Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  7  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1900762--1900798
16
2.4
16
90
4
58
29
2
2
64
1.21
1900776--1900816
20
2.1
19
86
4
55
31
4
2
60
1.30
1900976--1901026
23
2.2
23
82
6
68
66
0
11
21
1.23
1902845--1902922
40
2.0
40
89
0
120
37
32
12
17
1.88
1904850--1904991
54
2.7
53
77
9
150
33
20
23
23
1.97
1908683--1908732
26
1.9
27
84
8
68
50
4
0
46
1.20
1908652--1908735
9
9.2
9
73
13
57
53
2
1
42
1.21
1908663--1908747
9
9.6
9
69
12
50
51
2
0
45
1.13
1908674--1908742
35
2.0
34
83
8
86
52
2
0
44
1.16
1914799--1914891
22
4.1
21
72
21
73
30
5
1
63
1.23
1914797--1914885
47
1.9
46
86
6
126
31
5
1
61
1.26
1914846--1914987
20
6.9
20
69
10
72
33
3
1
61
1.21
1914796--1914892
21
4.4
21
70
24
67
31
5
1
61
1.24
1914924--1914981
12
5.8
10
76
23
52
24
5
0
70
1.07
1914927--1914953
12
2.2
12
100
0
54
14
7
0
77
0.97
1914923--1914987
20
3.2
20
80
6
78
29
4
0
66
1.12
1917005--1917078
24
3.0
23
74
18
60
60
0
1
37
1.05
1917717--1917793
28
2.7
27
80
15
75
57
1
10
31
1.41
1922825--1922879
15
3.5
15
72
13
56
50
12
16
20
1.77
1922814--1922880
33
2.0
33
100
0
134
50
11
19
17
1.77
1922814--1922864
15
3.0
18
66
16
54
52
9
19
17
1.72
1923404--1923437
15
2.2
16
90
10
54
67
5
5
20
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1923447--1923545
3
32.7
3
75
2
81
57
2
9
31
1.41
1924500--1924556
28
2.0
28
93
0
96
10
31
19
38
1.86
1924684--1924795
55
2.0
55
92
0
188
23
24
19
33
1.97
1924739--1925127
41
8.7
41
69
16
161
26
19
20
33
1.96
1924825--1925241
44
9.2
44
70
11
243
27
20
18
34
1.96
1924739--1925086
182
1.9
181
88
1
527
27
19
19
33
1.96
1924880--1925230
137
2.6
136
89
1
531
27
19
18
33
1.96
1925058--1925135
41
1.9
41
86
0
111
24
19
21
34
1.96
1925300--1926139
86
9.7
86
85
2
1009
22
23
21
32
1.98
1925413--1925825
44
9.5
44
66
8
200
22
23
21
33
1.97
1925300--1926139
174
4.8
173
85
2
1031
22
23
21
32
1.98
1925901--1926040
42
3.3
42
69
16
126
21
25
22
30
1.99
1925986--1926128
44
3.3
44
67
19
120
22
23
22
31
1.98
1926191--1926382
64
3.0
64
94
0
321
36
14
18
30
1.90
1930114--1930490
43
8.8
43
91
0
587
22
20
32
25
1.98
1930565--1930631
31
2.2
31
83
0
80
59
17
4
17
1.53
1930888--1930933
21
2.2
21
84
0
56
2
50
19
28
1.60
1936510--1936673
9
17.6
9
75
9
123
37
0
14
47
1.48
1938519--1938872
46
8.0
46
87
7
498
22
22
15
39
1.92
1938698--1938767
34
2.1
34
100
0
140
21
24
20
34
1.97
1938648--1938872
80
2.6
85
89
9
343
24
22
16
37
1.93
1938609--1938859
126
2.0
126
99
0
493
23
22
16
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1938563--1938872
172
1.8
172
94
0
557
22
22
15
38
1.92
1941006--1941057
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
1943889--1944237
46
8.0
45
84
11
431
22
23
15
38
1.92
1943933--1944237
80
3.5
88
88
9
457
22
23
16
38
1.93
1944068--1944137
34
2.1
34
100
0
140
21
24
20
34
1.97
1946372--1946423
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
1947231--1947262
14
2.3
14
94
0
55
31
15
0
53
1.43
1950575--1950632
28
2.1
28
83
6
73
36
29
1
32
1.68
1950609--1950652
21
2.1
21
91
0
70
34
34
2
29
1.70
1950882--1950924
21
2.0
21
86
8
61
41
39
0
18
1.51
1950998--1951208
41
5.1
41
87
2
291
22
24
18
34
1.96
1951232--1951257
12
2.2
12
100
0
52
46
30
15
7
1.74
1952797--1952830
15
2.2
16
90
10
54
67
5
5
20
1.33
1952840--1953317
3
157.7
3
73
12
280
60
2
7
28
1.40
1955872--1955933
32
1.9
32
100
0
124
32
3
27
37
1.73
1963344--1963397
