Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  759  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240781291--240781343
25
2.1
26
96
3
99
30
33
16
18
1.94
240782912--240782946
18
1.9
18
100
0
70
45
25
11
17
1.81
240785989--240786151
39
4.2
39
91
0
263
23
33
20
22
1.97
240788047--240788639
106
5.6
106
83
0
686
32
16
14
35
1.90
240793369--240793502
71
1.9
71
100
0
268
34
17
27
20
1.95
240794802--240794965
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
240794802--240794999
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
240801932--240802095
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
240801932--240802129
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
240806961--240807145
79
2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
240806954--240807145
40
4.8
39
76
8
163
23
28
23
24
2.00
240812869--240812932
32
2.0
32
100
0
128
28
25
6
40
1.79
240821473--240821581
24
4.6
23
85
7
137
33
23
17
24
1.96
240821473--240821581
48
2.3
48
91
3
175
33
23
17
24
1.96
240829331--240829439
24
4.6
23
85
7
137
33
23
17
24
1.96
240829331--240829439
48
2.3
48
91
3
175
33
23
17
24
1.96
240834955--240834992
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
240836622--240836690
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
240839617--240839746
40
3.2
40
83
4
165
24
29
24
21
1.99
240846137--240846174
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
240847789--240847847
27
2.1
28
93
6
102
47
23
11
16
1.80
240851058--240851189
29
4.6
29
84
1
140
25
17
32
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240858781--240858911
29
4.6
29
83
2
131
25
17
32
24
1.97
240858781--240858852
28
2.5
28
95
2
126
27
15
30
26
1.96
240864522--240864684
40
4.1
40
81
5
170
25
28
21
25
1.99
240864522--240864684
80
2.1
79
82
3
193
25
28
21
25
1.99
240879803--240879905
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
240886841--240886943
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
240896191--240896407
40
5.5
40
92
2
332
23
23
27
25
2.00
240904206--240904448
79
3.1
80
92
3
393
22
23
27
26
1.99
240904206--240904448
40
6.1
40
92
2
393
22
23
27
26
1.99
240907643--240907809
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
240909025--240909105
40
2.1
39
97
2
153
22
22
24
30
1.99
240909029--240909094
22
3.2
22
61
30
54
22
19
25
31
1.98
240914069--240914102
17
2.0
17
100
0
68
23
5
35
35
1.79
240916204--240916370
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
240921784--240921861
29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
240936482--240936704
77
2.8
79
83
10
276
26
27
21
25
1.99
240936482--240936704
117
1.9
119
83
9
296
26
27
21
25
1.99
240936463--240936704
40
6.1
39
84
7
269
25
27
21
25
1.99
240940490--240940703
49
4.4
49
95
1
367
28
9
32
29
1.88
240940490--240940708
97
2.2
98
91
0
368
29
9
31
29
1.88
240940805--240940926
37
3.3
37
97
0
226
25
19
33
21
1.97
240942980--240943143
29
5.7
29
98
0
310
26
16
32
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240943627--240943725
41
2.4
41
80
11
114
26
24
24
25
2.00
240946431--240946636
49
4.2
49
93
2
344
28
8
33
29
1.87
240946740--240946856
35
3.3
36
90
7
186
26
16
35
22
1.95
240949775--240949937
39
4.2
39
91
0
263
23
33
20
22
1.97
240957683--240957825
39
3.7
39
87
1
198
23
30
20
25
1.99
240959682--240959879
40
4.9
40
90
3
276
26
20
25
26
1.99
240959683--240959926
40
6.1
40
87
5
135
26
20
26
26
1.99
240959689--240959930
80
3.0
79
84
8
251
27
19
25
27
1.99
240963858--240964024
40
4.2
40
84
3
196
26
28
20
23
1.99
240963858--240964024
80
2.1
79
87
3
237
26
28
20
23
1.99
240963982--240964205
123
1.8
124
83
0
297
33
24
10
32
1.89
240972009--240972176
40
4.2
40
86
3
214
25
28
22
23
1.99
240972009--240972176
80
2.1
80
88
2
248
25
28
22
23
1.99
240972133--240972357
124
1.8
124
83
1
299
32
24
11
31
1.90
240973996--240974104
48
2.3
48
88
1
157
31
23
14
30
1.95
240977809--240977837
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
