Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  545  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169513663--169513733
24
3.2
24
61
19
62
39
15
15
29
1.88
169513647--169513733
43
2.0
43
100
0
174
36
16
17
29
1.91
169517057--169517224
40
4.2
40
80
12
184
23
22
28
26
1.99
169517057--169517224
80
2.1
79
87
4
239
23
22
28
26
1.99
169531272--169531974
44
16.2
44
86
3
926
30
16
31
22
1.96
169531272--169531964
260
2.7
260
89
0
1052
29
16
31
22
1.96
169532638--169532673
5
6.8
5
87
12
54
5
16
0
77
0.94
169532640--169532671
11
2.9
11
100
0
64
6
18
0
75
1.01
169533511--169533562
24
2.2
24
82
0
59
25
3
9
61
1.44
169533693--169533742
2
25.0
2
91
0
82
46
0
4
50
1.20
169533803--169533879
11
6.9
11
77
12
68
37
1
2
58
1.20
169533803--169533879
27
2.8
29
81
14
83
37
1
2
58
1.20
169533803--169533888
23
3.5
23
75
15
66
37
2
2
58
1.24
169534029--169534063
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
169534075--169534151
3
25.0
3
84
10
102
31
3
1
63
1.20
169535913--169536058
40
3.7
40
88
5
197
26
28
21
23
1.99
169540990--169541027
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
169551439--169551481
13
3.3
13
90
6
61
9
20
53
16
1.70
169553247--169553364
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
169553215--169553378
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
169560824--169560941
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
169560792--169560955
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169566993--169567141
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
169567034--169567141
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
169570892--169570998
38
2.8
38
81
0
133
14
16
29
38
1.89
169578432--169578457
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
169578529--169578568
18
2.2
18
86
0
53
55
5
7
32
1.50
169579715--169579749
17
2.1
17
94
0
61
8
0
45
45
1.34
169580094--169580293
44
4.5
44
76
2
150
27
21
18
33
1.96
169580099--169580351
133
1.9
133
80
3
294
28
19
17
34
1.95
169584312--169584678
27
13.6
27
86
2
441
27
21
9
41
1.84
169584387--169584722
81
4.1
81
82
1
226
28
22
8
40
1.84
169586008--169586084
9
7.9
9
72
16
64
35
9
20
35
1.85
169586017--169586088
11
7.1
11
70
17
66
36
12
19
31
1.89
169586006--169586088
20
4.2
20
96
0
157
36
12
19
32
1.88
169586143--169586283
24
6.0
23
88
2
192
29
22
19
27
1.98
169586144--169586285
47
3.0
46
87
2
194
29
22
19
28
1.98
169586143--169586283
71
2.0
71
91
0
228
29
22
19
27
1.98
169587687--169587815
40
3.3
39
82
7
111
23
26
25
24
2.00
169587722--169587868
78
1.9
80
85
5
210
24
27
23
24
2.00
169587703--169587868
40
4.2
37
77
9
125
24
27
24
24
2.00
169597226--169597356
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
169597226--169597356
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
169605736--169605901
40
4.2
39
81
3
172
24
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169605752--169605901
79
1.9
79
84
5
205
24
27
22
26
2.00
169613729--169613894
40
4.2
39
81
3
172
24
27
22
25
2.00
169613745--169613894
79
1.9
79
84
5
205
24
27
22
26
2.00
169617558--169617699
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
169617597--169617725
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
169622121--169622372
133
1.9
133
99
0
495
19
10
18
51
1.74
169624435--169624474
21
1.9
21
94
0
71
30
10
12
47
1.74
169624057--169625287
458
2.7
459
99
0
2439
35
11
10
42
1.77
169624893--169624932
21
1.9
21
94
0
71
30
10
12
47
1.74
169631072--169631116
21
2.1
21
87
0
63
26
13
55
4
1.57
169631413--169631571
44
3.7
44
86
4
191
30
21
20
27
1.98
169631412--169631641
43
5.3
42
81
3
192
29
20
21
28
1.98
169634148--169634208
27
2.5
23
78
17
61
52
8
0
39
1.31
169634264--169634307
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
169636439--169636569
65
2.0
65
95
