Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  331  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101300775--101300901
54
2.4
53
79
11
141
43
19
9
27
1.82
101300775--101300873
27
3.7
27
87
5
121
45
20
7
27
1.76
101300800--101300919
27
4.4
27
83
4
109
40
18
13
27
1.88
101301507--101301590
41
2.0
41
100
0
168
28
20
21
29
1.98
101301578--101301662
28
3.0
28
91
0
134
47
22
9
21
1.79
101304730--101304819
27
3.3
27
85
3
119
40
17
10
32
1.83
101304730--101304836
54
2.0
54
81
7
128
38
20
10
30
1.86
101304825--101305143
27
11.8
27
86
0
332
28
21
8
41
1.83
101304771--101305061
81
3.6
81
84
0
206
29
22
9
38
1.85
101304825--101305142
81
3.9
81
89
0
429
28
21
8
41
1.83
101305122--101305207
27
3.2
27
86
6
86
41
24
5
27
1.78
101304825--101305143
54
5.9
54
90
0
449
28
21
8
41
1.83
101305136--101305262
54
2.4
53
79
11
141
43
19
9
27
1.82
101305136--101305234
27
3.7
27
87
5
121
45
20
7
27
1.76
101305161--101305280
27
4.4
27
83
4
109
40
18
13
27
1.88
101305870--101305953
41
2.0
41
100
0
168
28
20
21
29
1.98
101305942--101306024
28
3.0
28
96
0
148
46
20
9
22
1.79
101310709--101310766
27
2.1
27
93
0
98
32
20
24
22
1.98
101311531--101311590
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
101313552--101313605
20
2.7
20
70
0
54
20
27
22
29
1.98
101314333--101314408
38
2.0
38
100
0
152
44
7
21
26
1.79
101319602--101319703
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101327461--101327562
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
101333076--101333208
54
2.5
54
97
1
250
32
25
19
22
1.97
101340467--101340648
40
4.6
40
79
6
183
24
24
27
23
2.00
101340467--101340650
79
2.3
81
83
6
225
23
24
27
23
2.00
101340468--101340658
39
4.8
40
79
7
149
24
24
28
23
2.00
101343479--101343548
27
2.5
28
90
2
115
30
14
25
30
1.95
101343481--101343560
27
2.9
27
83
9
65
30
16
22
31
1.96
101352748--101352915
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
101358793--101358893
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
101363831--101363998
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
101373185--101373241
29
2.0
29
85
0
78
38
3
28
29
1.73
101373578--101373832
55
4.8
54
80
8
260
36
16
25
21
1.94
101373585--101373834
108
2.4
109
81
9
302
35
16
25
22
1.95
101374028--101374058
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
101377311--101377572
40
6.6
40
90
1
375
25
21
26
26
1.99
101385486--101385707
40
5.6
40
92
1
358
26
22
26
24
2.00
101388159--101388210
25
2.1
24
89
3
77
38
21
23
17
1.93
101395030--101395259
48
4.8
47
75
4
138
30
19
23
25
1.98
101395128--101395274
48
3.1
46
73
5
132
30
22
23
23
1.99
101395059--101395259
96
2.1
96
83
1
242
31
20
22
24
1.98
101402120--101402381
46
5.7
46
72
15
207
22
19
27
30
1.98
101402166--101402330
47
3.5
47
75
14
187
21
17
29
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101402112--101402376
93
2.8
93
91
0
413
22
20
27
29
1.98
101411184--101411359
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
101411181--101411352
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
101418467--101418510
19
2.4
19
85
7
56
50
2
9
38
1.47
101421376--101421419
19
2.4
19
85
7
56
50
2
9
38
1.47
101426577--101426752
46
3.8
46
77
12
198
20
20
28
30
1.98
101426574--101426745
93
1.8
93
93
0
299
20
20
29
29
1.98
101429557--101429602
24
1.9
24
100
0
92
17
34
15
32
1.91
101433559--101433730
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
101433551--101433726
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
101436103--101436191
30
3.0
30
79
11
94
56
15
17
10
1.67
101436103--101436185
15
5.6
14
73
10
58
55
16
18
9
1.68
101436114--101436191
15
5.2
15
75
9
70
55
15
17
11
1.69
101439364--101439648
27
10.6
27
78
5
200
31
10
18
38
1.85
101439345--101439648
54
5.6
54
76
5
229
30
10
19
39
1.85
