Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  212  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63356532--63356680
77
1.9
77
91
2
246
26
22
24
26
2.00
63357482--63357574
27
3.5
26
88
7
125
20
24
20
34
1.96
63357603--63357852
27
9.3
27
79
6
184
32
9
19
38
1.84
63357603--63357879
54
5.1
54
75
8
206
33
9
19
37
1.84
63357630--63357879
27
9.3
25
72
15
128
34
8
19
38
1.83
63357603--63357852
81
3.1
79
74
11
238
32
9
19
38
1.84
63357831--63358038
27
7.8
27
90
2
289
37
9
25
27
1.86
63357630--63357879
81
3.1
79
72
10
202
34
8
19
38
1.83
63357831--63358038
53
3.9
54
89
3
289
37
9
25
27
1.86
63357831--63358038
80
2.6
80
86
4
287
37
9
25
27
1.86
63358044--63358106
27
2.3
27
83
5
83
33
7
17
41
1.79
63360403--63360493
41
2.2
42
90
2
139
34
20
15
29
1.94
63360638--63360735
26
3.8
26
93
1
171
25
23
24
26
2.00
63361535--63361617
27
3.1
27
91
5
125
20
26
21
31
1.98
63361685--63362187
27
18.9
27
80
6
197
34
8
20
35
1.84
63361656--63361907
54
4.6
54
78
6
231
32
10
19
38
1.85
63361857--63362085
81
2.9
81
83
1
239
39
8
21
30
1.83
63362098--63362182
25
3.3
25
86
8
109
32
8
17
41
1.79
63364417--63364485
31
2.2
31
89
0
102
30
24
13
31
1.93
63364510--63364601
42
2.2
42
92
0
148
34
21
14
29
1.93
63364745--63364894
26
5.8
26
86
0
212
27
22
22
28
1.99
63364736--63364894
52
3.1
52
90
2
252
27
22
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63364745--63364894
78
1.9
77
90
1
237
27
22
22
28
1.99
63365691--63365774
27
3.1
27
93
3
134
20
26
22
30
1.98
63365836--63366118
27
10.4
27
76
6
115
34
8
20
36
1.83
63365925--63366046
54
2.3
54
91
2
192
31
9
21
38
1.84
63365813--63366064
81
3.1
80
73
7
204
31
9
21
38
1.84
63366016--63366176
54
3.0
54
83
1
144
39
8
22
29
1.84
63366016--63366245
81
2.9
81
83
4
216
39
8
22
29
1.83
63366042--63366252
27
7.9
27
87
4
248
39
7
25
27
1.83
63366050--63366252
54
3.8
54
88
1
275
39
7
25
27
1.83
63366258--63366347
27
3.3
27
84
6
112
33
10
16
40
1.82
63366381--63366447
28
2.4
28
97
0
125
28
29
22
19
1.98
63366799--63366831
13
2.5
13
100
0
66
21
15
30
33
1.94
63377002--63377081
29
2.8
29
84
5
92
27
27
12
32
1.93
63377215--63377271
28
2.0
28
100
0
114
24
28
21
26
1.99
63384774--63384856
29
2.9
29
80
8
89
28
31
15
24
1.96
63385075--63385109
16
2.2
16
89
0
52
8
20
20
51
1.73
63391706--63391819
43
2.7
43
87
0
156
28
20
28
23
1.99
63398063--63398323
39
6.7
39
93
0
405
23
29
25
21
1.99
63398305--63398338
15
2.3
15
100
0
68
14
29
32
23
1.94
63398266--63398377
54
2.1
54
96
0
206
23
28
25
22
1.99
63405400--63405577
49
3.7
49
90
4
274
33
7
30
29
1.84
63405400--63405577
96
1.9
95
88
4
268
33
7
30
29
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63408813--63408891
39
2.0
39
100
0
158
34
15
22
27
1.94
63416201--63416258
26
2.2
26
93
0
98
36
24
5
34
1.78
63424026--63424066
20
2.0
20
95
0
73
39
17
4
39
1.71
63426082--63426131
24
2.1
24
92
0
82
30
26
12
32
1.92
63431267--63431305
20
1.9
21
89
5
62
38
5
17
38
1.72
63437371--63437419
24
2.0
24
85
14
66
34
0
6
59
1.22
63437802--63437909
26
4.2
26
90
0
171
31
6
25
37
1.81
63439502--63439696
27
7.2
26
82
6
228
17
23
24
35
1.95
63439502--63439696
54
3.6
54
91
1
311
17
23
24
35
1.95
63442654--63442871
107
2.0
107
98
0
418
27
13
30
27
1.94
63445970--63446076
26
4.2
26
90
2
171
32
6
24
36
1.81
63445970--63446076
51
2.1
52
92
1
180
32
6
24
36
1.81
63447688--63447800
27
4.2
27
82
6
140
18
22
23
35
1.96
63447688--63447800
54
2.1
54
91
3
183
18
22
23
35
1.96
63453441--63453611
93
1.8
93
94
0
306
28
29
21
21
1.98
63453433--63453608
46
3.8
46
79
10
214
28
28
20
21
1.98