240977843--240977880
10
3.7
10
86
13
51
78
0
15
5
0.91
240979996--240980219
46
4.9
46
93
3
373
39
14
23
22
1.91
240980008--240980219
89
2.3
90
92
2
345
39
15
23
21
1.91
240979996--240980272
46
6.0
46
90
5
328
40
14
23
22
1.90
240984407--240984578
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
240984399--240984574
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240986922--240987010
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
240986922--240987001
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
240986933--240987010
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
240992286--240992470
40
4.7
40
88
6
261
26
27
21
24
1.99
240992286--240992470
79
2.3
82
87
7
265
26
27
21
24
1.99
241000467--241000651
40
4.7
40
88
6
261
25
27
22
24
2.00
241000467--241000651
79
2.3
82
87
7
265
25
27
22
24
2.00
241013378--241013407
16
1.9
15
93
6
51
86
0
13
0
0.57
241014275--241014443
88
2.0
82
87
6
239
23
15
21
38
1.92
241014345--241014717
98
3.9
99
83
10
435
26
15
18
39
1.91
241014644--241015259
73
8.6
72
86
8
812
31
16
19
32
1.94
241015360--241015392
14
2.4
14
94
0
57
18
12
6
63
1.48
241015196--241015694
91
5.7
88
80
9
427
29
17
17
36
1.92
241015218--241015610
178
2.2
176
83
8
478
28
17
18
36
1.93
241015305--241015766
91
5.3
85
78
9
373
29
16
17
36
1.92
241016419--241016479
18
3.3
18
73
13
70
21
50
8
19
1.73
241016428--241016483
17
3.1
18
69
10
51
21
53
7
17
1.67
241017037--241017095
25
2.4
25
83
10
79
35
5
1
57
1.31
241017107--241017173
25
2.9
23
80
10
82
29
4
5
59
1.41
241016966--241017018
24
2.1
24
80
13
54
35
1
3
58
1.27
241019927--241020120
48
4.1
48
72
14
150
26
18
26
27
1.98
241019848--241020110
93
2.9
91
81
5
257
28
17
25
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
241022287--241022417
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
241022287--241022417
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
241030262--241030331
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
241044068--241044231
71
2.3
72
97
2
314
34
17
28
19
1.95
241047374--241047429
2
29.0
2
92
7
98
50
0
0
50
1.00
241050695--241050884
41
4.5
43
67
13
124
21
21
21
35
1.96
241050600--241050884
85
3.3
84
85
4
322
21
22
19
36
1.95
241050964--241051432
178
2.6
179
95
2
838
26
20
17
34
1.95
241055666--241055903
118
2.0
118
100
0
476
30
24
21
23
1.99
241061937--241062006
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
241069995--241070064
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
241074962--241075158
70
2.8
70
92
3
301
34
17
27
20
1.95
241075017--241075131
40
3.1
40
59
31
92
34
15
27
21
1.94
241074996--241075158
70
2.3
71
98
1
319
35
17
27
19
1.94
241082524--241082721
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
241082590--241082707
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
241082558--241082721
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
241099977--241100009
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
241101031--241101059
13
2.2
13
100
0
58
31
20
24
24
1.98
241103716--241103899
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
241105346--241105440
41
2.3
40
83
1
109
26
22
27
24
2.00
241113331--241113512
40
4.6
40
82
4
181
28
21
26
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
241117699--241117768
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
241117699--241117780
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
241125747--241125816
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
241125747--241125828
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
241131438--241131612
38
4.6
38
79
9
167
25
28
21
25
1.99
241131404--241131612
77
2.7
77
81
8
223
25
27
21
25
1.99
241132632--241132682
25
2.0
25
100
0
102
39
21
15
23
1.92
241139137--241139200
33
1.9
33
100
0
128
29
37
0
32
1.58
241139415--241139630
70
2.8
78
81
15
254
26
27
21
24
1.99
241139415--241139630
40
5.7
39
85
10
263
26
27
21
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770