Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  220  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65585524--65585588
19
3.3
19
81
14
78
32
1
1
64
1.12
65585803--65585831
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
65585929--65585975
22
2.2
21
84
3
58
36
4
2
57
1.30
65590869--65591094
49
4.7
47
92
2
362
31
7
30
30
1.85
65590869--65591094
96
2.4
97
92
5
381
31
7
30
30
1.85
65591066--65591121
16
3.4
16
69
26
53
32
3
32
32
1.75
65591061--65591130
34
2.1
34
97
0
131
31
5
34
28
1.81
65591012--65591172
81
2.0
83
85
4
220
32
6
32
28
1.82
65593107--65593268
40
4.0
40
87
1
198
26
23
26
23
2.00
65593256--65593352
43
2.3
43
87
0
140
15
19
31
32
1.93
65597091--65597316
49
4.7
47
92
2
362
31
7
30
30
1.85
65597091--65597316
96
2.4
97
92
5
381
31
7
30
30
1.85
65597288--65597343
16
3.4
16
69
26
53
32
3
32
32
1.75
65597283--65597352
34
2.1
34
97
0
131
31
5
34
28
1.81
65597234--65597394
81
2.0
83
85
4
220
32
6
32
28
1.82
65601303--65601410
26
4.2
26
91
0
180
36
23
7
33
1.83
65601995--65602165
93
1.8
93
92
0
288
21
21
29
28
1.98
65601999--65602170
46
3.7
45
75
16
172
21
20
28
29
1.98
65609566--65609736
93
1.8
93
92
0
288
21
21
28
28
1.99
65609570--65609741
46
3.7
45
78
13
188
22
21
27
28
1.99
65611111--65611141
12
2.6
12
94
0
53
41
12
16
29
1.85
65625397--65625472
17
4.2
17
75
15
62
59
2
3
34
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65625395--65625471
39
2.0
38
82
9
95
61
2
3
32
1.28
65625576--65625661
5
17.6
5
69
23
51
59
1
2
37
1.18
65637967--65638149
40
4.6
40
81
8
212
25
23
25
25
2.00
65637967--65638185
79
2.8
79
83
4
248
25
22
25
26
2.00
65642816--65642847
16
2.0
16
100
0
64
50
31
6
12
1.65
65643943--65643990
24
2.0
24
87
4
69
50
16
20
12
1.78
65644200--65644314
29
4.0
29
80
6
119
26
15
30
27
1.96
65650752--65650780
14
2.0
15
93
6
51
20
6
17
55
1.65
65650896--65651017
50
2.4
50
89
6
185
36
13
22
27
1.92
65650999--65651167
30
5.6
30
91
5
261
27
19
26
26
1.99
65651201--65651322
47
2.6
46
85
1
154
28
15
26
29
1.96
65651293--65651407
42
2.7
43
89
4
171
30
14
26
27
1.95
65658781--65659042
40
6.6
40
90
3
370
26
26
21
25
1.99
65658781--65659038
120
2.2
120
91
3
414
26
27
21
24
1.99
65662019--65662136
42
2.8
42
81
0
128
28
22
18
29
1.98
65668315--65668341
13
2.1
13
100
0
54
55
0
7
37
1.28
65671036--65671203
40
4.2
40
80
12
175
23
22
27
26
1.99
65671036--65671203
80
2.1
79
86
4
230
23
22
27
26
1.99
65702168--65702301
46
2.9
45
84
7
155
23
29
17
29
1.97
65705705--65705816
48
2.3
48
78
6
120
31
16
29
22
1.96
65711108--65711229
46
2.7
45
75
6
120
34
18
24
22
1.96
65711296--65711461
49
3.4
49
80
5
169
28
19
26
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65724128--65724273
40
3.7
40
83
0
166
25
27
21
26
1.99
65724160--65724311
40
3.8
40
82
5
155
23
25
21
28
1.99
65728975--65729040
33
2.0
33
82
11
82
22
25
21
30
1.99
65729069--65729105
20
1.9
18
89
10
56
37
16
21
24
1.93
65730766--65730866
28
3.5
28
82
6
96
28
26
14
29
1.95
65741085--65741111
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
65741513--65741558
3
15.3
3
100
0
92
34
0
0
65
0.93
65744222--65744261
18
2.2
19
86
4
55
60
10
2
27
1.42
65746743--65747114
156
2.4
157
85
5
504
34
19
17
28
1.95
65747030--65747087
30
1.9
30
96
0
107
36
27
13
22
1.92
65749450--65749483
12
2.9
11
87
12
50
26
0
0
73
0.83
65758118--65758150
15
2.1
17
88
11
52
39
0
0
60
0.97
65760782--65760814
18
1.9
18
88
11
52
54
0
0
45
0.99
65761059--65761098
21
2.0
21
95
5
73
27
0
30
42
1.56
65761357--65761472
32
3.6
32
90
0
169
41
9
10
38
1.72
65770545--65770719
44
3.8
