Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  596  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
186546741--186546872
58
2.3
57
80
3
131
25
17
33
24
1.96
186549916--186556516
532
12.4
541
93
3
11354
33
11
18
36
1.86
186559076--186559113
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
186565381--186565449
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
186566256--186566280
12
2.1
12
100
0
50
40
0
8
52
1.31
186567080--186567249
27
6.3
27
83
5
209
28
22
8
40
1.83
186567242--186567395
27
5.7
27
84
0
218
40
20
7
31
1.80
186567080--186567247
54
3.1
54
91
0
273
28
22
8
40
1.83
186567235--186567395
81
2.0
81
88
0
241
39
20
7
32
1.80
186567242--186567392
54
2.8
54
93
0
257
41
21
6
31
1.79
186570450--186570474
12
2.1
12
100
0
50
40
0
8
52
1.31
186571276--186571443
27
6.3
27
81
8
200
29
22
7
40
1.82
186571296--186571441
79
1.8
79
84
5
197
28
21
8
41
1.81
186571401--186571584
27
6.9
26
81
2
73
39
19
7
34
1.79
186571436--186571585
54
2.8
54
92
1
248
40
21
6
31
1.79
186571436--186571588
81
1.9
80
87
1
225
39
20
7
32
1.80
186574448--186574485
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
186577883--186586076
537
15.3
540
96
2
15137
33
11
18
37
1.86
186591783--186591949
40
4.2
40
80
5
169
22
28
24
24
2.00
186599851--186599980
40
3.2
40
83
4
165
23
29
25
22
1.99
186604405--186604592
40
4.7
40
87
0
232
25
23
26
24
2.00
186604404--186604623
80
2.7
79
79
6
237
26
23
25
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
186604405--186604637
40
5.8
39
81
9
177
27
23
26
23
2.00
186604405--186604623
120
1.8
121
82
6
284
26
23
26
23
2.00
186604566--186604649
40
2.1
40
82
4
98
27
25
26
21
1.99
186612057--186612244
40
4.7
40
85
0
223
25
22
26
25
2.00
186612056--186612289
80
2.9
79
78
5
220
27
22
26
23
2.00
186612057--186612289
40
5.8
39
80
6
182
27
22
26
23
2.00
186612057--186612275
120
1.8
121
81
6
275
26
22
26
24
2.00
186614272--186614439
40
4.2
40
80
2
178
25
27
22
25
2.00
186630830--186630975
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
186630862--186631013
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
186636861--186636909
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
186637732--186637898
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
186644870--186644918
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
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1.94
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Period
Size
Copy
Number
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Indices
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Number
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25
7
41
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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