Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  521  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
161675098--161675167
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
161682105--161682371
40
6.8
39
89
5
357
25
28
22
23
1.99
161682105--161682370
116
2.3
119
89
6
418
25
28
22
23
1.99
161682105--161682370
78
3.4
78
91
5
421
25
28
22
23
1.99
161691134--161691320
40
4.7
40
91
2
270
25
29
21
24
1.99
161691114--161691324
80
2.7
79
88
4
309
26
28
20
24
1.99
161694274--161694449
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
161694270--161694441
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
161697399--161697467
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
161697390--161697477
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
161699849--161700024
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
161699845--161700016
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
161701418--161701575
29
5.4
29
82
4
176
26
17
31
25
1.97
161709567--161709725
29
5.5
29
82
5
180
26
16
30
25
1.97
161714215--161714283
34
2.0
34
100
0
138
17
23
27
31
1.97
161714215--161714292
34
2.3
34
93
4
122
19
21
25
33
1.97
161715505--161715635
27
4.9
27
76
7
131
38
22
8
29
1.84
161715586--161715684
27
3.6
27
74
18
82
36
26
8
29
1.85
161715505--161715647
54
2.6
54
76
4
146
39
23
8
28
1.83
161720869--161720913
20
2.2
20
88
0
63
51
2
11
35
1.50
161731511--161731691
40
4.6
39
80
6
188
25
20
26
27
1.99
161731510--161731688
78
2.3
80
80
9
215
25
21
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
161733943--161733981
21
1.9
20
89
5
60
41
20
5
33
1.74
161735116--161735191
36
2.1
36
82
4
91
31
11
13
43
1.80
161735130--161735221
36
2.6
34
78
14
87
35
14
7
42
1.74
161738666--161738850
79
2.3
82
83
7
229
24
23
27
24
2.00
161738667--161738858
40
4.8
40
79
7
151
24
23
28
23
2.00
161750404--161750504
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
161758361--161758461
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
161769646--161769701
29
1.9
29
100
0
112
46
3
7
42
1.48
161771790--161771859
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
161779025--161779094
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
161784257--161784432
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
161784253--161784424
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
161787380--161787448
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
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Size
Copy
Number
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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1.97
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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2.7
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128
21
29
25
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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