Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  77  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22718991--22719108
57
2.1
56
96
1
218
30
5
27
36
1.79
22720907--22721191
135
2.1
137
96
1
520
24
18
25
31
1.97
22724863--22725003
26
5.2
26
88
8
210
32
4
25
36
1.78
22724869--22724987
57
2.1
57
98
0
229
30
5
27
36
1.78
22726787--22727072
136
2.1
137
96
0
520
24
18
25
32
1.97
22729766--22730084
159
2.0
160
98
0
613
35
17
22
24
1.95
22732764--22732820
26
2.2
26
96
0
105
42
7
8
42
1.63
22733445--22733503
28
2.1
27
84
9
73
57
1
0
40
1.09
22733487--22733537
17
2.7
20
79
14
63
64
1
5
27
1.27
22733771--22733831
19
3.3
19
77
6
63
31
4
1
62
1.26
22733697--22733818
55
2.2
57
82
7
142
32
5
2
59
1.34
22733697--22733831
56
2.4
57
75
15
129
31
5
2
60
1.33
22733840--22734012
85
2.0
86
84
3
224
36
6
19
37
1.77
22737720--22737763
23
1.9
23
100
0
88
22
22
9
45
1.80
22737868--22737941
24
3.0
24
78
9
78
51
1
2
44
1.24
22737956--22738004
20
2.7
18
77
22
57
51
4
2
42
1.32
22739619--22739649
16
1.9
16
93
0
53
70
9
9
9
1.33
22742282--22742389
29
3.8
29
80
3
112
29
27
13
28
1.95
22742618--22742654
16
2.3
16
90
0
56
10
24
16
48
1.77
22743905--22743939
16
2.1
17
89
5
54
11
5
31
51
1.61
22746173--22746314
40
3.6
40
82
6
164
26
23
26
23
2.00
22754049--22754304
40
6.4
40
90
2
383
24
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22756106--22756187
29
2.8
29
98
0
155
25
30
14
29
1.95
22763999--22764080
29
2.8
29
98
0
155
25
30
14
29
1.95
22768264--22768341
38
2.1
38
92
0
129
21
16
17
43
1.88
22772949--22772973
13
1.9
13
100
0
50
0
48
28
24
1.52
22781330--22781441
54
2.1
54
87
0
161
27
22
31
18
1.97
22781330--22781459
54
2.4
54
84
2
145
26
20
33
19
1.96
22783332--22783475
39
3.7
40
88
0
193
22
22
31
22
1.99
22786646--22786853
40
5.2
40
83
0
209
25
23
25
25
2.00
22786647--22786853
80
2.6
80
83
4
247
25
23
26
25
2.00
22789824--22790067
40
6.1
40
87
2
303
27
26
21
24
1.99
22790036--22790743
123
5.8
123
98
0
1326
34
25
10
29
1.89
22793430--22793597
40
4.2
40
85
5
207
26
28
22
23
1.99
22793430--22793597
80
2.1
80
87
4
241
26
28
22
23
1.99
22800932--22801105
39
4.4
39
89
0
222
20
32
24
22
1.98
22800962--22801114
39
3.9
39
91
0
225
22
32
22
22
1.98
22802989--22803044
27
2.0
28
96
3
105
23
25
17
33
1.96
22804125--22804333
27
7.5
27
80
4
202
32
24
14
27
1.95
22804125--22804283
55
2.9
55
98
0
300
36
23
13
26
1.92
22804125--22804336
29
7.6
29
72
12
131
32
25
14
27
1.95
22811433--22811615
39
4.6
39
87
0
240
24
22
30
22
1.99
22815020--22815292
147
1.9
146
92
0
465
19
28
21
31
1.97
22815227--22815281
28
1.9
29
85
3
76
18
41
23
16
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22818040--22818230
40
4.8
39
77
7
163
24
23
28
23
1.99
22818039--22818223
79
2.3
82
82
7
220
24
23
28
23
2.00
22818091--22818256
79
2.1
79
79
4
183
25
23
27
24
2.00
22820034--22820171
40
3.5
40
82
8
142
22
28
23
24
1.99
22827987--22828177
40
4.8
39
78
7
172
23
28
24
24
1.99
22828027--22828177
78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
22836274--22836305
16
2.0
16
100
0
64
31
6
25
37
1.81
22837243--22837423
79
2.3
81
81
9
203
25
23
27
23
2.00
22837243--22837423
40
4.6
40
76
9
165
25
23
27
23
2.00
22843164--22843345
43
4.2
43
87
0
238
30
26
14
28
1.95
22843077--22843260
99
1.9
99
85
6
257
29
25
16
28
1.96
22843986--22844033
25
2.0
24
87
4
69
43
25
0
31
1.55
22846360--22846397
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
22850323--22850494
93
1.8
93
94
0
308
27
29
21
21
1.99
22850316--22850491
46
3.8
46
78
12
207
28
28
21
21
1.98
22857828--22858045
40
5.5
40
90
2
307
24
22
27
25
2.00
