Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  25  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6928693--6928741
26
1.9
25
83
4
62
34
22
24
18
1.96
6929289--6929323
17
2.1
17
100
0
70
60
17
5
17
1.55
6932592--6932616
11
2.3
11
100
0
50
20
16
28
36
1.93
6937327--6937593
46
5.8
46
73
8
218
30
26
19
23
1.98
6937381--6937549
47
3.6
47
74
7
182
30
26
18
23
1.98
6937336--6937599
93
2.8
93
89
2
395
30
26
18
23
1.98
6940339--6940377
15
2.6
15
91
0
69
58
20
12
7
1.58
6945569--6945611
22
1.9
23
85
4
61
9
23
4
62
1.44
6948145--6948206
8
7.8
8
70
0
52
48
22
19
9
1.78
6948148--6948206
16
3.7
16
86
0
91
50
20
18
10
1.75
6948420--6948533
28
3.9
29
82
7
110
28
14
28
27
1.96
6948458--6948536
31
2.7
29
81
9
97
29
16
27
26
1.97
6957274--6957298
13
1.9
13
100
0
50
24
28
48
0
1.52
6959563--6959603
20
2.0
20
90
0
64
21
14
17
46
1.84
6959583--6959658
25
3.0
25
80
0
89
25
13
21
40
1.89
6966056--6966111
23
2.5
24
83
11
66
39
0
14
46
1.44
6966291--6966366
23
3.4
21
77
17
73
18
23
21
36
1.95
6966304--6966379
23
3.3
23
83
7
93
23
25
19
31
1.98
6966514--6966672
79
2.0
79
95
0
282
34
13
15
37
1.86
6966632--6966702
20
3.5
20
78
3
72
35
11
14
39
1.81
6967784--6967842
30
2.0
30
93
0
100
11
22
35
30
1.90
6968721--6968764
23
1.9
23
81
9
54
38
27
0
34
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6973346--6973520
46
3.8
47
78
13
200
29
29
19
21
1.98
6973353--6973524
93
1.8
93
92
2
292
29
29
19
22
1.98
6973349--6973540
46
4.2
46
74
16
157
29
28
19
22
1.98
6980910--6981077
89
1.9
91
94
2
304
27
29
20
21
1.98
6980906--6981086
45
4.0
45
73
15
142
28
29
19
21
1.98
6983489--6983561
27
2.8
26
82
14
87
34
20
26
19
1.96
6985356--6985422
21
3.2
21
68
27
54
47
1
4
46
1.31
6994736--6994874
44
3.2
42
83
9
124
33
26
16
23
1.96
6994717--6994874
43
3.7
42
79
12
162
32
27
17
22
1.96
6994712--6994874
85
1.9
85
80
10
190
32
27
17
22
1.96
7002400--7002564
43
3.9
42
75
12
156
31
24
19
24
1.98
7007719--7007782
33
2.0
33
84
9
87
28
26
20
25
1.99
7018566--7018653
21
4.1
22
75
10
83
35
25
23
15
1.95
7018572--7018652
44
1.9
41
82
7
99
33
27
24
14
1.95
7018840--7018913
28
2.6
29
89
2
105
45
32
5
16
1.70
7028566--7028722
43
3.7
42
70
10
122
27
18
23
30
1.98
7031099--7031133
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
7031937--7032051
47
2.5
46
84
7
135
28
27
9
33
1.88
7034644--7034746
29
3.6
27
78
5
89
28
32
16
23
1.96
7042635--7042737
29
3.6
27
78
5
89
28
32
16
23
1.96
7044813--7044853
20
2.0
20
85
9
55
46
17
7
29
1.74
7048602--7048628
13
2.1
13
100
0
54
40
22
7
29
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7062336--7062370
18
2.0
17
88
5
52
0
22
0
77
0.78
7063443--7063507
28
2.3
28
92
5
105
35
26
7
30
1.84
7063623--7063701
28
2.8
28
92
1
122
22
24
21
31
1.98
7064140--7064178
19
2.1
19
85
0
51
12
5
7
74
1.20
7071253--7071317
28
2.3
28
91
0
103
35
27
7
29
1.85
7071423--7071505
28
3.0
28
87
3
123
22
25
20
31
1.98
7071976--7072014
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
7082456--7082524
24
2.8
24
86
4
84
20
18
21
39
1.93
7098566--7098863
40
7.5
40
90
1
431
22
23
27
25
2.00
7106806--7107063
40
6.5
40
87
4
319
22
22
27
27
1.99
7110997--7111121
57
2.2
58
81
4
137
31
21
16
30
1.96
7117305--7117354
24
2.1
24
100
0
100
32
16
4
48
1.64
7119929--7119989
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
7123681--7123721
19
2.2
19
100
0
82
31
26
17
24
1.97
7130449--7130491
12
3.6
12
74
0
50
34
0
39
25
1.56
7130439--7130494
24
2.3
24
100
0
112
37
0
39
23
1.55
7133701--7134032
27
12.5
26
71
