Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  280  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84982943--84983180
27
8.8
27
82
1
244
40
8
20
30
1.82
84982943--84983207
81
3.3
81
82
3
246
40
8
19
31
1.82
84983157--84983230
27
2.7
27
79
6
87
33
9
17
39
1.82
84983178--84983236
27
2.2
27
81
6
66
33
8
15
42
1.77
84987362--84987417
15
3.7
15
86
9
87
60
10
16
12
1.58
84990344--84990511
46
3.7
45
75
7
178
29
29
19
22
1.98
84992885--84992932
15
3.2
15
80
11
62
58
14
14
12
1.64
84992876--84992932
30
2.0
28
89
6
87
57
15
15
10
1.64
84995839--84996009
93
1.8
93
94
0
306
27
29
21
21
1.98
84995831--84996006
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
84998369--84998432
15
4.6
13
75
12
65
59
14
15
10
1.61
84998379--84998439
15
4.2
15
76
16
65
59
13
14
13
1.63
84998369--84998432
28
2.3
28
83
5
94
59
14
15
10
1.61
85002652--85002868
40
5.5
40
87
3
289
25
23
26
24
2.00
85002652--85002868
119
1.8
119
85
5
305
25
23
26
24
2.00
85004543--85004718
46
3.8
46
81
12
216
27
28
21
22
1.99
85004551--85004722
93
1.8
93
93
0
299
27
28
21
22
1.99
85004549--85004738
46
4.1
46
73
20
146
27
28
21
22
1.99
85006683--85006744
15
4.4
14
72
23
58
9
12
17
59
1.59
85007372--85007692
160
2.0
160
93
2
556
33
10
20
35
1.87
85009041--85009226
50
3.8
49
80
7
189
25
19
26
28
1.99
85026614--85026781
43
4.0
43
75
13
150
23
16
26
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85049353--85049520
40
4.2
40
79
7
171
24
27
23
24
2.00
85054191--85054460
48
5.6
48
89
0
407
28
28
18
24
1.98
85055708--85055831
43
2.9
43
87
3
171
35
25
14
24
1.93
85063299--85063468
43
4.0
43
75
10
152
33
22
15
28
1.95
85066603--85066652
26
2.0
25
88
4
73
66
8
6
20
1.40
85067156--85067272
19
6.2
19
90
6
175
37
17
8
36
1.80
85067156--85067266
55
2.0
57
91
3
181
37
16
9
36
1.80
85067156--85067272
36
3.1
38
87
7
175
37
17
8
36
1.80
85067844--85067938
44
2.2
44
92
0
154
27
25
16
30
1.97
85067844--85067968
44
2.8
44
80
7
128
26
24
16
33
1.95
85069591--85069669
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
85070309--85070351
2
21.5
2
90
0
68
46
2
2
48
1.27
85082302--85082471
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
85090383--85090533
40
3.8
40
75
15
134
27
23
26
23
2.00
85090419--85090549
40
3.3
40
79
6
158
25
22
27
24
2.00
85097382--85097452
21
3.4
21
73
11
65
25
21
30
22
1.98
85102285--85102376
48
1.9
48
88
0
139
26
20
25
28
1.99
85104021--85104498
53
8.9
53
81
6
514
22
24
17
35
1.95
85104021--85104490
108
4.4
107
86
4
531
22
24
17
35
1.95
85104021--85104498
161
3.0
161
87
2
649
22
24
17
35
1.95
85104480--85104598
47
2.5
48
93
2
197
26
25
13
35
1.93
85104738--85104821
44
1.9
44
85
4
116
26
25
11
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85113620--85113677
20
2.9
20
86
0
80
13
31
29
25
1.94
85119853--85120049
50
4.0
49
82
3
232
28
26
18
25
1.98
85119867--85120050
101
1.8
99
87
2
269
29
26
18
26
1.98
85122823--85122856
15
2.2
16
94
5
61
61
17
8
11
1.54
85126240--85126309
27
2.6
27
90
6
106
28
28
14
28
1.95
85128697--85128930
50
4.7
50
87
1
290
28
27
18
25
1.98
85133117--85133173
28
2.0
28
93
0
96
45
7
12
35
1.69
85152957--85153123
54
3.1
54
91
2
255
37
22
22
17
1.94
85152957--85153123
27
6.1
27
83
6
196
37
22
22
17
1.94
85156479--85156512
16
2.1
16
100
0
68
26
44
11
17
1.83
85161023--85161159
27
5.0
27
86
5
154
36
19
24
19
1.95
85167847--85167886
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
85168721--85168861
60
2.4
59
82
9
162
26
26
19
26
1.99
85169487--85169516
8
3.8
8
100
0
60
0
23
23
53
1.46
85173279--85173338
27
2.3
26
82
2
66
33
23
16
26
1.96
85173610--85173712
27
3.8
26
74
3
71
39
20
18
21
1.92
85174070--85174177