101439371--101439620
80
3.1
81
82
6
258
31
10
18
40
1.84
101439371--101439648
80
3.4
80
79
8
215
30
9
19
39
1.84
101439365--101439683
27
11.9
27
74
11
120
32
9
18
39
1.84
101439672--101439736
27
2.4
27
92
0
103
29
20
15
35
1.93
101442884--101443006
41
3.0
41
97
0
228
25
30
23
20
1.98
101443266--101443558
27
10.9
26
75
9
153
31
9
18
41
1.81
101443271--101443426
27
5.7
27
79
10
158
28
8
19
44
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101443285--101443506
80
2.7
80
83
5
259
28
8
18
44
1.78
101443266--101443523
54
4.8
54
75
8
211
30
9
18
41
1.82
101443271--101443523
107
2.3
109
80
4
280
29
8
19
42
1.81
101443501--101443558
26
2.2
27
84
3
73
39
8
12
39
1.73
101448306--101448360
28
1.9
29
85
3
76
21
43
20
14
1.87
101454972--101455016
16
2.6
18
79
17
58
31
2
0
66
1.04
101454968--101455014
17
2.8
16
83
6
58
31
2
0
65
1.04
101455069--101455113
14
2.9
16
77
12
58
44
0
0
55
0.99
101455057--101455101
23
1.9
24
90
4
74
44
0
0
55
0.99
101458783--101458839
30
1.9
29
85
3
78
47
5
33
14
1.66
101465856--101465897
21
2.0
21
90
0
66
30
26
7
35
1.83
101469886--101470030
40
3.6
40
94
1
247
22
22
28
26
1.99
101469890--101469955
22
3.2
22
60
24
52
22
21
27
28
1.99
101469886--101470063
40
4.5
40
90
3
238
23
22
28
25
1.99
101477900--101478114
40
5.5
39
92
5
303
22
23
28
25
1.99
101482058--101482109
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
101487275--101487482
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
101487275--101487480
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
101495155--101495202
18
2.6
19
80
12
55
25
2
6
66
1.26
101500424--101500552
46
2.8
47
82
3
163
27
20
29
21
1.98
101500610--101500742
49
2.7
49
79
0
140
30
21
24
22
1.99
101501642--101501702
30
2.0
30
96
0
113
14
34
34
16
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101503275--101503306
15
2.1
15
100
0
64
53
6
25
15
1.65
101505077--101505506
2
221.5
2
73
6
294
39
0
59
0
1.05
101505077--101505517
16
26.9
16
78
11
326
39
0
59
0
1.06
101506259--101506325
30
2.2
31
91
2
109
26
11
16
44
1.82
101506370--101506450
31
2.7
30
84
5
101
45
14
14
24
1.83
101513397--101513427
7
4.4
7
100
0
62
0
12
16
70
1.16
101517121--101517238
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
101517089--101517252
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
101524687--101524804
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
101524655--101524818
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
101526573--101526675
30
3.6
29
84
10
131
28
17
27
27
1.98
101530420--101530450
14
2.2
14
94
0
53
35
32
9
22
1.87
101539692--101539728
2
18.0
2
88
5
56
51
0
2
45
1.15
101592652--101592682
15
2.1
15
100
0
62
48
19
19
12
1.81
101597383--101597425
18
2.4
18
88
0
59
9
13
6
69
1.35
101598047--101598078
15
2.0
17
88
11
50
56
9
3
31
1.47
101598214--101598252
17
2.3
17
86
8
53
69
5
2
23
1.21
101598321--101598351
9
3.4
9
95
0
53
58
0
0
41
0.98
101598310--101598352
9
4.8
9
85
0
50
62
0
2
34
1.08
101598334--101598377
19
2.2
21
88
8
65
63
0
2
34
1.07
101598538--101598564
13
2.1
13
100
0
54
44
7
0
48
1.31
101598952--101599010
21
2.8
21
80
14
68
35
5
0
59
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101598973--101599074
17
6.4
17
76
17
103
36
1
0
61
1.07
101598973--101599073
16
6.4
16
74
19
79
36
1
0
61
1.07
101598975--101599072
19
5.1
18
73
24
76
35
2
0
62
1.07
101599015--101599098
32
2.6
33
81
7
82
32
2
1
64
1.14
101598944--101599074
42
3.0
41
76
14
113
35
3
0
61
1.12
101600339--101600372
14
2.4
14
90
0
50
14
17
0
67
1.23
101600652--101600698
20
2.3
20
78
7
51
23
8
0
68
1.17
101601689--101601739
16
3.2
16
97
0
93
52
13
11
21
1.72
101602657--101602690
16
2.1
17
94
5
61
23
11
0
64
1.26
101603363--101603393
15
2.1
15
100
0
62
67
0
12
19
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770