Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  40  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11485908--11486040
18
7.5
18
88
5
200
39
11
12
36
1.79
11485899--11486040
35
4.0
35
95
2
239
38
10
13
37
1.79
11486517--11486582
17
3.9
17
71
23
59
34
1
0
63
1.04
11486559--11486607
26
1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
11489928--11489979
25
2.2
25
83
13
65
25
13
5
55
1.60
11499185--11499244
21
2.9
21
69
11
52
26
20
0
53
1.46
11502937--11502976
21
1.9
21
89
0
62
35
37
15
12
1.85
11504107--11504163
28
2.0
28
93
0
96
19
7
26
47
1.74
11505788--11505825
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
11507524--11507602
25
3.3
25
66
16
67
31
30
5
32
1.79
11507474--11507900
94
4.3
94
89
6
557
28
29
8
32
1.87
11507474--11507900
49
8.7
49
89
6
591
28
29
8
32
1.87
11507753--11507872
59
2.0
59
93
0
204
26
27
11
34
1.91
11507529--11507900
157
2.5
156
90
6
412
29
29
8
33
1.87
11512297--11512380
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
11518025--11518107
26
3.2
26
94
1
141
37
24
4
33
1.77
11519595--11519657
21
3.2
21
62
25
55
39
11
4
44
1.61
11519592--11519670
38
2.1
38
100
0
158
37
10
5
46
1.60
11520766--11520869
43
2.4
45
82
6
115
29
14
25
29
1.95
11520498--11521211
176
4.1
177
83
4
826
30
17
23
27
1.97
11520498--11521193
170
4.0
169
82
6
734
30
17
24
27
1.97
11523365--11523416
25
2.2
25
83
13
65
25
13
5
55
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11544399--11544479
32
2.5
32
84
6
101
38
16
18
27
1.92
11544774--11544812
21
1.9
20
89
5
60
2
43
23
30
1.67
11548960--11548990
15
2.1
15
93
0
53
19
16
6
58
1.59
11549328--11549990
132
5.0
131
76
5
541
28
19
16
35
1.93
11551985--11552040
26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
11556260--11556312
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
11557795--11557844
25
2.0
25
100
0
100
32
28
8
32
1.86
11564685--11564715
16
2.0
15
93
6
53
3
12
32
51
1.56
11565814--11565864
26
2.0
26
96
0
93
29
29
7
33
1.85
11566202--11566233
2
16.5
2
93
6
57
50
0
0
50
1.00
11568356--11568631
46
6.0
46
93
0
426
39
13
23
22
1.90
11568357--11568684
46
7.0
46
90
2
361
40
13
23
22
1.89
11568361--11568679
138
2.3
138
87
3
433
41
13
23
21
1.89
11573176--11573313
9
15.3
9
70
18
74
36
1
15
46
1.55
11573213--11573313
18
5.5
18
74
13
98
38
1
14
44
1.57
11573213--11573319
9
11.7
9
73
13
85
39
1
14
43
1.57
11573512--11573536
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
11573783--11573807
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
11573879--11573903
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
11573497--11573961
96
5.0
96
88
7
705
53
4
6
34
1.49
11574672--11574726
8
7.0
8
83
4
67
34
29
1
34
1.68
11575329--11575382
3
18.0
3
100
0
108
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11576678--11576967
158
1.8
157
84
6
399
31
26
11
31
1.92
11577917--11577961
14
3.2
14
83
0
63
48
28
0
22
1.50
11578378--11578472
40
2.4
40
80
7
113
25
26
20
28
1.99
11578456--11578530
39
1.9
40
94
2
134
13
18
24
44
1.85
11581181--11581223
11
4.0
11
84
6
61
27
6
46
18
1.75
11585218--11585262
18
2.5
18
88
0
63
40
11
17
31
1.85
11585800--11585847
11
4.5
11
86
5
71
29
6
45
18
1.74
11586065--11586089
13
1.9
13
100
0
50
28
0
0
72
0.86
11586469--11586559
31
3.0
30
82
6
94
39
6
8
45
1.61
11587552--11587584
12
2.5
13
85
14
50
42
39
6
12
1.67
11587629--11587717
38
2.3
38
94
0
151
17
51
11
19
1.75
11588772--11588813
22
1.9
22
90
0
66
23
7
4
64
1.38
11600885--11601001
44
2.6
45
78
6
132
35
22
21
20
1.96
11600828--11601036
88
2.4
86
81
7
249
36
22
21
20
1.95
11602085--11602174
38
2.4
38
94
1
155
17
50
11
21
1.77
11603238--11603279
22
