Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  631  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
197932047--197932213
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
197933030--197933075
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
197936575--197936607
12
2.8
12
100
0
66
6
24
33
36
1.80
197936631--197936919
81
3.6
79
86
3
362
34
20
24
21
1.97
197936639--197936923
41
7.0
41
88
5
346
33
20
24
21
1.97
197936960--197937030
37
1.9
37
85
0
97
46
30
0
22
1.52
197937160--197937206
7
6.7
7
85
0
58
23
2
27
46
1.63
197937160--197937205
14
3.3
14
84
0
65
21
2
28
47
1.62
197937799--197937831
7
4.6
7
96
3
57
63
0
0
36
0.95
197937799--197937874
8
10.1
8
83
11
72
68
1
0
30
0.98
197937799--197937874
15
5.1
15
80
3
73
68
1
0
30
0.98
197941848--197941876
2
14.5
2
100
0
58
0
0
48
51
1.00
197942040--197942095
22
2.6
20
76
15
58
58
1
1
37
1.19
197942118--197942278
43
3.8
43
87
1
216
27
16
27
27
1.97
197942383--197942447
3
21.7
3
84
6
87
27
0
1
70
0.96
197943568--197943616
25
2.0
26
84
8
66
24
16
20
38
1.92
197945105--197945239
26
5.2
26
94
1
227
36
25
5
33
1.78
197945105--197945239
51
2.6
52
96
1
245
36
25
5
33
1.78
197949412--197949460
25
2.0
26
84
8
66
24
16
20
38
1.92
197951986--197952047
25
2.4
27
84
10
76
37
6
3
53
1.43
197967732--197967841
26
4.2
26
92
0
175
37
23
5
33
1.78
197970675--197970825
53
2.8
53
87
4
196
25
17
27
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
197973439--197973614
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
197973436--197973607
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
197978007--197978048
18
2.3
18
100
0
84
42
16
16
23
1.88
197980989--197981164
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
197980986--197981157
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
197985069--197985235
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
197985064--197985235
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
197992550--197992715
35
4.6
35
86
8
192
33
24
10
31
1.90
197992545--197992717
75
2.4
72
83
11
221
33
23
10
31
1.90
197996685--197996718
16
2.1
16
88
0
50
58
5
5
29
1.45
197997205--197997266
29
2.2
27
82
8
70
33
9
0
56
1.32
197997231--197997289
21
3.0
21
81
13
63
27
8
0
64
1.22
197997253--197997303
20
2.5
21
75
15
54
23
7
0
68
1.15
197997230--197997315
33
2.6
35
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Period
Size
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1.95
Indices
Period
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1.95
Indices
Period
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35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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