Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  680  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214211942--214212048
40
2.7
40
97
0
196
24
28
21
25
1.99
214214223--214214290
26
2.6
26
81
4
75
38
23
20
17
1.93
214214248--214214303
26
2.2
26
83
6
69
41
25
19
14
1.89
214214327--214214410
20
4.2
20
84
0
96
41
22
22
13
1.88
214215502--214215536
17
2.1
17
94
0
61
22
14
42
20
1.88
214217836--214217988
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
214222163--214222256
29
3.2
29
96
0
170
30
15
27
25
1.96
214222159--214222293
58
2.3
58
83
3
166
27
15
31
25
1.96
214228836--214228906
15
5.1
14
71
10
56
78
1
14
5
0.99
214228837--214228908
19
3.6
19
82
15
83
79
1
13
5
0.98
214230068--214230159
29
3.2
29
92
3
152
30
16
28
25
1.96
214230064--214230196
58
2.4
56
82
6
153
27
15
32
24
1.96
214237954--214238018
29
2.2
29
91
2
103
32
16
27
23
1.96
214242908--214243012
22
4.6
22
76
12
95
34
18
20
26
1.96
214242901--214243023
23
5.3
23
71
14
83
31
18
22
26
1.97
214245965--214246131
46
3.6
46
78
4
131
22
29
19
28
1.98
214246007--214246133
46
2.8
46
84
2
157
20
31
19
28
1.97
214252065--214252274
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
214260201--214260410
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
214262500--214262640
41
3.4
41
77
11
128
27
11
29
31
1.91
214264223--214264376
77
2.0
77
94
0
272
25
23
31
18
1.97
214265355--214265487
30
4.6
29
84
11
159
48
13
16
21
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214265350--214265462
6
18.8
6
79
13
126
49
14
15
21
1.79
214265605--214265678
27
2.8
25
80
13
85
37
21
22
17
1.94
214265629--214265686
27
2.1
27
81
6
64
37
27
18
15
1.92
214265843--214265901
22
2.7
22
81
0
64
32
22
25
20
1.98
214265989--214266071
27
3.1
26
86
5
103
37
20
21
20
1.95
214266270--214266456
27
7.0
27
86
0
241
25
20
19
34
1.96
214266474--214266797
27
12.0
27
83
3
375
41
10
21
27
1.85
214271593--214271759
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
214271593--214271759
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
214272585--214272630
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
214284949--214285130
39
4.6
39
88
2
231
23
31
23
22
1.99
214294890--214294956
3
23.0
3
71
17
52
28
0
5
65
1.16
214294890--214294956
12
5.8
12
74
13
68
28
0
5
65
1.16
214294886--214294970
18
4.8
18
69
13
61
31
0
5
62
1.19
214295527--214295567
23
1.9
21
85
14
57
53
0
21
24
1.46
214296467--214296890
44
9.4
44
89
5
650
22
34
17
25
1.96
214296684--214296708
11
2.3
11
100
0
50
32
32
28
8
1.86
214296467--214296890
231
1.8
231
94
0
758
22
34
17
25
1.96
214296552--214296840
143
2.0
143
93
0
488
23
34
17
24
1.95
214296508--214296881
187
2.0
187
94
0
649
22
34
17
25
1.96
214296853--214297071
88
2.5
88
89
0
332
28
26
16
28
1.97
214301046--214301093
19
2.5
19
93
0
87
41
16
20
20
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214301056--214301108
24
2.3
22
84
15
63
39
16
22
20
1.92
214303103--214303128
7
3.7
7
100
0
52
15
0
0
84
0.62
214303204--214303241
19
2.0
19
100
0
76
31
10
26
31
1.90
214304425--214304468
8
5.5
8
81
10
54
9
6
0
84
0.79
214304425--214304468
15
2.7
17
86
6
56
9
6
0
84
0.79
214304746--214304974
42
5.4
44
89
9
354
22
32
17
26
1.97
214316746--214316782
6
6.2
6
96
0
65
29
0
0
70
0.88
214316939--214317029
45
2.0
45
95
0
164
39
27
19
13
1.89
214323437--214323603
40
4.2
40
79
2
167
24
26
22
26
2.00
214323453--214323603
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
26
2.00
214331448--214331614
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
214331464--214331614
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
214336076--214336178
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
214347872--214347933
25
2.5
24
80
10
72
74
1
17
6
1.11
214355237--214355299
25
2.5
24
80
7
72
74
1
17
6
1.10
214357618--214357673
29
1.9
29
100
0
112
28
14
21
35
1.92