27
2.0
27
96
0
99
48
16
11
24
1.79
1991607--1991988
133
2.9
133
94
0
656
27
10
17
44
1.81
1994709--1995274
192
2.9
192
94
0
970
21
27
15
35
1.93
1999803--1999872
17
4.3
15
75
17
61
7
15
0
77
0.98
1999815--1999860
14
3.1
14
82
14
56
6
13
0
80
0.89
1999834--1999893
12
4.8
12
76
15
59
5
21
1
71
1.14
1999804--1999876
24
3.0
24
81
13
80
6
17
0
75
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1999804--1999899
22
4.2
22
75
17
72
6
18
1
73
1.09
2000330--2000356
14
1.9
14
100
0
54
7
3
7
81
0.97
2001672--2001709
19
2.0
20
84
5
51
42
2
2
52
1.29
2007849--2007894
20
2.1
23
84
11
62
69
0
0
30
0.89
2009667--2009720
17
3.2
17
71
5
56
55
0
9
35
1.32
2009657--2009727
33
2.2
33
92
0
115
53
0
8
38
1.31
2018662--2018738
39
2.0
39
89
0
118
14
23
22
40
1.90
2018677--2018740
18
3.4
18
77
12
74
12
25
23
39
1.90
2034009--2034070
24
2.6
24
76
0
70
43
6
35
14
1.71
2036173--2036231
14
4.0
15
69
18
52
42
0
0
57
0.98
2036344--2036414
31
2.3
31
80
9
83
25
7
15
52
1.68
2041630--2041667
19
2.0
19
85
10
51
23
26
28
21
1.99
2044663--2044701
20
2.0
20
84
0
51
46
0
2
51
1.14
2045720--2045763
5
9.2
5
80
9
56
38
0
2
59
1.10
2045755--2045811
16
3.4
18
68
20
52
56
1
0
42
1.10
2045851--2045912
33
2.0
30
84
9
79
61
0
1
37
1.06
2049523--2049699
50
3.5
50
94
0
291
35
15
23
26
1.94
2049675--2049885
31
6.8
31
90
1
289
29
18
24
27
1.98
2049907--2050032
49
2.6
48
86
3
166
30
15
25
28
1.95
2051089--2051273
46
4.0
46
81
0
208
29
21
17
31
1.96
2051089--2051273
92
2.0
92
84
0
244
29
21
17
31
1.96
2052565--2052615
24
2.1
24
100
0
102
47
25
3
23
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2057579--2057700
33
3.7
33
93
2
201
18
9
41
29
1.83
2065960--2066004
3
15.7
3
90
9
76
35
0
0
64
0.94
2066536--2066588
3
17.7
3
96
0
88
30
0
3
66
1.10
2066924--2066957
15
2.1
15
89
10
50
64
0
35
0
0.94
2066923--2066961
17
2.3
18
82
13
55
66
0
33
0
0.92
2081372--2081422
13
4.0
13
80
14
61
37
49
3
9
1.55
2081836--2082046
3
68.7
3
72
13
119
30
7
2
60
1.36
2082188--2082226
3
13.0
3
100
0
78
33
0
0
66
0.92
2082245--2082304
22
2.9
20
72
27
54
23
8
1
66
1.28
2083909--2083979
21
3.5
21
71
7
74
46
0
1
52
1.09
2083905--2083983
40
2.0
40
100
0
158
44
0
2
53
1.14
2083917--2084000
40
2.2
39
85
8
111
50
1
2
46
1.22
2085703--2085762
29
2.1
29
87
0
84
30
1
28
40
1.66
2086741--2086785
14
3.3
14
78
6
56
48
15
0
35
1.45
2089146--2089590
133
3.4
132
86
3
576
30
21
19
28
1.98
2089287--2089496
45
4.7
45
71
15
166
30
21
20
28
1.98
2089510--2089852
44
7.7
44
71
13
234
25
23
21
28
1.99
2089575--2089899
46
7.2
45
72
12
229
26
23
21
28
1.99
2089489--2089910
135
3.1
135
92
2
672
26
22
21
29
1.99
2089972--2090100
64
2.0
65
87
1
188
37
14
17
30
1.89
2091189--2091220
17
1.9
17
93
6
57
3
9
0
87
0.64
2095186--2095244
22
2.6
23
84
10
68
55
5
5
33
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2104138--2104189
26
2.0
28
85
11
74
57
7
5
28
1.50
2106772--2106834
29
2.1
31
85
11
87
68
6
6
19
1.34
2110508--2110572
20
3.4
18
75
10
58
40
0
3
56
1.15
2118762--2118908
73
2.0
73
95
0
267
36
11
10
41
1.77
2123255--2123401
48
3.1
48
90
0
231
17
19
29
32
1.95
2129957--2130117
29
5.6
29
87
1
207
25
16
32
26
1.96
2134704--2134733
13
2.3
13
94
0
51
26
30
13
30
1.94
2137746--2137797
22
2.4
22
100
0
104
7
11
26
53
1.63
2140044--2140068
7
3.6
7
100
0
50
84
0
0
16
0.63
2142722--2142794
36
2.0
36
94
0
128
43
10
8
36
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770