Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  362  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111083569--111083669
27
3.8
25
77
11
78
40
7
20
30
1.81
111083582--111083669
27
3.3
26
80
6
104
40
5
23
29
1.78
111083568--111083693
54
2.3
53
80
9
146
37
8
22
31
1.85
111092202--111092253
26
2.0
26
100
0
104
26
11
30
30
1.92
111097864--111097910
19
2.6
17
86
6
58
48
8
14
27
1.73
111101457--111101630
40
4.4
39
75
7
136
27
22
27
22
1.99
111114616--111114800
79
2.3
82
81
7
211
24
22
27
25
2.00
111114617--111114807
40
4.8
40
77
7
140
24
21
28
25
1.99
111127988--111128123
47
3.0
44
78
15
143
27
31
16
24
1.97
111132572--111132827
39
6.6
39
94
0
431
29
26
21
22
1.99
111140392--111140647
39
6.6
39
92
0
422
30
26
21
21
1.98
111148695--111148918
124
1.8
123
83
2
297
30
10
24
34
1.89
111148913--111149042
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
111150531--111150714
40
4.6
40
84
2
244
24
25
24
25
2.00
111153024--111153201
40
4.5
40
83
4
191
25
27
20
25
1.99
111158136--111158317
37
4.9
37
88
0
256
28
32
16
23
1.96
111158362--111158841
48
10.0
48
94
0
816
31
27
6
35
1.82
111162164--111162355
40
4.8
40
94
0
312
25
27
20
26
1.99
111163589--111163725
37
3.7
37
98
0
256
24
32
18
23
1.97
111163778--111164353
48
12.0
48
93
0
945
31
26
6
35
1.81
111170167--111170231
28
2.3
28
89
0
94
33
27
6
32
1.82
111170337--111170427
28
3.2
28
90
4
139
20
24
23
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111170337--111170452
56
2.1
55
82
9
137
19
24
21
34
1.96
111170883--111170921
18
2.2
18
85
0
51
25
2
5
66
1.25
111173739--111173800
22
2.9
22
90
2
90
25
27
37
9
1.87
111181260--111181284
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
111181257--111181325
29
2.3
31
80
9
81
60
4
0
34
1.16
111181563--111181645
41
2.0
41
100
0
166
26
16
4
51
1.64
111183420--111183568
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
111183461--111183568
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
111191251--111191303
26
2.0
25
82
13
63
39
22
11
26
1.88
111191609--111191682
32
2.2
34
80
7
89
25
17
24
32
1.97
111191546--111191830
136
2.1
136
93
1
482
24
17
24
32
1.97
111192103--111192185
39
2.1
39
97
0
157
27
9
20
42
1.83
111204241--111204355
3
39.3
3
73
11
87
60
1
6
31
1.34
111205330--111205369
19
2.0
22
85
14
59
32
47
2
17
1.61
111205431--111205570
27
5.2
28
89
5
175
35
22
24
17
1.95
111207190--111207299
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
34
1.76
111207786--111208039
3
83.3
3
68
13
101
57
2
9
30
1.45
111208827--111208858
16
1.9
17
93
6
57
68
6
12
12
1.37
111218293--111218331
15
2.6
15
95
0
69
64
0
2
33
1.08
111221217--111221418
98
2.1
96
85
5
264
43
5
3
47
1.43
111221997--111222041
22
2.0
22
83
8
56
71
4
4
20
1.21
111229900--111230088
101
1.9
99
96
2
351
39
14
6
39
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111230295--111230343
24
2.0
24
96
0
89
34
2
24
38
1.67
111230299--111230350
24
2.2
24
85
0
68
40
3
23
32
1.72
111231416--111231465
25
2.0
24
85
11
66
44
10
6
40
1.63
111231572--111231632
16
3.8
16
72
10
52
52
1
1
44
1.20
111231576--111231661
38
2.4
36
82
9
95
53
1
4
40
1.29
111231676--111231752
37
2.1
37
83
9
95
54
2
1
41
1.22
111232445--111232489
10
4.5
10
88
5
65
22
6
2
68
1.24
111232638--111232684
20
2.4
19
86
10
67
19
17
2
61
1.44
111233710--111233740
16
1.9
16
93
0
53
77
6
6
9
1.12
111234083--111234179
23
4.2
23
72
7
72
27
25
18
27
1.98
111234471--111234497
4
6.8
4
100
0
54
74
0
0
25
0.83
111235630--111235659
13
2.3
13
94
0
51
63
10
0
26
1.26
111235785--111235913
39
3.3
40
76
7
131
55
4
5
34
1.44
111236412--111236462
23
2.2
23
89
0
75
3
0
25
70
1.04
111237289--111237350
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
111237250--111237407
