Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  228  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68291567--68291729
41
4.1
40
78
12
172
27
26
22
23
2.00
68300052--68300208
41
3.9
41
78
9
153
28
27
21
22
1.99
68302753--68302881
62
2.1
63
94
1
224
49
3
9
37
1.53
68304714--68304749
18
2.0
18
94
0
63
36
27
8
27
1.86
68312338--68312376
15
2.5
15
84
15
53
2
25
0
71
0.98
68323332--68323539
40
5.2
40
80
5
197
26
22
25
25
2.00
68323334--68323539
80
2.6
80
84
0
250
26
22
26
25
2.00
68341094--68341163
29
2.4
29
90
6
108
30
27
14
28
1.95
68344525--68344698
46
3.8
46
78
15
207
29
29
20
20
1.98
68347496--68347702
40
5.2
40
83
5
231
26
22
26
25
2.00
68347496--68347702
80
2.6
80
84
2
256
26
22
26
25
2.00
68352437--68352519
29
2.9
29
94
0
139
27
14
31
26
1.95
68360507--68360589
29
2.9
29
94
0
139
27
14
31
26
1.95
68367300--68367463
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
68367300--68367497
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
68371804--68371873
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
68375091--68375153
24
2.6
24
97
0
117
20
15
26
36
1.93
68379207--68379701
47
10.4
47
90
3
720
27
30
9
32
1.88
68379257--68379335
25
3.3
25
66
16
67
31
30
5
32
1.79
68379218--68379701
143
3.4
142
92
2
767
27
30
9
32
1.88
68383337--68383643
27
11.6
27
73
12
147
41
19
7
30
1.80
68383483--68383639
55
2.9
55
75
10
151
44
19
7
28
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68383380--68383666
27
10.8
27
76
8
196
42
20
8
29
1.80
68384102--68384150
22
2.2
22
78
7
55
26
28
16
28
1.97
68387414--68387576
40
4.1
40
83
4
186
24
20
27
27
1.99
68395496--68395657
40
4.1
40
80
6
175
24
20
27
28
1.99
68399778--68399893
42
2.7
43
76
12
123
31
16
23
28
1.96
68405348--68405563
48
4.6
47
80
8
194
25
30
16
26
1.97
68405349--68405527
96
1.9
96
83
9
240
26
30
16
26
1.96
68405526--68405657
47
2.8
47
82
8
171
22
27
21
28
1.99
68405683--68405796
56
2.0
56
98
0
219
28
19
18
34
1.95
68424676--68424846
43
4.0
43
71
11
161
33
25
15
25
1.95
68425931--68425957
13
2.1
13
100
0
54
48
14
0
37
1.45
68428148--68428215
26
2.6
26
85
0
91
17
16
22
44
1.87
68433405--68433441
17
2.1
18
85
14
51
54
0
8
37
1.30
68434786--68434890
55
1.9
55
92
0
174
27
27
25
19
1.98
68437161--68437225
32
2.0
32
85
5
87
40
29
16
13
1.88
68449831--68449855
13
1.9
13
100
0
50
8
0
16
76
1.02
68454767--68454986
40
5.5
40
90
2
300
26
25
22
25
2.00
68454767--68454986
79
2.8
80
86
4
302
26
25
22
25
2.00
68462537--68462709
40
4.3
40
88
2
231
26
25
21
26
2.00
68464433--68464461
15
1.9
15
100
0
58
0
24
0
75
0.80
68471965--68472103
42
3.2
43
75
9
122
28
20
23
28
1.99
68480403--68480573
43
4.0
42
72
13
125
28
15
22
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68487247--68487359
42
2.7
43
89
8
162
27
15
28
29
1.96
68491288--68491455
40
4.2
40
77
3
151
22
26
23
27
2.00
68498193--68498226
12
2.8
12
86
0
50
38
2
2
55
1.30
68498366--68498418
22
2.5
22
84
9
65
60
3
1
33
1.26
68498395--68498426
15
2.1
16
94
5
57
65
0
0
34
0.93
68498394--68498476
30
3.0
28
77
7
80
53
1
1
44
1.16
68499762--68499828
27
2.5
27
100
0
134
16
31
37
14
1.89
68499909--68499977
16
4.3
15
74
20
59
65
0
33
1
1.02
68499909--68499976
24
2.8
25
76
13
70
66
0
32
1
1.01
68503984--68504058
32
2.3
32
81
6
89
17
17
44
21
1.87
68504109--68504245
72
1.9
72
92
0
229
34
19
25
20
1.96
68506299--68506340
22
2.0
21
90
4
66
33
0
7
59
1.25
68506110--68507020
145
6.1
146
79
11
913
29
8
6
56
1.53
68506110--68507021
301
3.1
295
86
7
1217
29
8
6
56
1.53
68506827--68506886
30
2.1
28
84
12
77
23
5
3
68
1.24
68507109--68507167
30
1.9
31
93
3
102
27
5
0
67
1.11
68506901--68507153
136
1.9