44
72
15
158
24
30
18
26
1.98
65773464--65773617
40
3.8
40
80
1
157
26
21
26
25
1.99
65779427--65779611
40
4.6
40
83
7
225
24
22
27
24
2.00
65779427--65779611
80
2.3
81
86
4
250
24
22
27
24
2.00
65781485--65781705
95
2.3
96
84
6
279
27
28
18
25
1.98
65781485--65781705
47
4.6
48
85
4
277
27
28
18
25
1.98
65781484--65781808
48
6.7
50
80
6
207
25
26
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65787764--65787892
46
2.8
46
82
7
145
20
30
20
27
1.98
65790448--65790582
29
4.7
29
93
0
216
31
16
22
29
1.96
65802278--65802307
14
2.2
13
94
5
51
20
6
13
60
1.55
65814478--65814645
40
4.2
40
77
3
151
22
26
23
27
2.00
65816545--65816767
48
4.6
48
78
7
202
24
17
30
28
1.97
65817959--65818023
28
2.3
28
97
0
121
16
23
44
15
1.86
65818172--65818210
21
1.9
20
94
5
69
10
38
30
20
1.86
65825782--65825880
28
3.5
29
83
6
114
30
27
15
27
1.96
65831177--65831210
8
4.2
8
100
0
68
61
11
0
26
1.30
65835182--65835352
93
1.8
93
94
0
306
28
28
21
21
1.98
65835177--65835349
46
3.7
46
77
13
201
29
27
20
21
1.98
65849968--65850067
49
2.0
49
92
0
164
57
10
4
29
1.50
65852078--65852105
14
2.0
14
100
0
56
21
21
21
35
1.96
65855410--65855489
29
2.7
29
86
5
108
26
33
15
25
1.95
65856035--65856079
2
23.0
2
95
4
83
51
0
0
48
1.00
65857024--65857120
49
2.0
49
93
0
167
54
11
4
29
1.54
65861039--65861080
21
2.0
21
100
0
84
9
33
14
42
1.78
65874018--65874084
16
4.2
16
88
0
98
31
25
1
41
1.64
65880868--65881015
73
2.0
73
96
0
269
36
16
11
35
1.85
65897663--65897811
49
3.0
49
99
0
289
31
8
28
31
1.86
65897792--65897827
16
2.2
16
100
0
72
27
11
36
25
1.90
65897743--65897876
65
2.1
65
97
2
252
29
8
31
29
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65897808--65897968
49
3.3
49
91
0
250
30
9
31
29
1.88
65897694--65897925
114
2.0
114
96
0
428
30
9
30
30
1.88
65897663--65897968
163
1.9
163
93
0
531
30
8
30
30
1.88
65898015--65898099
37
2.3
37
93
0
143
23
20
35
21
1.96
65903895--65903956
29
2.4
24
72
23
61
33
1
19
45
1.60
65903903--65903961
29
2.0
29
96
0
109
33
3
22
40
1.70
65913463--65913502
20
2.0
20
100
0
80
30
25
30
15
1.95
65913488--65913570
23
3.6
23
95
0
139
15
27
30
26
1.96
65916832--65916873
21
2.0
21
90
0
66
21
7
23
47
1.75
65932805--65932975
93
1.8
93
89
2
272
22
20
27
29
1.98
65938510--65938655
40
3.7
40
87
0
204
26
23
26
23
2.00
65940651--65940714
31
2.0
32
96
3
121
35
12
6
45
1.67
65941674--65941795
57
2.1
59
86
4
167
26
20
4
48
1.70
65942986--65943032
23
2.0
23
100
0
94
29
0
29
40
1.57
65944418--65944584
40
4.2
40
80
5
160
23
26
23
25
2.00
65945812--65945848
19
1.9
19
88
0
56
0
16
2
81
0.81
65952456--65952540
40
2.2
39
89
2
125
22
29
27
21
1.99
65953846--65953882
19
1.9
19
88
0
56
0
16
2
81
0.81
65955303--65955485
86
2.1
91
77
17
219
36
16
8
38
1.80
65955519--65955605
29
3.0
29
78
11
81
54
1
1
43
1.15
65955563--65955661
10
10.4
10
73
17
77
64
1
4
30
1.18
65955570--65955663
19
4.9
19
77
18
81
64
1
4
29
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65955563--65955663
28
3.6
28
75
17
84
64
0
3
30
1.18
65955755--65955795
17
2.3
18
87
4
57
21
4
0
73
1.02
65958425--65958451
2
13.5
2
100
0
54
51
0
48
0
1.00
65962224--65962426
53
3.8
54
78
1
210
20
23
19
36
1.95
65967403--65967504
28
3.6
28
93
0
159
29
23
10
36
1.89
65972475--65972629
28
5.5
28
77
3
166
29
35
19
16
1.93
65972445--65972631
57
3.2
57
94
1
311
28
36
17
17
1.93
65972445--65972601
29
5.4
29
73
4
147
28
36
17
16
1.92
65974608--65974713
28
3.8
28
91
2
151
30
24
10
34
1.89
65977902--65977941
20
2.0
20
85
0
53
45
7
2
45
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770