Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  490  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151764059--151764351
38
7.7
38
83
0
352
22
21
22
33
1.98
151764061--151764333
76
3.6
76
89
0
420
21
21
23
32
1.98
151764357--151764478
45
2.8
44
83
8
137
24
25
27
22
2.00
151765905--151765937
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
151767398--151767431
12
2.8
12
100
0
68
47
17
0
35
1.48
151767932--151767992
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
151774961--151775267
40
7.7
40
85
1
235
24
27
21
27
1.99
151774968--151775191
79
2.8
80
89
2
317
22
26
22
27
1.99
151775001--151775267
119
2.2
119
81
5
299
24
27
22
25
2.00
151775125--151775277
80
1.9
81
94
1
272
26
26
20
27
1.99
151783923--151784130
40
5.2
40
83
2
222
25
26
22
25
2.00
151793804--151793987
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
151793844--151794032
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
151799762--151799794
16
2.1
16
94
0
57
39
9
12
39
1.74
151800259--151800292
15
2.3
15
89
0
50
35
2
23
38
1.70
151801292--151801331
19
2.1
19
90
0
62
30
15
2
52
1.55
151803018--151803046
14
2.1
14
100
0
58
34
0
13
51
1.42
151803171--151803210
21
1.9
21
89
0
62
30
12
0
57
1.36
151803794--151803818
11
2.3
11
100
0
50
64
8
0
28
1.22
151804482--151804521
14
2.7
15
88
7
55
17
5
0
77
0.94
151809176--151809221
23
2.0
23
100
0
92
34
13
13
39
1.83
151809762--151809789
14
2.0
14
100
0
56
35
7
21
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151810948--151811005
29
2.0
29
100
0
116
37
17
13
31
1.89
151827057--151827099
15
3.2
15
69
30
51
65
0
6
27
1.18
151827050--151827099
25
2.0
25
100
0
100
64
0
8
28
1.22
151832728--151832801
33
2.3
33
86
6
100
44
4
0
51
1.20
151832794--151833013
11
21.4
10
69
24
97
65
2
2
29
1.21
151832843--151832923
22
3.4
24
82
17
114
69
3
3
23
1.21
151832911--151832965
13
4.4
13
93
2
87
67
0
0
32
0.91
151832917--151833013
15
6.7
15
75
12
78
63
0
3
32
1.10
151832860--151833023
43
3.7
42
74
16
118
66
1
3
28
1.16
151832819--151833015
49
4.0
50
75
14
139
65
2
3
28
1.21
151832959--151833062
20
5.4
20
69
21
62
59
0
5
33
1.28
151832861--151833021
13
11.8
14
66
26
55
66
1
3
28
1.16
151833037--151833120
26
3.6
23
69
13
64
53
3
0
42
1.18
151833041--151833129
23
3.7
26
71
13
82
51
4
1
42
1.29
151838769--151838799
15
2.1
15
100
0
62
19
12
0
67
1.22
151839474--151839507
16
2.1
17
94
5
61
64
0
11
23
1.26
151840407--151840468
16
4.0
15
74
13
54
20
9
11
58
1.61
151840425--151840475
16
3.2
16
97
0
93
21
11
13
52
1.72
151841791--151841824
14
2.4
14
90
5
50
67
0
17
14
1.23
151843095--151843183
9
10.3
9
70
20
57
59
0
2
38
1.10
151843091--151843148
19
3.1
19
83
11
68
65
0
0
34
0.93
151843064--151843205
34
4.1
35
75
15
109
60
0
3
35
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151843087--151843205
24
4.9
24
76
11
109
61
0
2
36
1.10
151843141--151843176
15
2.3
16
95
4
65
55
0
5
38
1.23
151843087--151843226
23
6.2
22
74
17
85
60
0
2
36
1.11
151843614--151843640
13
2.1
13
100
0
54
48
0
7
44
1.31
151843805--151843853
8
5.9
8
80
15
55
36
2
0
61
1.08
151843922--151843960
17
2.3
17
86
8
53
23
2
5
69
1.21
151844096--151844127
15
2.0
17
88
11
50
31
3
9
56
1.47
151844746--151844788
18
2.4
18
88
0
59
69
6
13
9
1.35
151853541--151853615
29
2.6
29
78
4
80
21
36
21
21
1.96
151853599--151853672
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
151858514--151858538
13
1.9
13
100
0
50
16
28
40
16
1.89
151860277--151860648
131
2.8
130
74
8
353
35
18
18
27
1.94
151860277--151860783
263
1.9
263
79
5
560
34
17
19
28
1.95
151863661--151864140
44
10.9
44
84
0
582
26
29
13
29
1.94
151877267--151877401
24
5.6
24
95
0
225
20
17
24
37
1.94
151877267--151877419
48
3.2
47
88
4
216
23
17
22
35
1.95
151877267--151877419
72
2.1
72
