Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  333  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101947538--101947585
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
101953671--101953767
30
3.2
30
75
2
97
29
15
25
28
1.96
101955988--101956084
30
3.2
30
76
2
97
29
14
26
28
1.95
101956634--101956696
18
3.4
18
78
10
74
11
15
3
69
1.29
101961365--101961427
18
3.4
18
78
10
74
11
15
3
69
1.29
101972761--101972866
42
2.5
42
95
1
194
33
12
13
40
1.81
101972849--101972893
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
101974058--101974091
14
2.5
14
95
4
61
79
5
0
14
0.91
101979372--101979438
20
3.2
20
67
29
59
35
14
8
40
1.78
101979343--101979448
42
2.5
42
96
1
194
33
12
13
40
1.81
101979350--101979419
22
3.3
22
66
28
60
35
11
14
38
1.82
101979368--101979433
22
3.1
22
65
30
61
34
16
10
37
1.83
101979431--101979475
14
3.3
14
84
6
65
37
0
13
48
1.42
101985218--101985263
10
4.5
10
81
5
56
15
23
21
39
1.92
101985215--101985263
21
2.4
20
89
3
71
14
22
22
40
1.90
101985488--101985512
13
1.9
13
100
0
50
28
0
8
64
1.22
101988151--101988198
20
2.4
20
75
0
60
20
29
18
31
1.97
101991884--101991931
15
3.3
15
73
5
53
31
0
25
43
1.55
101991878--101991937
29
2.1
29
90
0
93
30
0
28
41
1.56
101993778--101993816
10
3.7
10
89
6
51
17
2
5
74
1.12
101993779--101993820
21
2.0
21
90
0
66
21
2
7
69
1.25
101993787--101993831
11
4.1
11
83
11
56
28
0
4
66
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101993778--101993820
11
4.0
11
84
6
61
20
2
6
69
1.23
101993787--101993827
21
2.0
21
90
0
64
26
0
4
68
1.10
101993791--101993842
12
4.5
11
83
11
52
25
1
3
69
1.16
101997697--101997723
10
2.7
10
100
0
54
18
11
29
40
1.85
102002879--102002909
11
2.7
12
95
5
55
9
6
6
77
1.12
102004527--102004553
10
2.7
10
100
0
54
18
11
29
40
1.85
102023678--102023901
50
4.5
49
78
8
204
24
18
26
30
1.98
102028224--102028458
39
6.0
40
82
4
221
25
26
23
25
2.00
102035261--102035443
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99
102039530--102039962
94
4.7
94
92
2
702
30
11
19
38
1.87
102039997--102040059
24
2.6
24
82
5
74
17
19
31
31
1.95
102042253--102042390
39
3.5
39
85
2
159
23
26
23
26
2.00
102042287--102042407
40
3.0
40
85
1
154
25
24
21
28
1.99
102043842--102043997
68
2.2
68
77
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Size
Copy
Number
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
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Indices
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Size
Copy
Number
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1.97
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Copy
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18
14
50
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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