Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  769  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244161773--244161915
39
3.7
39
90
2
234
22
30
20
26
1.99
244161733--244161914
77
2.3
79
89
2
269
23
29
22
24
1.99
244169393--244169462
28
2.5
28
90
4
106
27
12
27
32
1.93
244176876--244176950
32
2.3
34
79
9
102
17
25
21
36
1.95
244179275--244179344
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
244185140--244185232
29
3.2
29
84
0
114
32
16
27
23
1.96
244185177--244185245
29
2.4
29
85
0
84
28
15
31
23
1.95
244195598--244195821
40
5.6
40
87
3
306
24
23
26
25
2.00
244195602--244195821
83
2.7
80
88
5
302
23
24
27
25
2.00
244201110--244201219
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
244202704--244202752
25
2.0
25
84
8
64
38
20
16
24
1.92
244206879--244206987
51
2.1
52
89
5
168
33
5
24
35
1.79
244206879--244206987
26
4.2
26
91
6
168
33
5
24
35
1.79
244208464--244208511
24
2.0
25
83
4
62
39
20
14
25
1.91
244211561--244211706
40
3.8
39
80
4
147
26
21
27
23
1.99
244223811--244223982
67
2.6
66
81
7
170
31
16
29
22
1.96
244223835--244224018
67
2.8
64
78
8
203
28
16
30
23
1.96
244225085--244225115
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
244229005--244229118
46
2.6
43
84
4
138
35
14
21
28
1.92
244229005--244229137
46
3.0
45
80
6
135
35
14
23
27
1.93
244237593--244237883
50
5.8
50
83
4
320
24
17
27
29
1.98
244242249--244242285
18
2.1
18
89
0
56
43
0
10
45
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244265221--244265350
47
2.8
47
94
1
217
30
29
20
20
1.98
244265768--244265827
30
2.0
30
87
6
86
28
26
8
36
1.85
244274120--244274284
40
4.2
40
79
5
167
24
27
22
26
2.00
244274136--244274283
78
1.9
77
83
6
192
23
27
22
25
2.00
244275101--244275146
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
244283468--244283566
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
244296374--244296485
49
2.3
48
84
7
138
26
16
30
25
1.97
244296397--244296485
24
3.7
24
85
7
110
28
16
30
24
1.97
244296397--244296509
49
2.3
48
83
11
133
29
15
30
24
1.96
244299034--244299210
43
4.1
44
71
13
152
28
24
15
31
1.96
244301055--244301230
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
244301051--244301222
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
244303385--244303419
17
2.1
17
100
0
70
37
11
11
40
1.77
244304159--244304227
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
244304150--244304237
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
244309707--244309836
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
244309723--244309874
40
3.8
40
78
6
148
22
26
23
27
1.99
244309723--244309872
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
244318124--244318315
79
2.4
81
83
6
232
23
28
23
24
2.00
244318124--244318315
40
4.8
40
81
7
194
23
28
23
24
2.00
244331100--244331265
40
4.2
40
81
3
176
24
27
21
26
1.99
244336455--244336577
22
5.3
22
62
11
66
33
9
27
29
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244336399--244336634
47
5.0
47
96
2
427
33
8
27
29
1.87
244336698--244336733
18
2.0
18
88
0
54
33
11
22
33
1.89
244336591--244336836
123
2.0
123
99
0
483
32
8
26
32
1.87
244336650--244336788
75
2.0
69
83
12
176
32
9
26
31
1.88
244336749--244336900
48
3.2
48
98
0
286
33
6
27
32
1.83
244336544--244336884
171
2.0
170
88
6
503
32
8
27
31
1.86
244336953--244337039
37
2.4
37
100
0
174
24
19
33
22
1.97
244338943--244339203
40
6.6
40
84
6
255
24
20
28
26
1.99
244343809--244343941
59
2.2
60
90
1
205
35
14
24
25
1.93
244343839--244343941
29
3.5
29
96
2
188
36
14
24
24
1.93
244349491--244349523
16
2.1
16
100
0
66
42
18
24
15
1.88
244357283--244357322
17
2.4
17
100
0
80
37
27
0
35
1.57
244359239--244359728
71
7.0
71
70
17
301
35
20
16
27
1.94
244359369--244359901
180
2.7
200
82
12
538
37
20
15
27
1.92
244359583--244359734
67
2.2
71
89
6
233
40
19
16
24
1.91
244359745--244359986
66
3.7
66
86
8
336
38
21
14
25
1.91
244359869--244360355