0
235
25
15
17
41
1.89
169639798--169639965
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
169651667--169651697
15
2.1
15
100
0
62
6
38
0
54
1.26
169651741--169651790
15
3.5
14
79
15
50
42
8
24
26
1.82
169656176--169656326
38
3.9
39
92
4
236
30
17
3
48
1.64
169656341--169656384
22
2.0
22
82
8
54
43
4
4
47
1.44
169657787--169657819
15
2.2
15
89
10
50
57
6
6
30
1.47
169658141--169658181
2
21.0
2
95
5
75
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169660538--169660579
22
1.9
22
85
9
59
23
52
9
14
1.71
169660654--169660722
21
3.2
21
83
8
68
10
1
28
59
1.39
169660645--169660757
23
4.9
23
73
21
85
14
1
28
55
1.49
169660684--169660724
21
2.0
21
95
4
75
4
0
26
68
1.10
169661055--169661137
3
27.3
3
73
20
59
30
3
1
65
1.17
169661058--169661137
12
6.8
12
75
12
76
30
3
1
65
1.18
169662735--169662841
39
2.7
39
76
2
108
55
3
5
35
1.41
169663207--169663233
14
1.9
14
100
0
54
7
7
0
85
0.75
169663301--169663361
27
2.2
28
88
5
88
6
3
13
77
1.09
169663294--169663361
29
2.3
30
84
2
84
7
2
14
75
1.14
169664124--169664532
72
5.6
72
78
8
400
32
21
16
30
1.95
169664178--169664532
143
2.5
138
80
7
413
32
21
17
29
1.96
169673000--169673035
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
169676985--169677091
39
2.7
39
76
2
108
55
3
5
35
1.41
169677543--169677598
30
1.9
30
85
7
80
5
5
8
80
1.02
169677547--169677618
37
1.9
35
89
10
108
4
4
11
80
0.99
169679174--169679330
39
4.0
39
95
0
260
29
20
3
46
1.66
169679342--169679387
23
2.0
23
91
8
76
41
6
4
47
1.49
169679947--169679988
22
2.0
22
90
4
68
35
40
4
19
1.72
169680426--169680450
13
1.9
13
100
0
50
8
28
16
48
1.74
169680449--169680562
44
2.6
44
91
0
183
30
26
14
28
1.95
169680537--169680761
44
5.1
44
73
10
147
24
23
19
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169680493--169680764
133
2.1
131
89
1
409
25
23
17
32
1.97
169680435--169680714
88
3.2
86
72
13
241
25
25
17
31
1.97
169680749--169681948
205
5.9
205
91
2
1847
29
22
17
30
1.97
169696138--169696305
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
169704023--169704062
19
2.1
19
100
0
80
40
10
20
30
1.85
169717389--169717561
47
3.7
47
93
0
283
28
31
6
32
1.84
169717464--169717539
22
3.3
22
67
16
64
27
31
10
30
1.90
169723482--169723694
95
2.4
85
80
14
273
29
23
15
31
1.95
169723516--169723744
48
4.8
48
86
2
311
31
22
14
31
1.94
169723525--169723733
95
2.2
95
96
0
382
31
22
14
31
1.94
169730459--169730528
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
169739026--169739126
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
169748327--169748405
29
2.7
29
84
7
99
26
32
15
25
1.95
169753224--169753307
26
3.3
26
85
8
113
25
23
21
29
1.99
169753357--169753412
11
5.5
11
71
16
57
32
19
10
37
1.86
169753369--169753431
9
6.6
9
73
20
56
38
20
6
34
1.78
169753357--169753413
20
2.8
20
97
0
105
33
19
10
36
1.86
169753369--169753433
5
13.4
5
75
18
66
36
21
6
35
1.79
169761250--169761385
26
5.3
26
84
2
161
26
20
21
31
1.98
169761250--169761385
52
2.7
52
87
3
188
26
20
21
31
1.98
169761435--169761509
20
3.8
20
89
6
102
36
20
8
36
1.82
169761452--169761490
11
3.7
11
80
13
55
33
20
10
35
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169792069--169792299
39
6.0
39
93
2
403
23
29
25
21
1.99
169792069--169792299
76
3.0
77
94
2
410
23
29
25
21
1.99
169792069--169792299
115
2.0
116
93
1
401
23
29
25
21
1.99
169793881--169793935
21
2.6
21
94
0
92
23
27
18
30
1.97
169800512--169800623
54
2.1
54
88
3
163
36
22
23
17
1.95
169800512--169800623
27
4.2
26
84
5
125
36
22
23
17
1.95
169801013--169801042
8
3.8
8
90
0
51
3
26
26
43
1.70
169802221--169802277
26
2.2
26
100
0
114
35
26
7
31
1.83
169802408--169802443
14
2.6
14
100
0
72
19
27
16
36
1.93
169805406--169805587
40
4.6
40
83
4
181
23
26
22
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770