Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  590  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
184502971--184502998
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
184503140--184503184
15
3.1
14
83
6
54
13
17
13
55
1.69
184505862--184506156
50
5.9
50
82
2
313
25
17
25
30
1.98
184505913--184506156
101
2.4
99
82
4
292
26
19
25
29
1.98
184506016--184506099
28
3.2
28
64
25
74
25
16
28
29
1.97
184505866--184506162
150
2.0
153
88
3
449
25
17
25
30
1.97
184506355--184506384
16
1.9
15
93
6
51
43
0
23
33
1.54
184507800--184507847
25
1.9
25
95
0
87
16
25
37
20
1.93
184512321--184512485
43
3.9
42
75
11
147
22
18
27
32
1.97
184512649--184512712
29
2.2
30
75
10
71
40
6
21
31
1.78
184514993--184515145
39
3.9
39
92
0
252
23
20
32
23
1.98
184514994--184515164
39
4.4
39
89
0
243
23
21
30
23
1.99
184519029--184519195
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
184519045--184519195
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
184529438--184529601
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
184529438--184529635
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
184534613--184534685
29
2.5
29
93
0
110
27
30
15
27
1.96
184537454--184537644
40
4.8
39
76
7
163
24
21
28
24
1.99
184539368--184539421
27
2.0
27
92
0
90
25
14
22
37
1.93
184546645--184546702
21
2.7
22
81
7
75
58
0
1
39
1.08
184546649--184546700
14
3.7
14
74
7
52
59
0
1
38
1.08
184546858--184546901
9
4.4
9
81
18
52
61
0
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
184548953--184548981
13
2.2
13
100
0
58
58
0
13
27
1.36
184551887--184551923
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
184552398--184552448
26
2.0
26
92
0
84
31
13
0
54
1.39
184552405--184552461
26
2.2
26
83
0
69
31
8
1
57
1.39
184554637--184554778
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
21
1.99
184554675--184554804
40
3.3
39
78
11
147
23
23
26
25
2.00
184562623--184562773
40
3.8
40
80
6
164
26
23
27
23
2.00
184566562--184566710
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
184566603--184566710
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
184574679--184574827
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
184574720--184574827
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
184595399--184595547
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
184595440--184595547
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
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Size
Copy
Number
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Percent
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Period
Size
Copy
Number
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Copy
Number
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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2.3
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5
147
26
33
19
20
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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