63461254--63461350
37
2.7
37
87
6
128
24
25
17
31
1.97
63461380--63461500
48
2.5
48
82
0
152
30
25
17
26
1.97
63461462--63461562
37
2.7
37
83
6
116
24
26
19
28
1.99
63471614--63471677
29
2.2
29
100
0
128
18
25
10
45
1.82
63476447--63476560
46
2.5
46
84
5
133
28
19
28
23
1.98
63482452--63482565
46
2.5
46
85
5
142
27
20
29
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63493258--63493306
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
63499713--63499826
39
2.9
39
86
1
156
23
31
21
23
1.98
63507057--63507084
13
2.2
13
100
0
56
50
14
7
28
1.69
63514379--63514440
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
63522617--63522695
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60
63522613--63522658
20
2.2
21
92
7
85
47
19
0
32
1.50
63522613--63522659
11
4.5
11
87
12
73
46
19
0
34
1.50
63522692--63522719
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
63530969--63531062
18
5.4
18
92
3
131
36
25
9
28
1.87
63530969--63531049
9
9.0
9
70
0
54
34
27
9
28
1.89
63533428--63533516
21
4.1
21
84
5
90
53
10
23
12
1.68
63533428--63533496
21
3.3
21
87
2
95
55
8
24
11
1.64
63537663--63537691
14
2.1
14
100
0
58
51
6
13
27
1.66
63543373--63543405
16
2.1
16
94
0
57
39
9
12
39
1.74
63543871--63543904
15
2.3
15
89
0
50
35
2
23
38
1.70
63544904--63544943
19
2.1
19
90
0
62
30
15
2
52
1.55
63546631--63546659
14
2.1
14
100
0
58
34
0
13
51
1.42
63546784--63546823
21
1.9
21
89
0
62
30
12
0
57
1.36
63547407--63547431
11
2.3
11
100
0
50
64
8
0
28
1.22
63548095--63548133
16
2.7
15
88
11
55
17
5
0
76
0.96
63552787--63552832
23
2.0
23
100
0
92
34
13
13
39
1.83
63553373--63553400
14
2.0
14
100
0
56
35
7
21
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63554559--63554616
29
2.0
29
100
0
116
37
17
13
31
1.89
63570667--63570709
15
3.2
15
69
30
51
65
0
6
27
1.18
63570660--63570709
25
2.0
25
100
0
100
64
0
8
28
1.22
63576338--63576411
33
2.3
33
86
6
100
44
4
0
51
1.20
63576404--63576623
11
21.4
10
69
24
97
65
2
2
29
1.21
63576453--63576533
22
3.4
24
82
17
114
69
3
3
23
1.21
63576521--63576575
13
4.4
13
93
2
87
67
0
0
32
0.91
63576527--63576623
15
6.7
15
75
12
78
63
0
3
32
1.10
63576470--63576633
43
3.7
42
74
16
118
66
1
3
28
1.16
63576429--63576625
49
4.0
50
75
14
139
65
2
3
28
1.21
63576569--63576672
20
5.4
20
69
21
62
59
0
5
33
1.28
63576471--63576631
13
11.8
14
66
26
55
66
1
3
28
1.16
63576647--63576730
26
3.6
23
69
13
64
53
3
0
42
1.18
63576651--63576739
23
3.7
26
71
13
82
51
4
1
42
1.29
63582379--63582409
15
2.1
15
100
0
62
19
12
0
67
1.22
63583084--63583117
16
2.1
17
94
5
61
64
0
11
23
1.26
63584018--63584079
16
4.0
15
74
13
54
20
9
11
58
1.61
63584036--63584086
16
3.2
16
97
0
93
21
11
13
52
1.72
63585404--63585437
14
2.4
14
90
5
50
67
0
17
14
1.23
63586708--63586796
9
10.3
9
70
20
57
59
0
2
38
1.10
63586704--63586761
19
3.1
19
83
11
68
65
0
0
34
0.93
63586677--63586818
34
4.1
35
75
15
109
60
0
3
35
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63586700--63586818
24
4.9
24
76
11
109
61
0
2
36
1.10
63586754--63586789
15
2.3
16
95
4
65
55
0
5
38
1.23
63586700--63586839
23
6.2
22
74
17
85
60
0
2
36
1.11
63587227--63587253
13
2.1
13
100
0
54
48
0
7
44
1.31
63587414--63587463
19
2.5
21
84
9
70
36
2
0
62
1.07
63587540--63587578
17
2.3
17
86
8
53
23
2
5
69
1.21
63587714--63587745
15
2.0
17
88
11
50
31
3
9
56
1.47
63588368--63588410
18
2.4
18
88
0
59
69
6
13
9
1.35
63593135--63593165
15
2.1
15
100
0
62
12
19
19
48
1.81
63596580--63596663
20
4.4
19
73
23
70
33
5
1
59
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770