86
4
211
23
17
22
35
1.95
151878773--151879107
131
2.5
131
75
8
315
34
19
18
27
1.95
151881864--151881910
22
2.1
23
84
11
62
6
0
21
72
1.07
151889339--151889379
2
20.5
2
94
0
73
51
2
0
46
1.14
151889473--151889544
29
2.5
29
93
0
99
26
31
15
26
1.95
151891099--151891128
14
2.1
14
100
0
60
33
6
40
20
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151891864--151891945
29
2.8
29
98
0
155
29
14
30
25
1.95
151896990--151897163
46
3.8
46
78
13
214
20
21
29
28
1.98
151902920--151903093
48
3.6
48
77
3
179
29
16
25
28
1.96
151902920--151903101
98
1.9
96
83
4
240
30
16
25
28
1.97
151904334--151904372
21
1.9
20
89
5
60
10
41
30
17
1.83
151907560--151907629
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
151915332--151915401
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
151918987--151919211
40
5.7
40
86
5
296
24
22
27
25
2.00
151925138--151925218
40
2.0
40
100
0
162
48
9
14
27
1.76
151926079--151926188
26
4.2
26
95
0
193
32
7
25
34
1.83
151927972--151928246
137
2.0
137
98
0
532
25
19
24
31
1.98
151938271--151938345
23
3.2
23
62
23
57
29
10
32
28
1.90
151938193--151938508
47
6.6
47
91
2
452
31
12
29
25
1.93
151938482--151938618
46
3.0
46
93
0
220
32
9
32
25
1.88
151938766--151938910
37
3.9
37
94
0
245
24
18
31
26
1.98
151941362--151941431
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
151941362--151941443
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
151947755--151947783
12
2.4
12
100
0
58
17
34
17
31
1.93
151951000--151951173
71
2.5
70
86
2
235
28
13
22
34
1.93
151951173--151951337
72
2.3
70
86
5
224
22
15
20
41
1.89
151951270--151952036
140
5.5
140
97
0
1419
25
17
19
37
1.93
151951270--151952036
279
2.7
280
96
1
1419
25
17
19
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151951874--151951907
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
151951956--151952181
72
3.0
72
83
11
285
31
16
18
33
1.93
151952135--151952230
49
2.0
49
95
0
174
30
15
21
32
1.95
151952063--151952302
121
2.0
121
93
0
408
31
15
18
33
1.93
151952184--151952535
78
4.7
75
85
5
401
32
16
17
32
1.93
151952184--151952535
152
2.4
148
84
5
424
32
16
17
32
1.93
151952458--151952629
94
1.8
94
87
2
256
29
20
18
31
1.96
151952551--151952902
76
4.5
77
75
13
250
30
16
18
34
1.93
151952886--151952946
30
2.0
30
87
6
88
21
9
26
42
1.84
151952356--151953117
248
3.1
239
82
7
722
29
16
18
35
1.93
151955751--151955811
31
1.9
32
86
3
88
47
6
6
39
1.55
151956476--151956508
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
151956509--151956549
18
2.2
20
91
8
68
63
9
0
26
1.25
151956613--151956677
30
2.2
30
91
0
103
58
12
3
26
1.49
151957535--151957602
30
2.2
31
82
7
77
61
5
4
27
1.38
151959837--151959909
36
2.0
36
100
0
146
43
10
16
28
1.82
151963662--151963750
42
2.1
42
95
0
160
12
20
17
49
1.79
151966403--151966436
15
2.2
16
89
5
52
29
5
2
61
1.34
151968127--151968181
28
2.1
26
90
10
85
69
25
1
3
1.15
151978963--151979100
69
2.0
71
85
2
190
28
14
21
36
1.92
151978963--151979135
69
2.5
70
80
5
181
28
14
21
34
1.93
151979135--151979300
72
2.3
71
88
4
244
22
15
21
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151979278--151979310
13
2.5
13
90
9
50
21
15
6
57
1.59
151979233--151979997
139
5.5
140
97
1
1421
25
17
20
37
1.94
151979229--151979997
418
1.8
420
97
1
1456
25
17
20
37
1.94
151979833--151979857
13
1.9
13
100
0
50
24
12
0
64
1.27
151979917--151980142
72
3.0
72
84
11
285
30
16
18
33
1.94
151980024--151980263
121
2.0
121
93
0
408
31
16
17
34
1.93
151979903--151980417
272
1.9
274
88
4
777
31
16
17
34
1.92
151980148--151980499
79
4.7
75
85
6
410
31
16
19
32
1.94
151980421--151980592
93
1.8
94
83
6
233
28
20
19
31
1.97
151980493--151981087
88
7.2
79
72
16
406
28
16
18
36
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770