118
4.0
119
73
17
412
37
22
14
25
1.92
244359986--244360243
69
3.8
68
84
6
315
37
22
13
25
1.91
244359986--244360243
68
3.7
67
83
7
320
37
22
13
25
1.91
244359583--244360406
249
3.3
252
92
6
1315
37
21
14
25
1.92
244360192--244360289
51
1.9
51
85
4
135
42
19
12
25
1.86
244360243--244360401
67
2.4
66
81
13
177
33
24
14
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244365334--244365369
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
244368975--244369130
68
2.2
68
77
13
149
20
28
16
34
1.94
244376613--244376745
25
5.2
26
93
5
218
33
5
24
36
1.78
244376613--244376745
50
2.6
51
96
1
241
33
5
24
36
1.78
244378223--244378274
25
2.0
26
82
10
63
38
23
15
23
1.92
244382416--244382499
26
3.3
26
93
3
152
34
5
23
35
1.80
244385734--244385882
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
244385775--244385882
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
244394751--244394957
40
5.2
40
84
1
218
25
22
26
25
2.00
244394752--244394957
79
2.6
77
83
5
241
25
22
26
25
2.00
244402852--244402916
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
244411174--244411243
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
244419482--244419653
46
3.8
45
80
11
215
21
21
27
29
1.99
244419479--244419648
92
1.8
92
96
0
313
21
21
28
28
1.99
244435972--244436107
41
3.2
41
74
10
123
33
19
15
31
1.93
244452837--244452999
39
4.2
39
91
0
263
23
33
20
22
1.97
244468272--244468382
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
244469113--244469145
13
2.5
13
95
5
57
3
21
0
75
0.93
244479935--244479976
22
1.9
22
100
0
84
19
40
14
26
1.89
244480618--244480777
70
2.3
70
96
3
297
19
28
17
35
1.94
244483445--244483703
40
6.6
40
91
3
402
22
22
26
28
1.99
244491022--244491301
48
5.1
57
73
19
151
33
5
27
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244491133--244491332
48
4.2
48
96
0
364
33
6
28
31
1.83
244490979--244491218
120
2.0
119
92
6
405
34
5
27
32
1.81
244491371--244491460
37
2.4
37
94
3
155
23
17
33
25
1.96
244493356--244493609
40
6.5
39
80
10
214
24
20
27
27
1.99
244497319--244497588
44
6.0
45
85
10
306
33
7
28
30
1.84
244497550--244497774
112
2.0
113
93
6
386
31
4
29
35
1.77
244497569--244497741
57
3.0
59
64
19
148
30
4
30
34
1.78
244497694--244497881
45
4.2
46
88
8
264
30
5
29
34
1.81
244497694--244497860
89
1.9
87
89
7
257
29
4
29
35
1.78
244504228--244504367
41
3.5
41
81
6
162
25
24
22
27
1.99
244508296--244508371
27
2.7
29
81
6
93
26
18
32
22
1.97
244519918--244520047
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
244524176--244524352
40
4.5
40
86
7
220
23
23
28
24
1.99
244530285--244530433
40
3.8
40
85
6
173
26
21
25
26
1.99
244530369--244530476
39
2.7
40
82
5
130
27
23
28
20
1.99
244533121--244533220
51
2.0
51
87
0
146
24
16
28
32
1.96
244533457--244533494
6
6.3
6
96
0
67
36
0
15
47
1.46
244536592--244536799
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
244536593--244536799
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
244541567--244541742
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
244541563--244541734
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
244542752--244542798
23
2.1
23
96
4
87
31
21
29
17
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244544623--244544688
15
4.5
15
80
12
75
10
15
15
59
1.62
244547209--244547282
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
244547150--244547282
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
244554770--244554867
40
2.5
40
81
3
110
25
29
23
21
1.99
244554770--244554919
39
3.8
39
77
9
128
25
28
23
22
1.99
244554812--244554919
40
2.7
40
82
4
130
25
27
24
23
2.00
244562239--244562315
38
2.0
38
97
0
145
20
27
15
36
1.93
244572069--244572143
29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
244588924--244589074
40
3.8
40
82
4
171
28
22
26
22
1.99
244596469--244596626
29
5.5
29
81
6
151
27
15
32
25
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770