14
207
39
16
11
32
1.84
7133699--7134032
54
6.3
53
76
12
244
39
16
11
32
1.84
7133693--7133989
81
3.7
78
80
6
231
39
18
10
31
1.85
7133728--7134031
81
3.8
79
81
5
283
40
16
10
32
1.83
7135587--7135653
30
2.3
29
85
12
84
37
13
1
47
1.52
7139351--7139384
16
2.1
16
100
0
68
32
23
14
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7141577--7141896
64
5.0
64
91
1
516
30
17
14
36
1.90
7142095--7142660
177
3.2
177
86
0
792
28
17
25
29
1.97
7142786--7143709
41
22.5
40
81
4
941
33
20
24
22
1.97
7142786--7143713
82
11.3
82
85
0
1113
33
20
24
22
1.97
7142786--7143713
123
7.5
123
87
0
1131
33
20
24
22
1.97
7143714--7143803
46
2.0
46
84
0
117
48
30
1
20
1.56
7143964--7144014
15
3.5
15
75
2
50
19
3
29
47
1.68
7144589--7144656
7
9.2
8
81
13
76
66
1
0
32
1.01
7144589--7144656
22
3.1
21
89
6
91
66
1
0
32
1.01
7144590--7144663
29
2.6
29
88
0
103
63
1
0
35
1.03
7147556--7147883
23
14.3
23
78
8
260
31
6
22
39
1.79
7147559--7147834
114
2.4
114
78
10
290
32
6
22
39
1.79
7151479--7151609
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
7151478--7151609
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
7159437--7159567
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
7159436--7159567
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
7163231--7163316
27
3.2
27
74
0
73
24
19
16
39
1.91
7163572--7163639
27
2.6
27
76
2
66
23
17
27
30
1.97
7167363--7167525
39
4.2
39
90
0
254
22
19
33
24
1.97
7167380--7167561
39
4.6
40
87
0
154
21
21
32
23
1.98
7171797--7171835
19
2.1
19
100
0
78
35
33
0
30
1.58
7177693--7177756
29
2.1
31
83
11
80
35
0
3
60
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7177734--7177758
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
7180890--7181093
42
4.9
42
89
0
255
24
16
27
31
1.96
7183676--7183865
42
4.6
41
73
6
125
32
24
14
28
1.95
7190160--7190333
46
3.8
45
74
10
163
20
21
27
30
1.98
7190156--7190327
93
1.8
93
88
0
263
20
22
28
29
1.98
7193281--7193349
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
7193272--7193359
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
7195626--7195733
40
2.7
39
84
5
119
21
29
25
24
1.99
7206147--7206248
17
6.0
17
64
4
53
44
17
10
27
1.82
7206890--7206989
36
2.8
36
87
0
137
47
23
2
28
1.63
7206890--7206974
18
4.7
18
77
0
80
48
23
1
27
1.58
7207003--7207040
17
2.2
18
90
4
60
47
21
10
21
1.80
7209119--7209216
49
2.0
49
82
7
119
29
27
22
20
1.98
7210436--7210583
48
3.1
48
92
0
242
29
24
8
37
1.84
7212910--7212953
23
1.9
23
85
0
61
45
11
6
36
1.67
7214879--7214964
43
2.0
43
93
0
145
29
30
17
23
1.97
7219762--7219912
40
3.8
39
80
6
153
27
23
27
22
1.99
7219799--7219928
40
3.3
39
80
4
161
24
23
27
24
2.00
7229437--7229515
25
3.3
25
66
16
67
31
30
5
32
1.79
7229387--7229783
47
8.3
47
89
3
560
28
30
8
31
1.87
7238284--7238326
21
2.0
21
95
0
77
4
2
51
41
1.35
7241788--7241953
46
3.6
44
81
11
183
22
30
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7244525--7244616
45
2.1
45
89
2
141
27
21
10
40
1.87
7247058--7247182
40
3.2
40
91
2
191
27
27
22
23
1.99
7256389--7256655
48
5.6
48
74
10
208
27
25
20
25
1.99
7257862--7257918
30
1.9
30
92
0
96
26
1
33
38
1.67
7260435--7260478
22
2.0
22
100
0
88
27
13
27
31
1.94
7260431--7260539
25
4.5
24
86
11
134
30
17
24
27
1.97
7260474--7260549
25
3.1
25
80
16
95
34
18
23
23
1.96
7261926--7261987
30
2.1
30
100
0
124
32
16
9
41
1.80
7263474--7263521
24
2.0
25
83
4
62
45
14
4
35
1.64
7267811--7267948
40
3.5
40
76
9
113
24
23
28
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770