Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  756  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
239663916--239663980
31
2.1
31
88
0
94
29
12
32
26
1.92
239667515--239667555
19
2.2
19
86
8
57
39
2
2
56
1.26
239668678--239668726
20
2.5
20
86
0
71
36
14
26
22
1.92
239674706--239674872
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
239682947--239683159
40
5.4
39
82
7
200
23
25
23
26
2.00
239682971--239683160
40
4.8
40
85
3
222
24
26
22
25
2.00
239682981--239683160
79
2.3
79
82
3
218
24
26
23
25
2.00
239687552--239687659
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
239693691--239693798
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
239699808--239699915
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
239706803--239707056
40
6.5
40
85
7
326
24
22
28
24
2.00
239706803--239707056
79
3.2
80
86
6
326
24
22
28
24
2.00
239706803--239707056
119
2.2
117
85
8
347
24
22
28
24
2.00
239710454--239710581
40
3.2
40
81
0
139
23
27
22
26
2.00
239713042--239713086
22
2.0
22
100
0
90
17
15
44
22
1.86
239720465--239720511
22
2.3
20
82
13
60
70
8
4
17
1.29
239722183--239722352
41
4.2
40
74
18
161
27
27
22
22
1.99
239730529--239730698
41
4.2
40
74
18
161
27
27
22
22
1.99
239738801--239738870
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
239738801--239738882
27
3.0
27
84
8
69
28
15
25
30
1.96
239746953--239747022
27
2.5
28
93
2
115
27
14
28
30
1.95
239746953--239747034
27
3.0
27
84
8
69
28
15
25
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
239750003--239750150
40
3.7
40
84
4
174
23
27
22
26
2.00
239758018--239758162
39
3.8
36
81
10
121
24
28
22
25
1.99
239760026--239760076
25
2.0
25
100
0
102
33
15
7
43
1.76
239761247--239761452
53
3.9
54
83
6
240
35
16
24
22
1.95
239767065--239767103
15
2.7
14
84
4
51
87
5
7
0
0.68
239767065--239767102
17
2.3
17
90
4
60
89
2
7
0
0.57
239767067--239767100
12
2.9
11
91
8
50
88
2
8
0
0.62
239767096--239767127
16
1.9
17
93
6
57
56
37
0
6
1.25
239767135--239767181
22
2.0
24
88
8
71
76
8
8
6
1.15
239767650--239767788
39
3.5
39
69
20
99
36
5
4
53
1.45
239769722--239769757
12
3.0
12
87
0
54
25
22
5
47
1.73
239776653--239777047
67
6.1
65
72
15
282
25
14
22
37
1.92
239776632--239776888
67
3.8
68
82
6
315
25
14
22
38
1.91
239776720--239777149
193
2.2
192
84
7
529
26
14
22
36
1.93
239776465--239777077
256
2.4
255
91
6
967
26
14
22
36
1.92
239776889--239777077
69
2.7
68
81
11
222
25
13
22
38
1.91
239777028--239777130
53
1.9
54
88
7
158
28
13
18
39
1.88
239776783--239777475
307
2.2
319
90
7
1083
25
15
22
37
1.93
239777424--239777563
74
1.9
73
88
4
208
27
20
24
27
1.99
239777424--239777897
165
2.9
162
87
7
642
29
17
20
32
1.96
239777750--239777936
73
2.6
73
79
7
229
31
16
20
31
1.95
239777878--239778099
81
2.6
87
79
13
214
27
16
17
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
239778081--239778136
28
2.0
29
92
3
96
21
8
30
39
1.84
239782080--239782189
40
2.7
40
79
12
125
23
14
27
34
1.94
239782141--239782237
44
2.3
44
80
8
103
25
15
24
34
1.95
239788342--239788526
40
4.6
39
86
5
212
27
27
20
25
1.99
239794675--239794720
22
2.0
23
95
4
85
23
13
45
17
1.83
239796427--239796499
31
2.5
31
86
8
100
28
5
17
47
1.70
239796409--239796499
31
3.1
31
78
16
95
29
5
16
48
1.69
239797905--239797946
19
2.2
20
95
4
77
50
14
9
26
1.73
239801624--239801704
37
2.2
37
93
0
135
24
32
22
20
1.98
239801863--239801987
48
2.6
48
88
1
180
30
25
8
36
1.85
239805795--239806134
38
8.7
39
81
9
351
25
29
23
21
1.99
239805776--239806095
115
2.7
114
82
8
349
25
30
23
20
1.99
239805790--239806134
40
8.9
40
81
8
349
25
29
23
21
1.99
239808331--239808411
37
2.2
37
93
0
135
24
32
22
20
1.98
239808570--239808695
48
2.6
48
88
0
180
30
26
7
35
1.85
239813532--239813632
39
2.6
39
77
4
105
53
3
5
36
1.44
239814992--239815053
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
