Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  78  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23028835--23028974
40
3.5
40
85
0
172
25
20
24
30
1.99
23028960--23029014
28
2.0
28
88
0
83
29
12
27
30
1.93
23032926--23033039
35
3.3
35
83
0
147
31
11
22
34
1.90
23038997--23039139
40
3.6
40
87
0
196
27
18
22
32
1.97
23043138--23043524
38
10.1
38
91
1
621
21
22
25
31
1.98
23043522--23043603
43
1.9
43
84
0
110
14
23
34
28
1.94
23045469--23046089
126
5.0
125
82
3
700
27
16
15
39
1.90
23046186--23046279
34
2.8
34
86
1
127
45
17
0
37
1.48
23047483--23047588
48
2.2
48
83
12
146
37
6
3
51
1.46
23047483--23047616
48
2.8
47
82
9
130
33
7
5
53
1.51
23048600--23048638
7
5.6
7
93
0
69
30
0
10
58
1.31
23052741--23053352
126
4.8
126
90
0
929
28
18
17
35
1.94
23052741--23053352
253
2.4
252
90
0
947
28
18
17
35
1.94
23053948--23054056
19
5.8
19
86
8
143
44
19
0
35
1.51
23053948--23054051
39
2.8
38
86
5
142
44
20
0
35
1.52
23053995--23054046
16
3.0
17
91
8
79
40
23
0
36
1.55
23054150--23054227
16
4.9
16
70
9
70
51
30
1
16
1.53
23055166--23055222
27
2.1
27
87
6
80
50
1
0
47
1.11
23055256--23055318
20
3.2
20
76
13
60
53
0
1
44
1.10
23056149--23056407
69
3.9
67
77
9
248
33
18
8
39
1.80
23057448--23057594
60
2.5
60
78
6
145
42
2
11
42
1.55
23059000--23059046
23
2.0
23
100
0
94
27
12
12
46
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23063731--23063771
19
2.2
19
90
0
64
41
2
2
53
1.27
23066746--23066797
22
2.4
22
96
0
95
53
15
11
19
1.71
23070436--23070468
17
1.9
17
100
0
66
60
6
6
27
1.44
23075435--23075487
16
3.2
16
89
2
79
20
5
5
67
1.32
23079256--23079431
46
3.8
46
82
5
212
27
19
30
22
1.98
23083215--23083249
6
5.8
6
100
0
70
0
65
0
34
0.93
23084715--23084760
23
1.9
24
83
16
60
39
4
17
39
1.69
23085308--23085421
36
3.2
35
72
5
86
27
21
23
28
1.99
23085290--23085531
71
3.4
71
80
2
252
27
21
20
29
1.98
23085354--23085475
36
3.4
35
65
10
86
26
22
19
31
1.98
23090445--23090492
15
3.2
15
77
11
53
58
14
14
12
1.64
23095728--23095756
15
1.9
15
100
0
58
20
31
13
34
1.92
23098792--23098858
33
2.0
33
100
0
134
23
14
14
46
1.83
23099301--23099484
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
23099341--23099529
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
23102192--23102229
18
2.2
18
90
9
62
71
2
5
21
1.19
23112402--23112434
14
2.5
13
90
9
50
81
0
18
0
0.68
23113022--23113122
48
2.1
48
86
0
139
25
39
11
22
1.88
23113149--23113441
66
4.4
66
89
2
403
22
39
18
18
1.92
23114034--23114075
20
2.0
22
86
9
61
26
30
0
42
1.55
23115888--23115931
18
2.4
18
88
0
61
18
27
9
45
1.79
23116313--23116359
24
1.9
24
83
12
60
31
4
4
59
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23116338--23116646
129
2.4
130
94
1
541
34
3
4
56
1.38
23119760--23120065
126
2.5
126
88
3
451
27
18
16
38
1.92
23120186--23120234
7
6.7
7
78
17
55
46
38
0
14
1.44
23120178--23120232
15
3.7
15
77
15
60
50
34
0
14
1.43
23120176--23120225
24
2.1
24
88
7
75
54
32
0
14
1.40
23120185--23120272
16
5.0
17
74
14
72
50
35
0
14
1.44
23120339--23120386
16
3.2
15
83
16
64
47
31
0
20
1.50
23120089--23120586
156
3.0
160
84
10
612
43
22
1
32
1.62
23120338--23120381
16
2.8
16
83
16
65
52
27
0
20
1.47
23120501--23120547
24
2.0
24
87
8
69
53
27
0
19
1.45
23120508--23120568
30
2.0
32
81
12
74
50
29
0
19
1.48
23123935--23123989
25
2.2
25
87
3
76
43
9
14
32
1.77
23129740--23129779
13
3.1
13
81
0
53
20
32
32
15
1.93
23140639--23140681
17
2.6
16
82
17
52
18
2
6
72
1.19
23143666--23143719
23
2.4
22
77
20
58
37
1
0
61
1.07
23143666--23143722
15
3.8
15
76
13
55
36
1
0
61
1.07
23146730--23146847
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
23146698--23146861