87
1.8
84
91
4
262
38
22
12
27
1.89
111237319--111237440
57
2.2
55
88
5
174
41
18
12
27
1.86
111237680--111237869
72
2.6
72
85
4
256
35
24
14
25
1.94
111237800--111238105
116
2.6
116
95
0
551
37
23
14
24
1.92
111237821--111238018
53
3.5
53
70
19
168
37
22
14
25
1.92
111248489--111248552
25
2.5
25
73
16
60
60
6
3
29
1.36
111249779--111249813
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111250501--111250541
19
2.1
21
83
16
54
39
4
4
51
1.45
111256619--111256659
8
5.0
8
83
16
57
60
0
2
36
1.10
111259524--111259561
19
2.0
20
89
5
60
39
0
0
60
0.97
111261557--111261601
11
4.2
11
86
8
58
26
26
0
46
1.53
111261566--111261607
22
1.9
22
90
9
68
26
23
0
50
1.50
111263425--111263468
18
2.4
18
88
0
61
18
27
9
45
1.79
111263716--111263759
21
2.0
22
86
4
63
34
40
15
9
1.79
111263874--111264372
128
3.9
128
93
2
844
35
5
3
55
1.41
111263874--111264372
255
2.0
256
93
2
871
35
5
3
55
1.41
111266316--111266397
41
2.0
41
95
0
146
23
20
19
36
1.95
111267647--111267693
16
3.0
16
90
3
69
76
10
4
8
1.13
111281290--111281456
40
4.2
40
81
2
176
25
27
20
25
1.99
111281290--111281456
80
2.1
79
82
7
196
25
27
20
25
1.99
111282282--111282327
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
111283975--111284026
24
2.1
26
82
13
65
50
11
7
30
1.67
111286103--111286234
23
5.7
23
71
14
101
33
19
22
24
1.97
111286057--111286227
45
3.7
46
79
10
136
34
18
21
26
1.96
111299701--111299770
27
2.6
27
93
2
113
28
27
15
28
1.96
111299701--111299773
28
2.7
27
93
2
119
28
26
16
28
1.97
111310747--111310816
27
2.6
27
93
2
113
28
27
15
28
1.96
111310747--111310819
28
2.7
27
93
2
119
28
26
16
28
1.97
111316905--111317035
47
2.8
47
87
4
185
33
26
15
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111321025--111321097
6
11.8
6
72
16
60
49
15
17
17
1.80
111321025--111321097
31
2.4
31
90
0
110
49
15
17
17
1.80
111321216--111321275
27
2.3
26
82
2
75
35
16
23
25
1.95
111321272--111321305
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
111321336--111321387
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
111321624--111321818
27
7.2
27
85
0
210
41
6
21
30
1.77
111321624--111321818
54
3.6
54
83
2
248
41
6
21
30
1.77
111321624--111321808
81
2.3
81
85
4
255
42
5
20
30
1.76
111321825--111321962
27
5.2
26
75
10
102
28
9
21
40
1.84
111323454--111323596
71
2.0
71
95
0
259
41
21
8
27
1.82
111323808--111323932
46
2.6
47
81
9
139
35
16
24
23
1.95
111323793--111323932
23
5.9
23
75
9
104
32
19
24
23
1.97
111325735--111325946
40
5.3
40
80
5
234
25
26
23
25
2.00
111332546--111332684
74
1.9
74
86
1
199
34
17
20
27
1.95
111336302--111336437
29
4.7
29
86
3
157
24
30
15
29
1.95
111336277--111336436
58
2.8
58
81
0
176
23
33
15
27
1.95
111344113--111344247
29
4.7
29
86
5
157
24
31
15
28
1.96
111344088--111344246
57
2.8
58
81
0
176
23
33
15
27
1.95
111348037--111348280
40
6.2
40
80
8
241
25
22
26
25
2.00
111348079--111348264
77
2.4
80
84
8
217
24
23
27
23
2.00
111348037--111348280
79
3.1
76
77
12
219
25
22
26
25
2.00
111356074--111356224
80
1.9
80
83
2
196
26
23
25
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111356074--111356224
40
3.8
40
80
6
162
26
23
25
24
2.00
111356154--111356240
40
2.4
36
86
11
115
25
24
27
22
2.00
111359464--111359617
27
5.6
29
82
9
187
27
31
14
26
1.95
111359484--111359618
55
2.5
55
86
6
186
28
30
13
27
1.94
111367530--111367688
29
5.6
29
90
3
241
26
32
14
27
1.95
111367530--111367689
56
2.8
58
88
3
243
26
31
14
26
1.95
111374677--111374854
40
4.5
40
91
4
263
24
23
28
24
2.00
111382691--111382987
40
7.5
40
93
1
465
23
23
27
25
2.00
111387149--111387224
28
2.7
29
90
8
122
34
18
11
35
1.87
111387353--111387464
27
4.2
26
82
7
125
16
23
22
37
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770