27
4.0
27
79
7
103
30
10
19
39
1.85
85174103--85174293
27
7.1
27
82
7
219
27
8
23
40
1.84
85178487--85179870
289
4.8
290
93
1
2290
36
19
14
29
1.91
85178487--85179870
579
2.4
579
92
2
2324
36
19
14
29
1.91
85196505--85196714
40
5.3
40
83
3
203
27
22
26
23
2.00
85196498--85196728
79
2.9
79
81
4
241
27
22
26
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85196548--85196740
40
4.8
41
85
5
155
27
23
26
22
2.00
85196497--85196740
80
3.1
80
80
2
188
26
23
26
23
2.00
85203404--85203573
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
85205210--85205322
7
15.9
7
83
3
127
15
0
34
49
1.45
85212652--85212721
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
85241210--85241269
20
3.0
19
80
7
57
60
6
0
33
1.23
85255713--85255787
30
2.5
30
88
0
105
56
12
13
18
1.68
85255803--85255932
9
14.0
9
71
21
67
60
2
2
34
1.22
85255803--85255932
19
7.0
19
68
19
69
60
2
2
34
1.22
85256727--85256769
22
2.0
22
100
0
86
9
9
18
62
1.51
85260185--85260224
15
2.7
15
92
0
71
32
32
0
35
1.58
85260213--85260259
22
2.3
22
85
10
64
44
31
6
17
1.73
85263123--85263179
3
19.3
3
92
3
98
31
1
0
66
1.02
85266405--85266592
100
1.9
101
87
1
279
27
19
25
28
1.99
85266797--85266826
16
1.9
15
93
6
51
43
0
23
33
1.54
85270364--85270405
19
2.2
20
87
12
61
35
14
2
47
1.57
85272356--85272416
30
2.1
29
93
3
104
24
16
21
37
1.93
85275796--85276012
40
5.5
40
87
3
271
24
29
23
22
1.99
85275796--85276012
80
2.7
79
88
5
305
24
29
23
22
1.99
85280289--85280348
20
3.0
19
80
7
57
60
6
0
33
1.23
85280286--85280382
19
5.3
19
66
19
55
59
5
0
35
1.19
85286643--85286711
22
3.0
22
72
15
68
33
2
1
62
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85292007--85292108
29
3.5
29
90
0
150
23
33
15
27
1.95
85294492--85294743
125
2.0
125
99
0
495
27
10
23
38
1.88
85302868--85302971
48
2.2
48
82
3
120
28
34
13
23
1.92
85305312--85305487
46
3.8
45
76
10
167
29
27
20
22
1.99
85307930--85308061
29
4.5
29
97
1
237
37
14
23
24
1.92
85307930--85308061
59
2.3
58
95
1
237
37
14
23
24
1.92
85307900--85308061
88
1.8
89
90
1
263
36
14
24
25
1.93
85325469--85325493
11
2.3
11
100
0
50
16
8
24
52
1.70
85325656--85325757
51
2.0
51
98
0
195
10
25
12
50
1.72
85328020--85328170
40
3.8
40
77
13
141
25
24
27
22
2.00
85328057--85328186
40
3.2
40
80
2
154
23
23
27
24
2.00
85335637--85335812
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
85335633--85335804
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
85338760--85338838
15
5.4
15
77
10
83
10
17
13
58
1.63
85338751--85338837
29
3.0
29
81
8
95
10
17
16
56
1.67
85341223--85341398
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
85341219--85341390
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
85350916--85350971
15
3.7
15
78
7
69
12
16
12
58
1.62
85353659--85353834
46
3.8
46
75
7
176
21
19
28
29
1.98
85353655--85353827
93
1.9
93
91
2
285
21
20
29
28
1.98
85355471--85355790
138
2.3
138
91
1
507
43
5
8
43
1.57
85360349--85360374
12
2.2
12
100
0
52
23
7
15
53
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85363580--85363648
29
2.4
29
80
0
75
24
34
14
26
1.94
85363595--85363656
29
2.1
29
87
0
88
20
30
16
32
1.95
85366488--85366637
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
85366512--85366692
64
2.9
63
76
11
174
29
17
29
23
1.97
85370461--85370547
27
3.3
27
85
1
104
18
24
20
36
1.95
85370500--85370580
26
3.1
26
87
0
108
20
22
20
35
1.96
85371853--85371913
29
2.1
28
87
3
86
26
27
14
31
1.95
85376491--85376711
40
5.6
40
80
4
234
24
25
23
25
2.00
85379733--85379763
16
1.9
16
93
0
53
58
19
16
6
1.59
85381579--85381685
28
3.8
28
92
0
160
34
10
25
29
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770