239814953--239815110
87
1.8
84
91
4
262
38
22
12
27
1.89
239815022--239815145
57
2.2
55
88
5
178
42
17
12
27
1.85
239815382--239815571
72
2.6
72
85
5
267
35
24
14
26
1.93
239815035--239815556
288
1.8
288
82
5
685
35
22
15
26
1.94
239815523--239815719
53
3.5
53
70
11
169
38
21
14
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
239815576--239815780
62
3.5
62
70
20
202
35
24
14
25
1.94
239815502--239815805
115
2.6
114
93
3
495
37
23
14
25
1.92
239824094--239824129
12
3.0
12
87
0
54
41
5
27
25
1.77
239824090--239824121
16
1.9
17
93
6
57
40
6
28
25
1.79
239826062--239826092
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
239826066--239826164
39
2.5
39
80
4
110
53
4
5
37
1.42
239828067--239828146
29
2.8
28
81
7
90
28
33
13
23
1.93
239828067--239828153
28
3.1
28
80
3
102
28
31
12
27
1.93
239828359--239828389
16
1.9
16
93
0
53
12
16
19
51
1.76
239831311--239831388
29
2.7
29
83
0
102
21
33
17
26
1.96
239839154--239839232
29
2.7
29
86
0
86
22
32
16
27
1.96
239843263--239843661
86
4.6
86
90
2
613
19
24
20
34
1.96
239843308--239843629
42
7.5
42
68
9
220
21
24
20
34
1.97
239843263--239843655
172
2.3
173
97
0
734
19
24
20
35
1.96
239851489--239851526
20
1.9
20
84
10
51
18
31
10
39
1.85
239863264--239863332
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
239864955--239864992
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
239871215--239871283
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
239872910--239872947
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
239879801--239879899
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
239887480--239887578
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
239891445--239891594
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
239891469--239891652
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
239891789--239891859
35
2.0
35
100
0
142
25
8
33
32
1.86
239895028--239895128
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
239895057--239895132
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
239902913--239902984
29
2.5
28
86
6
92
30
15
26
27
1.96
239913184--239913367
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
239913224--239913412
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
239914264--239915399
586
1.9
586
80
4
1326
32
17
21
28
1.96
239918384--239918581
78
2.5
78
86
5
258
25
23
28
22
1.99
239918380--239918584
38
5.2
40
81
7
251
25
23
28
22
1.99
239922723--239922833
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
239929972--239930082
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
239935160--239935184
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
239940153--239940320
40
4.2
40
79
6
162
23
26
22
27
2.00
239940169--239940318
80
1.9
80
83
8
198
22
26
23
27
2.00
239948835--239948923
28
3.3
27
86
7
117
35
21
21
21
1.96
239960389--239960447
28
2.1
28
100
0
118
37
20
15
27
1.92
239962010--239962148
71
2.0
71
95
0
251
31
13
23
31
1.93
239962095--239962193
52
1.9
51
85
2
135
27
13
29
30
1.94
239962147--239962403
135
1.9
132
83
8
331
26
14
19
40
1.89
239963273--239963304
16
2.0
16
93
0
55
40
40
6
12
1.68
239967960--239968094
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
239968334--239968372
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
239969596--239969652
5
11.0
5
78
14
62
56
1
0
42
1.10
239969595--239969650
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
239969597--239969652
26
2.2
26
90
6
69
55
1
0
42
1.10
239971429--239971468
6
6.7
6
91
8
64
12
0
0
87
0.54
239971429--239971469
13
3.3
13
93
6
68
12
0
0
87
0.53
239971432--239971468
19
1.9
19
100
0
74
13
0
0
86
0.57
239974146--239974190
18
2.5
17
89
7
63
28
22
0
48
1.50
239974158--239974217
31
2.0
30
83
9
77
30
25
1
43
1.64
239974335--239974444
38
2.8
39
69
13
91
30
25
20
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770