214364010--214364217
40
5.2
39
85
4
240
25
27
22
24
2.00
214372092--214372253
40
4.2
40
72
10
140
25
27
21
25
1.99
214380126--214380292
40
4.2
40
83
3
196
26
26
21
25
1.99
214380117--214380292
79
2.2
80
82
2
212
26
26
21
25
2.00
214388170--214388334
40
4.2
40
81
5
203
26
26
21
25
2.00
214388161--214388334
77
2.2
80
83
4
221
25
26
21
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214392286--214392452
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
214398969--214399083
60
1.9
59
86
8
162
40
17
15
26
1.89
214400274--214400440
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
214406302--214406470
46
3.7
47
74
19
158
21
21
27
28
1.99
214406299--214406468
92
1.8
93
88
6
265
21
21
28
28
1.99
214408037--214408240
104
2.0
104
97
0
381
25
29
24
21
1.99
214408895--214409151
46
5.5
44
75
10
183
21
30
18
29
1.97
214416154--214416311
86
1.8
86
90
2
255
31
18
17
33
1.94
214425186--214425316
29
4.5
29
78
5
122
25
17
32
25
1.97
214426896--214427044
27
5.5
27
91
0
226
33
22
20
23
1.97
214427494--214427553
22
2.7
22
84
5
68
21
21
21
35
1.96
214427712--214427785
27
2.8
27
89
2
105
17
24
21
36
1.95
214427924--214428050
6
20.7
6
77
15
118
18
15
16
49
1.80
214427924--214428030
31
3.5
31
90
0
160
17
15
16
49
1.80
214429997--214430091
27
3.5
27
76
11
95
43
20
7
29
1.78
214430096--214430157
27
2.3
27
97
0
115
33
24
6
35
1.81
214430109--214430355
27
9.2
27
77
6
198
39
22
7
30
1.82
214430118--214430355
54
4.4
53
82
4
219
39
21
7
30
1.81
214430138--214430355
81
2.7
81
85
4
244
40
22
7
29
1.82
214430202--214430442
27
9.0
27
84
3
213
40
20
11
27
1.87
214430313--214430462
81
1.9
81
86
0
219
38
21
16
24
1.93
214430321--214430462
27
5.3
27
88
0
194
37
21
17
23
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214430907--214430971
22
3.0
22
80
8
78
20
23
23
33
1.97
214431343--214431403
31
2.0
31
96
0
113
22
16
11
49
1.78
214431365--214431442
6
12.8
6
76
12
79
19
17
15
47
1.83
214431347--214431434
31
2.9
31
84
5
108
21
18
13
46
1.83
214432374--214432407
17
1.9
17
88
5
50
20
44
26
8
1.81
214434182--214434282
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
214434182--214434332
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99
214434178--214434349
40
4.4
38
77
10
161
29
21
26
23
1.99
214442198--214442298
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
214442198--214442380
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
214452507--214452605
28
3.5
29
82
6
114
28
15
26
30
1.96
214458628--214458717
40
2.2
40
82
7
121
24
28
23
23
1.99
214466621--214466788
40
4.2
40
80
4
169
23
27
23
25
2.00
214468496--214468577
24
3.4
24
98
0
155
25
21
21
30
1.99
214468627--214468687
20
3.0
20
92
0
104
32
21
11
34
1.89
214468730--214468777
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
214480304--214480406
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
214482375--214482519
40
3.6
40
81
7
177
23
25
24
26
2.00
214486493--214486563
25
2.8
25
84
0
88
30
23
16
28
1.97
214493600--214493805
40
5.2
40
84
0
259
23
28
16
32
1.95
214495169--214495224
25
2.2
25
81
6
69
0
32
3
64
1.11
214495180--214495245
33
2.0
34
87
3
98
1
31
1
65
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
214495182--214495223
15
2.7
15
79
17
50
0
30
0
69
0.89
214495182--214495223
14
2.7
15
82
14
50
0
30
0
69
0.89
214496866--214497029
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
214496866--214497063
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
214510704--214510773
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
214516679--214516801
49
2.5
49
95
0
219
26
10
33
29
1.90
214516904--214516981
37
2.1
37
100
0
156
28
19
32
20
1.97
214518991--214519329
29
11.7
29
94
0
554
25
16
32
25
1.96
214519813--214519911
41
2.4
41
80
11
114
26
25
24
24
2.00
214523013--214523135
49
2.5
49
95
0
219
26
10
33
29
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770