22866835--22866876
16
2.7
15
82
17
50
47
0
2
50
1.14
22866752--22866915
62
2.6
61
81
8
163
38
0
1
59
1.08
22871262--22871433
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
22871254--22871429
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
22873811--22873898
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
22873811--22873889
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22873822--22873898
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
22876836--22876964
46
2.8
46
96
0
231
28
29
22
19
1.98
22879874--22880004
40
3.3
40
83
2
174
25
27
22
24
2.00
22879874--22880040
40
4.2
40
78
8
144
23
27
22
26
2.00
22883445--22883908
239
1.9
239
86
2
664
31
9
23
35
1.86
22884186--22884268
27
3.1
27
83
0
103
32
19
30
18
1.95
22884749--22884777
13
2.2
13
100
0
58
44
0
31
24
1.54
22892765--22892802
19
2.0
19
100
0
76
47
15
10
26
1.78
22893380--22893432
13
4.0
13
82
9
54
3
13
1
81
0.92
22893380--22893432
25
2.1
25
82
6
63
3
13
1
81
0.92
22895920--22895951
17
1.9
17
93
6
57
56
15
6
21
1.62
22896963--22897197
118
2.0
119
93
0
400
31
11
15
41
1.82
22899923--22899976
27
2.0
27
85
3
72
22
7
5
64
1.40
22900048--22900080
9
3.7
9
92
8
50
21
3
0
75
0.93
22900043--22900081
13
3.0
13
85
10
53
23
2
0
74
0.94
22908143--22908197
19
2.8
20
81
10
60
43
3
3
49
1.37
22908258--22908323
23
3.0
22
84
8
73
39
1
4
54
1.30
22908258--22908324
22
3.0
23
82
10
77
38
1
4
55
1.29
22911598--22911648
26
1.9
27
88
11
79
72
5
0
21
1.05
22911628--22911664
15
2.4
15
90
4
56
70
0
0
29
0.88
22911628--22911663
8
4.6
8
89
6
56
69
0
0
30
0.89
22916587--22916644
17
3.5
17
71
4
55
58
5
1
34
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22920711--22920812
29
3.4
30
74
10
93
36
27
15
20
1.93
22920742--22920865
29
4.2
29
71
9
81
41
28
11
19
1.86
22920966--22921121
55
2.8
55
84
6
199
23
23
16
37
1.93
22921592--22921654
4
15.2
4
74
12
56
69
4
22
3
1.21
22922569--22922676
38
2.7
38
76
9
110
25
12
25
36
1.92
22922567--22922702
40
3.5
40
74
10
111
24
14
26
34
1.94
22934444--22934527
43
2.0
43
97
0
159
15
35
19
29
1.92
22936131--22936385
55
4.8
53
79
8
236
36
17
25
21
1.94
22936138--22936338
108
1.8
110
87
4
300
33
17
25
22
1.96
22936577--22936607
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
22937899--22937943
2
22.5
2
100
0
90
48
0
0
51
1.00
22939601--22939641
19
2.2
19
100
0
82
31
14
21
31
1.94
22943642--22943671
14
2.1
15
93
6
53
13
10
13
63
1.52
22953134--22953305
46
3.7
46
79
10
197
28
27
21
22
1.99
22953139--22953309
93
1.8
93
91
0
279
28
28
21
21
1.99
22953729--22953788
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
22955510--22955677
46
3.6
45
77
12
171
27
19
29
23
1.98
22957232--22957408
48
3.7
49
84
6
218
25
29
16
28
1.97
22961459--22961487
14
2.1
14
100
0
58
34
31
6
27
1.83
22964686--22965005
48
6.7
48
79
1
356
27
28
16
27
1.97
22964696--22965016
95
3.4
95
87
1
446
27
28
15
27
1.96
22964688--22965016
143
2.3
143
81
1
363
27
29
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22980543--22980713
93
1.8
93
94
0
306
28
28
21
21
1.98
22980538--22980710
46
3.7
46
77
13
201
29
27
20
21
1.98
22988099--22988268
92
1.8
93
92
1
288
28
28
21
21
1.99
22988094--22988265
46
3.7
46
75
14
183
29
27
20
22
1.98
22989706--22989974
143
1.9
143
88
1
414
22
20
21
36
1.96
22995236--22995286
22
2.3
22
93
0
84
45
25
0
29
1.54
23000887--23000916
15
2.0
15
100
0
60
26
0
26
46
1.53
23001289--23001345
30
1.9
29
85
3
78
29
22
3
43
1.70
23003099--23003136
18
2.1
18
90
0
58
23
23
13
39
1.90
23006901--23006928
13
2.2
13
100
0
56
17
35
32
14
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770