1.9
22
90
0
66
23
7
4
64
1.38
11604939--11604973
2
17.5
2
93
0
61
51
0
0
48
1.00
11611125--11611149
12
2.1
12
100
0
50
84
0
0
16
0.63
11614402--11614485
26
3.2
26
94
0
141
35
5
22
35
1.79
11615971--11616023
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
11617094--11617144
24
2.1
24
96
0
93
15
35
27
21
1.94
11618740--11618872
18
7.5
18
86
5
191
38
11
12
37
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11618731--11618872
35
4.0
35
93
2
230
38
10
13
38
1.79
11619381--11619429
26
1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
11622503--11622532
14
2.1
14
93
0
51
43
6
3
46
1.46
11625149--11625199
10
4.9
10
77
17
59
86
0
11
1
0.66
11625151--11625203
12
4.1
12
77
15
52
83
0
13
3
0.79
11625148--11625199
15
3.3
15
80
17
61
86
0
11
1
0.65
11625162--11625205
13
3.2
14
84
15
65
79
0
15
4
0.89
11625149--11625203
26
2.0
28
89
6
87
83
0
12
3
0.77
11626077--11626255
44
4.1
44
77
9
195
30
15
25
29
1.95
11626247--11626837
118
5.0
119
94
1
999
33
17
18
30
1.94
11626247--11626837
237
2.5
238
93
1
1008
33
17
18
30
1.94
11626761--11627112
83
4.2
83
93
1
580
32
20
19
27
1.97
11627507--11627639
18
7.5
18
88
5
200
39
11
12
36
1.79
11627498--11627639
35
4.0
35
95
2
239
38
10
13
37
1.79
11628095--11628169
34
2.2
34
79
11
84
36
6
0
57
1.25
11628146--11628195
26
1.9
26
83
0
64
36
4
0
60
1.16
11631051--11631160
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
11632639--11632690
25
2.0
26
85
10
72
36
23
15
25
1.93
11634006--11634052
16
2.9
16
81
9
51
63
0
4
31
1.13
11636138--11636183
20
2.3
20
82
14
60
28
28
17
26
1.98
11636150--11636193
19
2.2
20
84
4
54
34
25
18
22
1.96
11636793--11636824
8
4.0
8
100
0
64
0
25
25
50
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11637497--11637534
18
2.2
18
86
13
53
73
0
15
10
1.09
11639001--11639080
19
4.3
19
90
6
128
35
10
17
37
1.83
11642321--11642365
20
2.3
20
88
3
65
28
17
26
26
1.98
11642394--11642495
27
3.5
28
72
23
84
24
19
29
26
1.98
11642389--11642529
61
2.3
61
80
10
155
27
19
26
26
1.99
11643616--11643656
2
20.5
2
100
0
82
51
0
0
48
1.00
11644460--11644615
47
3.4
45
84
7
181
27
28
9
33
1.88
11645789--11645821
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
11650871--11651209
127
2.7
127
83
4
409
28
16
17
36
1.92
11655501--11655592
24
3.8
24
84
4
105
34
4
36
23
1.75
11656347--11656376
8
3.8
8
90
0
51
50
23
23
3
1.64
11656625--11656745
28
4.3
28
95
0
215
34
26
8
30
1.86
11656851--11656940
28
3.2
27
79
7
101
20
24
24
31
1.98
11656851--11656940
27
3.2
28
78
7
103
20
24
24
31
1.98
11658035--11658068
10
3.3
10
84
8
50
29
8
8
52
1.62
11663252--11663343
24
3.8
24
78
4
87
36
5
34
22
1.78
11664563--11664655
28
3.3
28
96
0
168
34
26
7
31
1.84
11664771--11664842
27
2.6
27
82
4
90
22
26
19
31
1.97
11664771--11664861
27
3.2
28
78
4
67
21
26
20
30
1.98
11673915--11674081
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
11681917--11682066
40
3.8
40
78
8
139
26
22
28
23
1.99
11697565--11697692
27
4.7
27
86
1
159
26
10
22
40
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11697565--11697718
54
2.9
54
80
3
141
26
10
22
40
1.86
11701510--11701609
38
2.6
39
93
1
175
14
25
23
38
1.92
11701536--11701601
19
3.4
19
74
17
73
18
21
19
40
1.91
11705026--11705208
40
4.6
40
79
6
185
24
27
22
26
2.00
11713063--11713244
40
4.7
40
82
10
207
25
27
23
24
2.00
11713065--11713240
77
2.3
79
81
8
200
25
27
22
25
2.00
11718161--11718206
22
2.0
23
83
8
58
69
15
15
0
1.19
11720258--11720578
131
2.5
128
85
4
423
29
16
18
36
1.92
11722067--11722112
19
2.4
19
85
7
58
19
23
13
43
1.86
11722889--11723180
86
3.3
86
80
5
311
31
20
24
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770