genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.637.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  637  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
199887307--199887345	2	19.5	2	100	0	78	51	0	0	48	1.00
199890968--199891135	40	4.2	40	82	1	185	24	26	22	26	2.00
199907978--199908112	42	3.1	42	78	14	134	23	15	27	33	1.95
199907978--199908149	43	4.0	43	76	13	165	24	16	26	31	1.96
199909702--199909794	46	2.0	46	97	0	177	32	10	32	24	1.90
199910055--199910134	27	2.9	27	80	9	99	37	18	25	18	1.94
199910134--199910175	8	5.2	8	91	0	66	19	26	14	40	1.89
199917416--199917589	45	3.8	45	79	15	203	29	28	20	20	1.98
199917424--199917593	93	1.8	92	93	1	295	29	28	21	21	1.98
199920213--199920325	27	4.2	26	84	8	136	36	23	23	16	1.94
199920213--199920325	55	2.1	54	86	5	156	36	23	23	16	1.94
199924803--199927402	759	3.5	757	86	5	3490	25	16	25	32	1.96
199931441--199931551	27	4.1	27	87	1	143	37	21	23	17	1.93
199932953--199933003	25	2.0	26	92	3	86	21	39	5	33	1.78
199936622--199936789	40	4.2	40	80	12	175	23	21	28	26	1.99
199936622--199936789	80	2.1	79	86	4	230	23	21	28	26	1.99
199944588--199944757	40	4.2	39	82	10	184	24	21	28	25	1.99
199944588--199944757	80	2.1	79	83	8	209	24	21	28	25	1.99
199952149--199952175	2	13.5	2	100	0	54	48	0	0	51	1.00
199955379--199955417	21	1.9	20	89	5	60	15	28	41	15	1.87
199956410--199956607	71	2.8	69	91	3	274	33	16	28	21	1.95
199956476--199956593	41	3.1	41	60	28	98	32	17	28	21	1.96
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
199956444--199956607	71	2.3	71	100	0	328	35	17	28	18	1.94
199959740--199959798	30	2.0	30	89	0	91	40	5	25	28	1.77
199962425--199962537	29	3.9	29	77	7	106	30	15	29	25	1.95
199962425--199962537	58	2.0	57	82	5	138	30	15	29	25	1.95
199965723--199965889	40	4.2	40	81	2	176	24	27	22	25	2.00
199965739--199965889	80	1.9	79	83	6	198	23	27	22	25	2.00
199973733--199973899	40	4.2	40	81	2	176	24	27	22	25	2.00
199973749--199973899	80	1.9	79	83	6	198	23	27	22	25	2.00
199975094--199975202	56	2.0	53	82	12	132	28	16	18	36	1.92
199975720--199975890	93	1.8	93	91	0	279	28	26	21	23	1.99
199975712--199975887	46	3.8	46	79	10	205	29	26	20	23	1.99
199980929--199981081	39	3.9	39	90	0	234	23	20	32	23	1.98
199988032--199988214	39	4.6	39	87	0	240	24	22	30	22	1.99
199995136--199995285	39	3.9	38	87	6	214	24	20	31	24	1.98
199995137--199995316	39	4.6	39	85	3	213	23	22	30	23	1.99
199995143--199995316	79	2.2	76	85	5	224	23	22	31	22	1.99
200002417--200002491	29	2.6	29	82	0	87	29	33	16	21	1.95
200009506--200009656	53	2.8	53	89	4	214	25	16	27	29	1.97
200013790--200013873	28	3.0	28	87	1	123	20	3	29	46	1.67
200014078--200014122	22	2.0	23	95	4	83	17	17	22	42	1.89
200027747--200027791	17	2.8	16	83	6	63	66	8	24	0	1.20
200032094--200032311	40	5.5	40	91	2	334	25	27	23	23	2.00
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
200034321--200034494	45	3.8	45	79	15	203	28	29	20	21	1.98
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200036861--200036934	14	5.1	15	76	12	66	58	14	16	10	1.64
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