Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  567  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
176711120--176711155
16
2.2
16
95
0
63
52
0
47
0
1.00
176720305--176720374
33
2.2
30
82
9
86
52
2
5
38
1.40
176720521--176720552
14
2.1
16
88
11
50
65
0
6
28
1.16
176720590--176720628
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
176720732--176720795
3
21.3
3
100
0
128
67
0
0
32
0.91
176721377--176721407
12
2.6
12
100
0
62
12
0
6
80
0.89
176721785--176721853
35
2.0
35
94
0
120
21
10
49
18
1.77
176722454--176722852
116
3.4
116
96
0
719
35
23
14
27
1.93
176722855--176722883
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
176722869--176723015
77
1.9
78
90
5
235
30
21
17
29
1.96
176722792--176723096
164
1.9
165
97
0
576
33
21
18
26
1.96
176723880--176723922
21
2.0
21
81
4
50
13
16
16
53
1.73
176735456--176735528
33
2.3
30
82
11
92
54
2
5
36
1.38
176735743--176735963
3
71.0
3
75
14
132
60
5
3
31
1.35
176736406--176736438
11
3.1
11
91
4
50
48
0
51
0
1.00
176736516--176736558
13
3.6
12
93
6
70
11
0
6
81
0.87
176736515--176736558
12
3.5
13
90
9
74
11
0
6
81
0.86
176738151--176738229
38
2.1
38
92
7
133
27
32
10
29
1.89
176738190--176738381
49
4.0
49
93
1
307
28
32
8
29
1.87
176741755--176741947
29
6.7
29
96
0
341
24
32
16
26
1.96
176742189--176742381
40
4.8
40
96
0
278
24
24
20
29
1.99
176744197--176744287
37
2.4
37
92
1
155
24
32
18
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
176744383--176744685
49
6.4
49
89
7
473
29
32
9
29
1.88
176749958--176750035
26
2.9
28
72
9
74
29
15
23
32
1.95
176749882--176750052
79
2.2
79
82
4
211
28
15
24
31
1.96
176749959--176750058
53
1.9
52
84
10
132
28
17
23
32
1.96
176751474--176751602
46
3.0
43
85
10
156
24
30
22
22
1.99
176751600--176751706
38
2.8
38
95
0
187
29
25
22
22
1.99
176755448--176755479
14
2.1
16
88
11
50
65
0
6
28
1.16
176755635--176755680
3
15.3
3
100
0
92
67
0
0
32
0.91
176756115--176756155
11
3.6
12
87
9
59
46
0
53
0
1.00
176756248--176756278
12
2.6
12
100
0
62
12
0
6
80
0.89
176756661--176756729
35
2.0
35
91
0
111
23
10
47
18
1.79
176757345--176757728
116
3.3
116
97
0
705
35
23
14
26
1.93
176757459--176757656
53
3.5
53
70
20
170
36
23
14
25
1.93
176757731--176757759
14
2.1
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indices
Period
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Copy
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Percent
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20
22
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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