130
79
9
280
29
8
6
55
1.55
68507604--68507666
14
4.4
14
74
14
58
0
31
0
68
0.90
68507615--68507661
19
2.6
18
78
15
51
0
36
0
63
0.94
68507703--68507770
19
3.8
17
70
19
50
0
36
0
63
0.95
68507719--68507757
8
4.9
8
96
0
69
0
46
0
53
1.00
68507863--68507934
27
2.7
27
97
0
135
16
38
29
15
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68508077--68508114
18
2.1
18
85
9
51
21
2
0
76
0.91
68508774--68508917
77
1.9
77
94
1
254
37
11
6
45
1.65
68511883--68511943
32
1.9
32
82
0
77
47
40
3
8
1.49
68525894--68526226
67
4.9
70
81
11
322
27
14
22
34
1.94
68526318--68526456
52
2.6
53
89
6
219
29
16
18
35
1.93
68526415--68526623
84
2.6
79
85
8
276
25
16
20
36
1.94
68526580--68526784
54
3.8
53
86
5
268
29
15
19
36
1.92
68526579--68526784
108
1.9
108
87
2
306
29
15
18
36
1.91
68527019--68527114
45
2.1
45
96
0
174
22
27
27
22
1.99
68536202--68536289
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
68536202--68536280
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
68536213--68536289
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
68544178--68544305
40
3.2
39
79
6
132
24
26
22
26
2.00
68551293--68551500
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
68551293--68551498
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
68557768--68557847
27
3.0
27
84
0
106
35
21
20
23
1.96
68557996--68558074
27
3.0
27
90
1
115
17
22
21
37
1.94
68558210--68558270
28
2.2
28
87
0
86
22
22
26
27
1.99
68562176--68562285
42
2.6
43
78
7
127
26
19
23
30
1.98
68565284--68565337
22
2.5
22
80
11
58
59
7
1
31
1.36
68565364--68565485
52
2.4
52
78
15
137
64
0
7
27
1.20
68565408--68565453
15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68565421--68565528
29
3.8
28
70
12
85
63
0
8
26
1.28
68565402--68565488
44
2.0
44
82
13
108
65
0
8
26
1.20
68565400--68565516
15
8.1
14
71
18
62
64
0
8
26
1.22
68566422--68566999
44
13.1
43
66
18
224
23
23
20
33
1.97
68566428--68566999
88
6.5
88
87
2
761
22
23
20
32
1.98
68566955--68567476
176
2.9
176
86
2
708
28
21
18
30
1.97
68567312--68567609
133
2.2
133
90
0
470
29
20
18
30
1.97
68567469--68568141
177
3.8
176
88
1
961
27
21
19
31
1.97
68566959--68568507
665
2.3
665
92
0
2580
27
22
19
31
1.97
68567977--68568274
133
2.2
133
89
0
452
28
21
18
30
1.97
68568132--68568507
177
2.1
177
90
0
599
27
21
19
32
1.97
68567977--68568362
133
2.9
133
82
5
390
27
22
18
31
1.97
68577693--68577730
19
2.1
18
85
9
51
13
18
2
65
1.37
68584304--68584373
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
68592133--68592202
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
68610609--68610778
93
1.8
93
92
2
288
30
28
19
22
1.98
68610603--68610775
46
3.7
47
76
15
189
30
27
19
22
1.98
68612789--68612857
28
2.5
28
85
0
93
28
33
13
24
1.93
68612872--68612947
40
1.9
40
86
0
107
35
30
14
19
1.92
68616414--68616524
22
5.0
22
82
12
138
25
21
19
33
1.97
68616424--68616524
44
2.3
45
92
1
168
24
20
20
33
1.97
68616954--68617040
43
2.0
43
100
0
174
28
20
13
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68617878--68617911
16
2.1
16
100
0
68
11
17
38
32
1.86
68627037--68627291
55
4.8
55
77
10
230
34
18
25
21
1.96
68627481--68627511
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
68635242--68635271
15
2.0
15
93
0
51
30
20
10
40
1.85
68642063--68642087
13
1.9
13
100
0
50
44
0
8
48
1.32
68643612--68643685
37
2.0
37
91
0
121
45
22
10
20
1.82
68647384--68647461
21
3.6
21
77
14
79
17
5
1
75
1.05
68647375--68647441
6
11.5
6
82
6
68
16
4
1
77
1.00
68647381--68647422
16
2.8
15
80
20
52
16
4
0
78
0.91
68647384--68647461
5
14.6
5
73
21
61
17
5
1
75
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770