
195038191--195038242
22
2.4
22
86
0
68
17
34
28
19
1.94
195040535--195040559
8
3.1
8
100
0
50
52
0
24
24
1.48
195046658--195046825
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
195054708--195054839
29
4.6
29
82
9
137
26
26
15
31
1.96
195062660--195062762
29
3.6
28
80
5
109
27
26
16
30
1.97
195067028--195067212
79
2.3
81
84
6
236
27
27
20
24
1.99
195067028--195067212
40
4.7
40
84
7
216
27
27
20
24
1.99
195073027--195073126
48
2.1
48
94
0
173
24
17
30
29
1.97
195073273--195073362
42
2.1
42
87
0
126
26
13
27
32
1.94
195073285--195073483
42
4.6
42
73
10
150
25
17
28
28
1.98
195073236--195073483
132
1.9
132
81
3
302
24
18
27
29
1.98
195073317--195073480
90
1.8
90
84
2
222
25
17
28
29
1.98
195076010--195076153
39
3.7
39
90
0
234
26
21
29
22
1.99
195076011--195076193
78
2.3
79
89
1
269
24
22
29
22
1.99
195084024--195084166
39
3.7
39
90
2
234
26
20
30
22
1.99
195084025--195084206
77
2.3
79
89
2
269
24
22
29
23
1.99
195090947--195091130
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
195090987--195091175
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
195096089--195096124
16
2.1
18
90
10
58
69
2
0
27
1.02
195105644--195105707
32
2.0
32
100
0
128
18
9
31
40
1.83
195111053--195111216
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
195111053--195111250
71
2.8
70
90
3
249
20
28
17
32
1.96
195118590--195118753
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
195118590--195118787
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
195129692--195129836
40
3.6
40
81
2
121
27
23
26
22
1.99
195129731--195129859
40
3.2
39
83
6
143
23
22
28
25
1.99
195134338--195134380
17
2.4
18
80
7
61
53
0
4
41
1.21
195134368--195134404
18
2.1
17
90
5
56
51
0
0
48
1.00
195134429--195134462
15
2.3
15
89
0
50
76
5
11
5
1.14
195135357--195135382
6
4.3
6
100
0
52
19
19
15
46
1.85
195140323--195140411
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
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Copy
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
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Size
Copy
Number
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Size
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
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Score
A
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183
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30
24
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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