Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  733  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
231865434--231865685
26
9.8
27
86
10
325
40
8
22
28
1.83
231865434--231865685
76
3.3
76
87
9
336
40
8
22
28
1.83
231865691--231865780
27
3.3
26
83
6
108
32
10
17
40
1.83
231865691--231865795
27
3.9
27
79
9
90
34
9
17
39
1.82
231868569--231868632
31
2.1
31
90
0
101
25
23
15
35
1.94
231868825--231868990
24
7.0
24
90
4
248
27
21
22
28
1.99
231868824--231868990
47
3.5
48
90
4
250
26
21
22
29
1.99
231868825--231868990
71
2.3
71
92
3
271
27
21
22
28
1.99
231869048--231869104
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
231869044--231869106
20
3.2
20
95
0
117
31
19
12
36
1.89
231869143--231869190
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
231870342--231870434
27
3.5
26
88
7
125
20
24
20
34
1.96
231870490--231870738
27
9.3
27
76
8
134
32
7
20
39
1.81
231870490--231870644
56
2.9
52
80
9
152
30
8
20
41
1.81
231870569--231870697
26
4.9
27
80
12
137
30
6
21
41
1.77
231870576--231870711
27
5.2
26
82
7
143
29
5
23
41
1.78
231870690--231870943
27
9.8
27
85
9
316
41
7
21
28
1.81
231870691--231870943
79
3.3
79
86
9
344
41
7
21
28
1.81
231870690--231870943
53
4.9
50
87
5
269
41
7
21
28
1.81
231870949--231871038
27
3.3
26
83
6
108
32
10
17
40
1.83
231870933--231871038
54
2.0
54
81
9
128
31
10
19
38
1.86
231870949--231871053
27
3.9
27
79
9
90
34
9
17
39
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
231873830--231873893
31
2.1
31
90
0
101
25
23
15
35
1.94
231874085--231874248
24
7.0
24
87
7
230
26
21
22
29
1.99
231874099--231874248
69
2.1
70
92
3
248
26
21
22
30
1.99
231874306--231874362
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
231874302--231874364
20
3.2
20
95
0
117
31
19
12
36
1.89
231874401--231874448
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
231875599--231875691
27
3.5
26
88
7
125
20
24
20
34
1.96
231875720--231875968
27
9.3
27
77
5
148
30
9
20
38
1.84
231875722--231875954
53
4.4
53
75
10
165
30
9
20
40
1.83
231875833--231875954
27
4.7
26
87
5
176
28
7
21
42
1.79
231875833--231875968
53
2.6
52
83
6
177
29
7
22
40
1.81
231875947--231876200
27
9.8
26
85
9
290
40
8
22
28
1.83
231875948--231876200
76
3.3
74
85
10
305
40
8
22
28
1.83
231875947--231876193
102
2.4
102
84
7
322
40
8
21
29
1.82
231876206--231876295
27
3.3
27
85
3
119
32
10
17
40
1.83
231876189--231876295
54
2.0
54
81
7
128
30
10
20
38
1.86
231876206--231876310
27
3.9
27
79
9
90
34
9
17
39
1.82
231879078--231879140
30
2.1
31
90
3
101
23
23
15
36
1.94
231879332--231879472
23
6.0
23
86
7
196
27
21
21
29
1.99
231879523--231879584
20
3.2
20
93
2
108
30
19
12
37
1.89
231879621--231879668
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
231880815--231880899
26
3.3
25
87
11
102
21
25
20
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
231880830--231880899
27
2.7
26
91
6
115
18
27
20
34
1.96
231880959--231881177
27
8.3
26
75
11
135
31
8
21
39
1.82
231881004--231881142
26
5.2
26
75
14
115
29
7
21
41
1.81
231881045--231881177
53
2.6
50
80
11
146
30
6
23
39
1.80
231881043--231881146
26
3.9
27
80
7
133
30
7
22
39
1.82
231881157--231881409
78
3.3
78
83
9
288
39
7
22
29
1.82
231881156--231881385
128
1.8
125
85
8
320
40
7
23
29
1.81
231881156--231881409
27
9.8
27
82
11
266
39
7
23
29
1.83
231881167--231881358
102
1.9
98
84
9
253
41
7
22
28
1.81
231881156--231881409
51
4.9
53
79
16
212
39
7
23
29
1.83
231881415--231881504
27
3.3
26
83
6
108
32
10
17
40
1.83
231881399--231881504
54
2.0
54
81
9
128
31
10
19
38
1.86
231881415--231881519
27
3.9
27
79
9
90
34
9
17
39
1.82
231886330--231886460
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
231886329--231886460
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
231893830--231893960
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
231893829--231893960
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