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
23153837--23153954
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
23153805--23153968
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
23156294--23156327
16
2.1
16
88
0
50
47
8
5
38
1.59
23159650--23159674
11
2.3
11
100
0
50
44
16
8
32
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23172920--23173173
84
3.0
84
85
1
355
30
20
9
39
1.83
23173243--23173283
16
2.6
16
88
3
57
63
0
2
34
1.08
23173254--23173314
17
3.5
17
72
16
54
65
1
1
31
1.12
23176630--23176656
10
2.7
10
100
0
54
59
22
18
0
1.38
23189568--23189647
28
2.7
30
70
20
69
38
3
1
56
1.25
23189632--23189668
17
2.2
17
95
0
65
43
2
5
48
1.40
23191066--23191125
25
2.4
23
79
17
66
50
0
0
50
1.00
23192328--23192363
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
23196904--23196940
18
2.1
18
100
0
74
27
27
21
24
1.99
23204638--23204789
40
3.8
39
82
5
144
22
26
24
26
2.00
23204638--23204789
80
1.9
80
83
5
200
22
26
24
26
2.00
23212647--23212776
40
3.2
40
77
13
142
24
26
24
23
2.00
23212663--23212814
40
3.8
40
80
5
155
22
26
24
26
2.00
23212663--23212814
80
1.9
80
83
5
200
22
26
24
26
2.00
23218508--23218644
46
3.0
46
86
0
184
26
31
7
35
1.84
23218618--23219004
47
8.1
47
86
4
495
27
29
10
32
1.90
23218618--23219004
98
4.0
96
90
2
539
27
29
10
32
1.90
23218618--23219004
145
2.7
142
88
4
555
27
29
10
32
1.90
23223430--23223494
33
2.0
33
93
0
112
44
6
21
27
1.76
23227037--23227112
31
2.5
31
91
4
118
27
23
32
15
1.95
23229955--23230209
55
4.8
54
79
9
260
35
18
24
21
1.96
23230268--23230295
5
5.6
5
100
0
56
42
0
39
17
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23230411--23230441
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
23232353--23232516
71
2.3
71
98
0
319
35
18
28
18
1.94
23240468--23240705
55
4.5
54
80
9
235
35
16
24
22
1.95
23240475--23240674
108
1.8
110
87
4
298
33
17
25
24
1.96
23247726--23247759
17
2.1
16
88
5
50
11
35
41
11
1.78
23256627--23256665
18
2.1
19
85
4
53
35
25
0
38
1.56
23263917--23264025
37
2.9
37
95
0
191
26
31
19
22
1.98
23264172--23264615
98
4.6
98
92
4
722
31
25
6
36
1.82
23264172--23264611
48
9.0
48
90
5
706
31
26
6
36
1.82
23264172--23264611
146
3.0
146
99
0
862
31
26
6
36
1.82
23272854--23273013
29
5.5
29
84
4
189
26
16
30
25
1.97
23285664--23285768
47
2.2
47
93
0
183
35
7
29
27
1.85
23287801--23288075
40
6.9
40
92
0
453
23
24
29
22
1.99
23291061--23291165
47
2.2
47
94
0
183
35
7
29
27
1.85
23301461--23301529
28
2.5
28
83
6
88
27
15
26
30
1.96
23303956--23304131
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
23303953--23304123
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
23307052--23307130
15
5.4
15
77
10
83
10
17
13
58
1.63
23307043--23307129
29
3.0
29
81
8
95
10
17
16
56
1.67
23309491--23309666
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
23309488--23309658
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
23310968--23311048
31
2.6
31
94
0
144
23
23
17
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23311240--23311382
24
6.0
24
86
4
173
27
23
20
29
1.99
23311240--23311381
47
3.0
48
87
5
180
27
23
20
28
1.99
23311432--23311492
20
3.0
20
90
0
95
32
19
13
34
1.90
23311535--23311582
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
23316641--23316823
46
4.0
46
93
0
285
25
31
8
34
1.86
23316797--23317174
47
8.1
47
93
1
580
26
29
10
33
1.90
23316960--23317034
23
3.2
23
63
29
59
28
29
10
32
1.90
23316837--23317195
140
2.6
137
88
4
400
28
27
10
33
1.90
23319800--23319855
15
3.7
15
79
15
71
10
14
12
62
1.55
23324165--23324197
15
2.2
15
89
10
50
57
15
0
27
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770