231902426--231902589
40
4.1
40
82
4
179
25
28
21
25
1.99
231902426--231902589
80
2.0
80
83
2
204
25
28
21
25
1.99
231907261--231907363
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
231915726--231915795
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
231923758--231923827
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
231926774--231927042
27
10.2
27
81
7
295
29
22
8
40
1.83
231928343--231928398
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
231928339--231928398
20
3.0
20
97
0
111
35
11
20
33
1.88
231928443--231928628
24
8.0
23
88
7
254
29
22
21
27
1.99
231928443--231928627
68
2.6
69
88
7
266
28
22
21
27
1.99
231928448--231928628
92
2.0
91
91
3
292
27
22
21
28
1.99
231928819--231928879
30
2.1
29
90
3
95
36
16
24
22
1.94
231931701--231932280
133
4.3
134
83
6
712
27
22
9
40
1.85
231931701--231932278
27
21.6
27
84
4
708
27
22
9
40
1.85
231931701--231932289
80
7.3
81
82
6
435
28
22
9
40
1.85
231933603--231933659
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
231933601--231933671
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
231933612--231933666
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
231933715--231933881
24
7.0
24
90
4
241
28
22
21
27
1.99
231933715--231933881
47
3.5
47
88
6
239
28
22
21
27
1.99
231933715--231933881
71
2.3
71
92
3
273
28
22
21
27
1.99
231934842--231947093
536
22.8
539
97
1
22851
37
18
11
33
1.86
231953048--231953221
46
3.8
45
74
8
154
29
29
19
21
1.97
231953055--231953226
92
1.9
93
90
1
274
28
30
19
21
1.98
231957534--231958350
48
17.0
48
91
0
1276
35
6
27
31
1.82
231958398--231958538
37
3.8
37
89
0
212
25
17
33
23
1.96
231959770--231960041
40
6.8
40
96
0
472
25
21
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
231963518--231964333
48
17.0
48
94
0
1402
34
6
27
31
1.81
231964378--231964521
37
3.9
37
89
1
218
25
18
32
23
1.97
231965733--231965964
40
5.8
40
93
0
365
26
21
26
25
1.99
231967004--231967061
28
2.0
29
90
9
93
18
13
34
32
1.91
231969805--231969834
15
2.0
15
100
0
60
40
13
13
33
1.83
231975027--231975078
26
2.0
26
100
0
104
42
3
19
34
1.69
231979911--231980077
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
231988043--231988172
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
231994186--231994362
40
4.5
39
80
7
178
26
23
27
23
2.00
231994186--231994362
79
2.2
80
80
6
198
26
23
27
23
2.00
232001964--232002143
40
4.5
40
83
4
204
26
23
26
23
2.00
232001966--232002143
80
2.2
80
85
4
234
26
24
26
23
2.00
232002000--232002183
80
2.3
79
82
5
210
28
23
25
22
1.99
232001966--232002169
40
5.1
41
80
9
154
26
24
26
22
2.00
232003208--232003248
20
2.0
20
100
0
82
43
9
9
36
1.71
232030823--232030974
40
3.8
41
75
12
127
27
23
26
21
1.99
232031569--232031602
17
2.0
17
94
0
59
20
23
32
23
1.98
232034789--232035038
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
232042893--232043142
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
232056115--232056290
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
232056112--232056283
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
232064169--232064335
40
4.2
41
83
5
182
25
26
21
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
232065160--232065205
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
232072171--232072337
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
232078492--232078527
18
2.0
18
100
0
72
16
27
22
33
1.95
232079418--232079700
48
5.9
47
80
5
266
24
28
18
27
1.98
232079416--232079690
96
2.9
95
81
7
299
24
29
18
28
1.98
232085221--232085294
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
232085162--232085294
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
232093095--232093168
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
232093036--232093168
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
232100211--232100337
46
2.7
47
92
1
220
33
27
14
24
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770